Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.121878 Tpm1tropomyosin 1, alpha 9  9 40.0 cM  22003 
 Mm.121878 AI854628expressed sequence AI854628 9    102625 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 117 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGAACAGAAC (2)
AGATGTGTTG (2)
CCAAAAAAAA (3)
GTGAAACCCT (2)
GTTTAAATTT
TCAGCTGGGG (2)
TTTGTTGCTT
37.30.0373
Cb medulloblastomaAGAACAGAAC (2)
AGATGTGTTG (2)
CCAAAAAAAA (3)
CTTACCGTGA (2)
GTGAAACCCT (2)
TCAGGGTAGA (2)
106.30.1063
P8 GC+1d cultureAAAGTCATTG (2)
CCAAAAAAAA (3)
CCAAAGGAAG (2)
CCCGTAGCCC (2)
GCTGGAGGCT
GTGAAACCCT (2)
GTTTAAATTT
GTTTTTTTAA (2)
TCCAGAAAAT (2)
TTTGTTGCTT
64.80.0648
P8 GC+SHH+1d cultureAAAGTCCTTT
CCAAAAAAAA (3)
CCCGTAGCCC (2)
CTTACCGTGA (2)
GAAGTCATTG
GCTGGAGGCT
GGGTGGCTCA
GTGAAACCCT (2)
TCAGCTGGGG (2)
TGCTGGCTCT
TTTGTTGCTT
540.054
3T3 fibroblastsCCCGTAGCCC (2)
GAAGTCATTG
TCAGCTGGGG (2)
185.80.1858
E15 cortexAAAGTCATTG (2)
CCAAAAAAAA (3)
14.80.0148
P1 cortexAGATGTGTTG (2)
CCAAAAAAAA (3)
CCAAAGGAAG (2)
CCCGTAGCCC (2)
TCCAGAAAAT (2)
72.60.0726
HypothalamusAGAACAGAAC (2)
AGATGTGTTG (2)
CCAAAAAAAA (3)
GACGCCATCA (3)
TTTGTTGCTT
48.80.0488
E12.5 retinaAAAGTCCTTT
CCAAAAAAAA (3)
CCCGTAGCCC (2)
TTTGTTGCTT
22.60.0226
E14.5 retinaCCAAAAAAAA (3)
GAAGTCATTG
GTGAAACCCT (2)
GTTTAAATTT
25.40.0254
E16.5 retinaCCAAAAAAAA (3)
CCAAAGGAAG (2)
CCCGTAGCCC (2)
CTACAGACCA (2)
25.30.0253
E18.5 retinaCCAAAAAAAA (3)
GGGTGGCTCA
TGCTGGCTCT
TTTGTTGCTT
43.60.0436
P0.5 retinaCCAAAAAAAA (3)
CCCGTAGCCC (2)
GAAGTCATTG
GTTTTTTTAA (2)
TGCTGGCTCT
43.20.0432
P2.5 retinaAAAGTCCTTT
AGATGTGTTG (2)
CCAAAAAAAA (3)
CCCGTAGCCC (2)
GAAGTCATTG
GCTGGAGGCT
TTTGTTGCTT
56.50.0565
P4.5 retinaCCAAAAAAAA (3)
CCCGTAGCCC (2)
CTACAGACCA (2)
GGGTGGCTCA
GTTTTTTTAA (2)
TTTGTTGCTT
53.50.0535
P6.5 retinaAAAGTCCTTT
AGATGTGTTG (2)
CCAAAAAAAA (3)
CCCGTAGCCC (2)
CTTACCGTGA (2)
GTTTTTTTAA (2)
TTTGTTGCTT
51.80.0518
P10.5 crx- retinaAAAGTCCTTT
AGATGTGTTG (2)
CCAAAAAAAA (3)
GAAGTCATTG
TCAGGGTAGA (2)
TTTGTTGCTT
37.40.0374
P10.5 crx+ retinaAAAGTCCTTT
AGAACAGAAC (2)
CCAAAAAAAA (3)
GAAGTCATTG
GGGTGGCTCA
TCAGGGTAGA (2)
TTTGTTGCTT
63.30.0633
Adult retinalAAAGTCATTG (2)
AAAGTCCTTT
CCAAAAAAAA (3)
GAAGTCATTG
GCTGGAGGCT
GGGTGGCTCA
GTTTTTTTAA (2)
TTTGTTGCTT
52.10.0521
ONLAAAGTCCTTT
CCAAAAAAAA (3)
GGGTGGCTCA
GTGAAACCCT (2)
GTTTTTTTAA (2)
TCCAGAAAAT (2)
19.10.0191