Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.150231 4930524J08RikRIKEN cDNA 4930524J08 gene 5    75129 
 Mm.150231 C230004L04hypothetical protein C230004L04 5    330135 
 Mm.150231 Hnrpdheterogeneous nuclear ribonucleoprotein D 5    11991 
 Gene Ontology chromosome, telomeric region | DNA binding | nucleic acid binding | nucleus | regulation of transcription, DNA-dependent | ribonucleoprotein complex | RNA binding | telomerase-dependent telomere maintenance
 Human Homolog HNRPD[heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D (AU-rich element RNA binding protein 1, 37kDa)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 118 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATGTAGTAGT (4)
TCAAAGGAAC (5)
TCATAGAAAC (4)
TGTTTGTTCT (2)
750.075
Cb medulloblastomaAATCATCTTT (3)
ATGTAGTAGT (4)
GAAACTGCTT (3)
TCATAGAAAC (4)
34.60.0346
P8 GC+1d cultureATGTAGTAGT (4)
GAAACTGCTT (3)
GCCTGCCCCG (4)
GGTACTTTTA (4)
TCAAAGGAAC (5)
TCATAGAAAC (4)
TGTTTGTTCT (2)
68.40.0684
P8 GC+SHH+1d cultureATGTAATAGT
ATGTAGTAGT (4)
GAAACTGCTT (3)
GGTACTTTTA (4)
GTTAAAAATG (3)
TCAAAGGAAC (5)
TCATAGAAAC (4)
66.70.0667
3T3 fibroblastsATGTAGTAGT (4)
GTCATAGCTG (2)
TCATAGAAAC (4)
31.50.0315
E15 cortexATGTAGTAGT (4)
GCCTGCCCCG (4)
GTCATAGCTG (2)
TCATAGAAAC (4)
39.50.0395
P1 cortexATGTAGTAGT (4)
TCATAGAAAC (4)
TGTTTGTTCT (2)
27.20.0272
HypothalamusATGTAGTAGT (4)
GAAACTGCTT (3)
TCAAAGGAAC (5)
TCATAGAAAC (4)
30.80.0308
E12.5 retinaAATCATCTTT (3)
ATGTAGTAGT (4)
GAAACTGCTT (3)
GGTACTTTTA (4)
GTTAAAAATG (3)
TCAAAGGAAC (5)
TCATAGAAAC (4)
88.30.0883
E14.5 retinaATGTAGTAGT (4)
TCATAGAAAC (4)
TGTTTGTTCT (2)
67.40.0674
E16.5 retinaAAAACAAAAG (4)
ATGTAGTAGT (4)
GAAACTGCTT (3)
GCCTGCCCCG (4)
GGTACTTTTA (4)
TCAAAGGAAC (5)
TCATAGAAAC (4)
66.90.0669
E18.5 retinaATGTAATAGT
ATGTAGTAGT (4)
GAAACTGCTT (3)
GCCTGCCCCG (4)
TCATAGAAAC (4)
TGCACCACTG (3)
TGTTTGTTCT (2)
47.20.0472
P0.5 retinaATGTAATAGT
ATGTAGTAGT (4)
GAAACTGCTT (3)
GCCTGCCCCG (4)
GGTACTTTTA (4)
GTCATAGCTG (2)
TCAAAGGAAC (5)
TCATAGAAAC (4)
70.70.0707
P2.5 retinaAATCATCTTT (3)
ATGTAATAGT
ATGTAGTAGT (4)
GAAACTGCTT (3)
GCCTGCCCCG (4)
GTCATAGCTG (2)
GTTAAAAATG (3)
TCAAAGGAAC (5)
TCATAGAAAC (4)
81.10.0811
P4.5 retinaATGTAGTAGT (4)
GAAACTGCTT (3)
GCCTGCCCCG (4)
GGTACTTTTA (4)
GTCATAGCTG (2)
TCAAAGGAAC (5)
TCATAGAAAC (4)
TGTTTGTTCT (2)
61.50.0615
P6.5 retinaATGTAGTAGT (4)
GAAACTGCTT (3)
GCCTGCCCCG (4)
GTCATAGCTG (2)
TCAAAGGAAC (5)
TCATAGAAAC (4)
TGTTTGTTCT (2)
65.10.0651
P10.5 crx- retinaAAAACAAAAG (4)
ATGTAGTAGT (4)
GAAACTGCTT (3)
TCAAAGGAAC (5)
TCATAGAAAC (4)
TGTTTGTTCT (2)
48.40.0484
P10.5 crx+ retinaATGTAGTAGT (4)
GAAACTGCTT (3)
GGTACTTTTA (4)
TCAAAGGAAC (5)
TCATAGAAAC (4)
TGCACCACTG (3)
TGTTTGTTCT (2)
36.40.0364
Adult retinalATGTAGTAGT (4)
GAAACTGCTT (3)
GCCTGCCCCG (4)
GTCATAGCTG (2)
TCAAAGGAAC (5)
TCATAGAAAC (4)
TGTTTGTTCT (2)
24.30.0243
ONLAAAACAAAAG (4)
ATGTAGTAGT (4)
GAAACTGCTT (3)
GCCTGCCCCG (4)
GTCATAGCTG (2)
TCATAGAAAC (4)
30.50.0305