Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.158700 AA986891expressed sequence AA986891 13    105108 
 Mm.158700 Cspg2chondroitin sulfate proteoglycan 2 13  13 55.0 cM  13003 
 Gene Ontology calcium ion binding | cell adhesion | extracellular matrix | hyaluronic acid binding | sugar binding
 Human Homolog CSPG2[chondroitin sulfate proteoglycan 2 (versican)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 86 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAACATTCAAA (2)
AATAAAGATA
GATTCCTCAC
GATTTCTGGA (2)
TATAGTGTAA (2)
TATGAATGCT (2)
37.50.0375
Cb medulloblastomaAATAAAGATA
GATTCCTCAC
TCCTCAGCTG (3)
23.10.0231
P8 GC+1d cultureAACATTCAAA (2)
AATAAAGATA
GAATTTTGAA (2)
GATTCCTCAC
TATAGTGTAA (2)
TATGAATGCT (2)
TCCTCAGCTG (3)
24.90.0249
P8 GC+SHH+1d cultureAACATTCAAA (2)
AATAAAGATA
GAATTTTGAA (2)
GATTCCTCAC
TATAGTGTAA (2)
TCCTCAGCTG (3)
62.10.0621
3T3 fibroblastsAACATTCAAA (2)
TATGAATGCT (2)
10.50.0105
E15 cortexGATTCCTCAC
TATAGTGTAA (2)
9.80.0098
P1 cortexTATAGTGTAA (2)
TATGAATGCT (2)
90.009
HypothalamusAACACACACA (5)
AACATACAAA (2)
AACATTCAAA (2)
AATAAAGATA
GAATTTTGAA (2)
GATTCCTCAC
GATTTCTGGA (2)
25.20.0252
E12.5 retinaAACATTCAAA (2)
AATAAAGATA
GATTCCTCAC
TATAGTGTAA (2)
13.20.0132
E14.5 retinaAACACACACA (5)
AATAAAGATA
GATTCCTCAC
TATGAATGCT (2)
12.70.0127
E16.5 retinaAACACACACA (5)
AATAAAGATA
GAATTTTGAA (2)
GATTCCTCAC
TCCTCAGCTG (3)
180.018
E18.5 retinaAATAAAGATA
GAATTTTGAA (2)
GATTCCTCAC
TATAGTGTAA (2)
TATGAATGCT (2)
16.30.0163
P0.5 retinaAACATACAAA (2)
GATTCCTCAC
TATGAATGCT (2)
TCCTCAGCTG (3)
15.80.0158
P2.5 retinaAATAAAGATA
GATTCCTCAC
21.10.0211
P4.5 retinaAACACACACA (5)
AACATACAAA (2)
AATAAAGATA
GATTCCTCAC
TATGAATGCT (2)
TCCTCAGCTG (3)
25.80.0258
P6.5 retinaAACACACACA (5)
AATAAAGATA
GATTCCTCAC
TCCTCAGCTG (3)
13.30.0133
P10.5 crx- retinaAATAAAGATA
GAATTTTGAA (2)
GATTCCTCAC
TATAGTGTAA (2)
TCCTCAGCTG (3)
11.30.0113
P10.5 crx+ retinaAACACACACA (5)
AACATTCAAA (2)
GAATTTTGAA (2)
GATTCCTCAC
17.20.0172
Adult retinalAACACACACA (5)
AATAAAGATA
GAATTTTGAA (2)
TCCTCAGCTG (3)
18.60.0186
ONLAACACACACA (5)
AACATACAAA (2)
TATGAATGCT (2)
TCCTCAGCTG (3)
17.20.0172