Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.159552	Amotl1	angiomotin-like 1	9		75723
Gene Ontology	biological_process unknown | molecular_function unknown | tight junction
Human Homolog	AMOTL1[angiomotin like 1]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 96 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAACCAAA CACACACACA (2) CATACATACT (2) GAGCTGGTGA (2) GCTTCCCTCC TTGACTTTCT (2) 22.7 0.0227 Cb medulloblastoma AAAAACCAAA AACCTGCTGG (3) CACACACACA (2) CATACATACT (2) GAGCTGGTGA (2) 48.5 0.0485 P8 GC+1d culture CACACACACA (2) CACACGCACA (2) CATACATACT (2) GAGCTGGTGA (2) 21.6 0.0216 P8 GC+SHH+1d culture CACACACACA (2) CCCCCAGCAG (2) CTCTGATGTG (2) GAGCTGGTGA (2) 17.6 0.0176 3T3 fibroblasts CACACACACA (2) CATACATACT (2) TGTAACCTTT 28 0.028 E15 cortex AAAAACCAAA CACACACACA (2) GAGCTGGTGA (2) GCTTCCCTCC 19.6 0.0196 P1 cortex AAAAACCAAA CACACACACA (2) CTCTGATGTG (2) 36.3 0.0363 Hypothalamus AACCTGCTGG (3) CACACACACA (2) CACACGCACA (2) CTCTGATGTG (2) GAGCTGGTGA (2) TGTAACCTTT 110.4 0.1104 E12.5 retina AAAAACCAAA CACACACACA (2) CCCCCAGCCA (3) CTCTGATGTG (2) GAGCTGGTGA (2) 20.8 0.0208 E14.5 retina CACACACACA (2) CATACATACT (2) GAGCTGGTGA (2) 21.8 0.0218 E16.5 retina AAAAACCAAA CACACACACA (2) CCCCCAGCCA (3) CTCTGATGTG (2) GAGCTGGTGA (2) 27.1 0.0271 E18.5 retina AAAAACCAAA CACACACACA (2) CCCCCAGCCA (3) GAGCTGGTGA (2) 12.7 0.0127 P0.5 retina CACACACACA (2) CACACGCACA (2) CCCCCAGCCA (3) CTCTGATGTG (2) GAGCTGGTGA (2) TGTAACCATT (3) TGTAACCTTT 29.7 0.0297 P2.5 retina CACACACACA (2) CTCTGATGTG (2) GAGCTGGTGA (2) 31.6 0.0316 P4.5 retina AAAAACCAAA CACACACACA (2) CTCTGATGTG (2) GAGCTGGTGA (2) TGTAACCTTT TTGACTTTCT (2) 29.8 0.0298 P6.5 retina AACCTGCTGG (3) CACACACACA (2) CTCTGATGTG (2) GAGCTGGTGA (2) TGGAGTCTGT 26.7 0.0267 P10.5 crx- retina AAAAACCAAA AACCTGCTGG (3) CACACACACA (2) CTCTGATGTG (2) GAGCTGGTGA (2) 27.9 0.0279 P10.5 crx+ retina AAAAACCAAA CACACACACA (2) CACACGCACA (2) CTCTGATGTG (2) GAGCTGGTGA (2) 21.1 0.0211 Adult retinal AACCTGCTGG (3) CACACACACA (2) CACACGCACA (2) CCCCCAGCAG (2) CTCTGATGTG (2) GCTTCCCTCC TGGAGTCTGT TGTAACCATT (3) 41 0.041 ONL CACACACACA (2) CACACGCACA (2) CTCTGATGTG (2) GAGCTGGTGA (2) TGGAGTCTGT 38.3 0.0383