| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | CCTTTAATCC (3) GAAGTTTAAA TAGTTCCTAT (6)
| 68.5 | 0.0685 |
| Cb medulloblastoma | CCTTTAATCC (3)
| 41.6 | 0.0416 |
| P8 GC+1d culture | CCTTTAATCC (3) TAGTTCCTAT (6)
| 38.8 | 0.0388 |
| P8 GC+SHH+1d culture | CCTTTAATCC (3) TAGTTCCTAT (6)
| 36.3 | 0.0363 |
| 3T3 fibroblasts | CCTTTAATCC (3)
| 70.1 | 0.0701 |
| E15 cortex | CCTTTAATCC (3)
| 54.4 | 0.0544 |
| P1 cortex | CCTTTAATCC (3)
| 154.5 | 0.1545 |
| Hypothalamus | CCTTTAATCC (3)
| 19.9 | 0.0199 |
| E12.5 retina | CCTTTAATCC (3) TAGTTCCTAT (6)
| 84.5 | 0.0845 |
| E14.5 retina | CCTTTAATCC (3) TAGTTCCTAT (6)
| 123.9 | 0.1239 |
| E16.5 retina | CCTTTAATCC (3) TAGTTCCTAT (6)
| 83.3 | 0.0833 |
| E18.5 retina | CCTTTAATCC (3)
| 23.6 | 0.0236 |
| P0.5 retina | CCTTTAATCC (3) TAGTTCCTAT (6)
| 76.5 | 0.0765 |
| P2.5 retina | CCTTTAATCC (3) TAGTTCCTAT (6)
| 73.9 | 0.0739 |
| P4.5 retina | CCTTTAATCC (3) TAGTTCCTAT (6)
| 49.5 | 0.0495 |
| P6.5 retina | CCTTTAATCC (3) TAGTTCCTAT (6)
| 78.3 | 0.0783 |
| P10.5 crx- retina | CCTTTAATCC (3) GAAGTTTAAA TAGTTCCTAT (6)
| 70.7 | 0.0707 |
| P10.5 crx+ retina | CCTTTAATCC (3) TAGTTCCTAT (6)
| 42.2 | 0.0422 |
| Adult retinal | CCTTTAATCC (3)
| 129.6 | 0.1296 |
| ONL | CCTTTAATCC (3)
| 84.3 | 0.0843 |