Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.172411	Txnl4	thioredoxin-like 4	18		27366
Mm.172411	D18Wsu98e	DNA segment, Chr 18, Wayne State University 98, expressed	18	18 50.0 cM	28062
Gene Ontology	transferase activity
Human Homolog	MGC10646[hypothetical protein MGC10646]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 202 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAGAGCAACC (2) CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GAAAACAAAC (4) GCCGAGGAAG GCCTCTCTTG (3) GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GCTGCTGCCC (2) GGGAAAAAAA (5) TCAGGAAGAG (3) TCTGTGTCCT (3) 105.8 0.1058 Cb medulloblastoma CAGCTGCACC CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GAAAACAAAC (4) GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GGACCAGGGT GGGAAAAAAA (5) TCTGTGTCCT (3) 189.5 0.1895 P8 GC+1d culture CAGAGCTGCA CAGCTGCACC CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GAAAACAAAC (4) GCCGAGGAAG GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GCTGCTGCCC (2) GGGAAAAAAA (5) TCTGTGTCCT (3) TGGCCTGTGC (2) 79.6 0.0796 P8 GC+SHH+1d culture CAGAGCTGCA CAGCTGCACC CATCTCCATC (2) CATTTCCATC (4) CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GCCGAGGAAG GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GGGAAAAAAA (5) GTGGTGCAAG (3) TCTGTGTCCT (3) TGGCCTGTGC (2) TTCAGGGAAA 78.6 0.0786 3T3 fibroblasts CAGCTGCACC CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GCCGAGGAAG GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GTGGTGCAAG (3) 133.1 0.1331 E15 cortex CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GCCGAGGAAG GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) TCTGTGTCCT (3) 128.5 0.1285 P1 cortex AGAACCTGGC (4) CCTTTAATCC (3) GCCTCTGCAT (2) GGGAAAAAAA (5) TCTGTGTCCT (3) 186.2 0.1862 Hypothalamus CAGAGCTGCA CAGCACTGGA (2) CCTTTAATCC (3) GAAAACAAAC (4) GAGGCACACC (2) GCCTCTCTTG (3) GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GCTCTCAACC (2) GCTGCTGCCC (2) GGACCAGGGT GGGAAAAAAA (5) TCTGTGTCCT (3) 119.5 0.1195 E12.5 retina AAGAGCAACC (2) CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GTGGTGCAAG (3) TCTGTGTCCT (3) 125.8 0.1258 E14.5 retina AAGAGCAACC (2) CAGAGCTGCA CATCTCCATC (2) CATTTCCATC (4) CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GCCGAGGAAG GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GGGAAAAAAA (5) GTGGTGCAAG (3) TCAGGAAGAG (3) TCAGGGAAGA (2) TCTGTGTCCT (3) 185.7 0.1857 E16.5 retina AAGAGCAACC (2) CAGCACTGGA (2) CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GAGGCACACC (2) GCCGAGGAAG GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GCTCTCAACC (2) GGGAAAAAAA (5) TCAGGAAGAG (3) TCTGTGTCCT (3) 146.5 0.1465 E18.5 retina AAGAGCAACC (2) CAGCTGCACC CCTTTAATCC (3) GCCGAGGAAG GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GGGAAAAAAA (5) TCTGTGTCCT (3) 83.5 0.0835 P0.5 retina AAGAGCAACC (2) CAGCTGCACC CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GCCGAGGAAG GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GGACCAGGGT GGGAAAAAAA (5) GTGGTGCAAG (3) TCAGGAAGAG (3) TCTGTGTCCT (3) 137.7 0.1377 P2.5 retina CAGAGCTGCA CAGCTGCACC CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GCCTCTCTTG (3) GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GGGAAAAAAA (5) TCAGGAAGAG (3) TCTGTGTCCT (3) TGGCCTGTGC (2) TTCAGGGAAA 142.7 0.1427 P4.5 retina AAGAGCAACC (2) CAGCTGCACC CCTTTAATCC (3) GCCGAGGAAG GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GGACCAGGGT GGGAAAAAAA (5) GTGGTGCAAG (3) TCTGTGTCCT (3) TGGCCTGTGC (2) 119 0.119 P6.5 retina CAGCTGCACC CATCTCCATC (2) CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GGGAAAAAAA (5) GTGGTGCAAG (3) TCTGTGTCCT (3) TGGCCTGTGC (2) 146.9 0.1469 P10.5 crx- retina AAGAGCAACC (2) CAGCACTGGA (2) CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GCCGAGGAAG GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GGGAAAAAAA (5) TCTGTGTCCT (3) TGGCCTGTGC (2) 146.8 0.1468 P10.5 crx+ retina AAGAGCAACC (2) CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GCTGCTGCCC (2) GGGAAAAAAA (5) TCTGTGTCCT (3) TGGCCTGTGC (2) 130.6 0.1306 Adult retinal AGAACCTGGC (4) CAGCTGCACC CATTTCCATC (4) CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GCCTCTGCAT (2) GCGAGGGAGC (2) GCTCTCAACC (2) GCTGCTGCCC (2) GGGAAAAAAA (5) GTGGTGCAAG (3) TCTGTGTCCT (3) TGGCCTGTGC (2) 226.3 0.2263 ONL CCTTTAATCC (3) CTGCTCAGTA (2) GCCTCTGCAT (2) GCTCTCAACC (2) GGGAAAAAAA (5) GTGGTGCAAG (3) 137.8 0.1378