Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.181661 Setdb1SET domain, bifurcated 1 3    84505 
 Mm.181661 C77070expressed sequence C77070 3    97053 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 107 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACTGTGTCAG (3)
GGCAGATAGG
GTTCCTAGGA (3)
TGAATAATGA (2)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTATTTAA (3)
48.90.0489
Cb medulloblastomaACTGTGTCAG (3)
GGATGCTGTC (4)
GGCAGATAGG
TGTGTGTGTG (2)
TTTTATTTAA (3)
740.074
P8 GC+1d cultureACTGTGTCAG (3)
GGCAGATAGG
GTTCCTAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTATTTAA (3)
41.10.0411
P8 GC+SHH+1d cultureACTGTGTCAG (3)
GATGCTGTCA (2)
GGATGCTGTC (4)
GGCAGATAGG
GGCTGTGTAT (3)
GTTCCTAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTATTTAA (3)
50.20.0502
3T3 fibroblastsTGTCAAAGCT
TGTGTGTGTG (2)
31.50.0315
E15 cortexGATGCTGTCA (2)
GGATGCTGTC (4)
9.80.0098
P1 cortexGATGCTGTCA (2)
TGAATAATGA (2)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTATTTAA (3)
36.30.0363
HypothalamusACTGTGTCAG (3)
GATGCTGTCA (2)
GGCAGATAGG
GGCTGTGTAT (3)
GTTCCTAGGA (3)
TGAATAATGA (2)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTATTTAA (3)
48.90.0489
E12.5 retinaACTGTGTCAG (3)
TGAATAATGA (2)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTATTTAA (3)
60.20.0602
E14.5 retinaACTGTGTCAG (3)
GGCAGATAGG
GTTCCTAGGA (3)
TGAATAATGA (2)
TGTCAAAGCT
TGTGTGTGTG (2)
TTTTATTTAA (3)
76.50.0765
E16.5 retinaACTGTGTCAG (3)
TGAATAATGA (2)
TGTCAAAGCT
TGTGTGTGTG (2)
48.80.0488
E18.5 retinaACTGTGTCAG (3)
GGCAGATAGG
TGTGTGTGTG (2)
TTTTATTTAA (3)
58.20.0582
P0.5 retinaACTGTGTCAG (3)
GATGCTGTCA (2)
GGCAGATAGG
GGCTGTGTAT (3)
GTTCCTAGGA (3)
TGAATAATGA (2)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTATTTAA (3)
41.30.0413
P2.5 retinaACTGTGTCAG (3)
GGCAGATAGG
TGTGTGTGTG (2)
TTTTATTTAA (3)
42.30.0423
P4.5 retinaACTGTGTCAG (3)
GATGCTGTCA (2)
GGCAGATAGG
GGCTGTGTAT (3)
TGAATAATGA (2)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTATTTAA (3)
81.30.0813
P6.5 retinaACTGTGTCAG (3)
GATGCTGTCA (2)
GGCAGATAGG
GTTCCTAGGA (3)
TGAATAATGA (2)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTATTTAA (3)
61.70.0617
P10.5 crx- retinaGGCAGATAGG
GTTCCTAGGA (3)
TGAATAATGA (2)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTATTTAA (3)
670.067
P10.5 crx+ retinaACTGTGTCAG (3)
GATGCTGTCA (2)
GGCAGATAGG
TGAATAATGA (2)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTATTTAA (3)
69.10.0691
Adult retinalACTGTGTCAG (3)
GATGCTGTCA (2)
GGCAGATAGG
GTTCCTAGGA (3)
TGTCAAAGCT
TGTGTGTGTG (2)
66.80.0668
ONLACTGTGTCAG (3)
GATGCTGTCA (2)
GTTCCTAGGA (3)
TGAATAATGA (2)
TGTGTGTGTG (2)
34.40.0344