Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.182445	Cog1	component of oligomeric golgi complex 1	11		16834
Gene Ontology	Golgi apparatus | membrane | protein transport | transport
Human Homolog	COG1[component of oligomeric golgi complex 1]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 145 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ACAAGCACGA CCCAGGCTCT (2) GAAGGGCCAG (4) GTTTTTGTTT (2) TATTAATAAA (6) 17.9 0.0179 Cb medulloblastoma CCCAGGCTCT (2) CCGTAAAAAA (2) CTCTGACCAG (3) GCGGCGCAGC TATTAATAAA (6) TTATGTTCAG (4) 48.5 0.0485 P8 GC+1d culture ACAAGCACAA (5) ACAAGCACGA CCCAGGCTCT (2) CCGTAAAAAA (2) CTCTGACCAG (3) GAAGGGCCAG (4) GCGGCGCAGC GTTTTTGTTT (2) TATTAATAAA (6) 26.1 0.0261 P8 GC+SHH+1d culture ACAAGCACAA (5) ACAAGCACGA CCCAGGCTCT (2) CCGTAAAAAA (2) GAAGGGCCAG (4) GCGGCGCAGC GTTTTTGTTT (2) TATTAATAAA (6) TTATGTTCAG (4) 23.1 0.0231 3T3 fibroblasts CCCAGGCTCT (2) GAAGGGCCAG (4) GCGGCGCAGC GTCATAGCTG (2) 24.5 0.0245 E15 cortex CCCAGGCTCT (2) CTCTGACCAG (3) GAAATGGAAA GAAGGGCCAG (4) GCAGCCCAGA GTCATAGCTG (2) 39.3 0.0393 P1 cortex TATTAATAAA (6) 13.6 0.0136 Hypothalamus ACAAGCACAA (5) CCCAGGCTCT (2) CCGTAAAAAA (2) GGGAGGGGAG GTTTTTGTTT (2) TATTAATAAA (6) TTATGTTCAG (4) 59.7 0.0597 E12.5 retina CCCAGGCTCT (2) CCGTAAAAAA (2) CTCTGACCAG (3) GAAGGGCCAG (4) GCAGCCCAGA GGGAGGGGAG TATTAATAAA (6) TTATGTTCAG (4) 22.8 0.0228 E14.5 retina ACAAGCACAA (5) CCCAGGCTCT (2) CCGTAAAAAA (2) GAAGGGCCAG (4) GCCTTTTTAC GCGGCGCAGC GGGAGGGGAG TATTAATAAA (6) TTATGTTCAG (4) 30.9 0.0309 E16.5 retina ACAAGCACAA (5) CCCAGGCTCT (2) CCGTAAAAAA (2) CTCAGGGAAG CTCTGACCAG (3) GTTTTTGTTT (2) TATTAATAAA (6) TTATGTTCAG (4) 36.1 0.0361 E18.5 retina CCGTAAAAAA (2) GAAGGGCCAG (4) GGGAGGGGAG GTTTTTGTTT (2) TATTAATAAA (6) 29.1 0.0291 P0.5 retina ACAAGCACAA (5) CCCAGGCTCT (2) CCGTAAAAAA (2) CTCTGACCAG (3) GAAGGGCCAG (4) GTCATAGCTG (2) TATTAATAAA (6) TTATGTTCAG (4) 27.6 0.0276 P2.5 retina ACAAGCACAA (5) CCCAGGCTCT (2) CCGTAAAAAA (2) CTCTGACCAG (3) GAAGGGCCAG (4) GCCTTTTTAC GCGGCGCAGC GGGAGGGGAG GTCATAGCTG (2) TATTAATAAA (6) TTATGTTCAG (4) 44.1 0.0441 P4.5 retina CCGTAAAAAA (2) CTCTGACCAG (3) GAAGGGCCAG (4) GGGAGGGGAG GTCATAGCTG (2) GTTTTTGTTT (2) TATTAATAAA (6) TTATGTTCAG (4) 35.9 0.0359 P6.5 retina CCCAGGCTCT (2) CTCAGGGAAG CTCTGACCAG (3) GAAATGGAAA GAAGGGCCAG (4) GCGGCGCAGC GGGAGGGGAG GTCATAGCTG (2) GTTTTTGTTT (2) TATTAATAAA (6) TTATGTTCAG (4) 41.8 0.0418 P10.5 crx- retina CCCAGGCTCT (2) CCGTAAAAAA (2) CTCAGGGAAG GAAATGGAAA GCGGCGCAGC GTTTTTGTTT (2) TATTAATAAA (6) TTATGTTCAG (4) 39.2 0.0392 P10.5 crx+ retina CCCAGGCTCT (2) CCGTAAAAAA (2) CTCTGACCAG (3) GCAGCCCAGA TATTAATAAA (6) TTATGTTCAG (4) 34.5 0.0345 Adult retinal ACAAGCACAA (5) CCCAGGCTCT (2) CCGTAAAAAA (2) CTCAGGGAAG CTCTGACCAG (3) GGGAGGGGAG GTCATAGCTG (2) GTTTTTGTTT (2) TATTAATAAA (6) TTATGTTCAG (4) 33.7 0.0337 ONL ACAAGCACAA (5) GCCTTTTTAC GGGAGGGGAG GTCATAGCTG (2) TATTAATAAA (6) TTATGTTCAG (4) 34.4 0.0344