| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | GATTGGTGTT TCCAAATTAA TCCATATTAA TCCTTGCTTT TCTTAAAAAA (3)
| 13 | 0.013 |
| Cb medulloblastoma | AAATGCTGCT (2) GATTGGTGTT GGGGAAAAAA (4) TCCAAATTAA TCCATATTAA TCCTTGCTTT TCTTAATAAA (2)
| 25.3 | 0.0253 |
| P8 GC+1d culture | AGGTGGGGTG GGGGAAAAAA (4) TCCAAATTAA TCCTTGCTTT TCTTAATAAA (2) TGGAGGAATG
| 13.6 | 0.0136 |
| P8 GC+SHH+1d culture | TCCAAATTAA TCCTTGCTTT TCTTAATAAA (2) TGAATAGCAA (6) TGGAGGAATG
| 19.9 | 0.0199 |
| 3T3 fibroblasts | AAATGCTGCT (2) GATTGGTGTT GTCATAGCTG (2) TGGAGGAATG
| 21 | 0.021 |
| E15 cortex | GGGGAAAAAA (4) GTCATAGCTG (2)
| 9.8 | 0.0098 |
| P1 cortex | TCCATATTAA TCCTTGCTTT TGGAGGAATG
| 31.7 | 0.0317 |
| Hypothalamus | AAATGCTGCT (2) AATTCCTTCT TCCTTGCTTT TCTTAATAAA (2)
| 18 | 0.018 |
| E12.5 retina | AATTCCTTCT GATTGGTGTT GGGGAAAAAA (4) TCCAAATTAA TGAATAGCAA (6) TGGAGGAATG
| 18.9 | 0.0189 |
| E14.5 retina | TCCAAATTAA TCCTTGCTTT TGAATAGCAA (6) TGGAGGAATG
| 12.7 | 0.0127 |
| E16.5 retina | AAATGCTGCT (2) AGGTGGGGTG GGGGAAAAAA (4) TCCAAATTAA TCCTTGCTTT TCTTAATAAA (2) TGGAGGAATG
| 14.4 | 0.0144 |
| E18.5 retina | GGGGAAAAAA (4) TCCAAATTAA TCCTTGCTTT TCTTAAAAAA (3) TCTTAATAAA (2) TGAATAGCAA (6) TGGAGGAATG
| 23.6 | 0.0236 |
| P0.5 retina | GATTGGTGTT GTCATAGCTG (2) TCCTTGCTTT TCTTAATAAA (2) TGGAGGAATG
| 17.8 | 0.0178 |
| P2.5 retina | GATTGGTGTT GTCATAGCTG (2) TCCAAATTAA TCCTTGCTTT TCTTAAAAAA (3) TGGAGGAATG
| 14.2 | 0.0142 |
| P4.5 retina | GATTGGTGTT GTCATAGCTG (2) TCCAAATTAA TCCTTGCTTT TCTTAAAAAA (3) TGGAGGAATG
| 16 | 0.016 |
| P6.5 retina | AATTCCTTCT GGGGAAAAAA (4) GTCATAGCTG (2) TCCTTGCTTT TCTTAAAAAA (3) TGGAGGAATG
| 33.4 | 0.0334 |
| P10.5 crx- retina | AAATGCTGCT (2) TCCTTGCTTT TCTTAATAAA (2) TGGAGGAATG
| 11.3 | 0.0113 |
| P10.5 crx+ retina | TCCTTGCTTT TGAATAGCAA (6) TGGAGGAATG
| 5.7 | 0.0057 |
| Adult retinal | GATTGGTGTT GTCATAGCTG (2) TCCATATTAA TCCTTGCTTT TCTTAAAAAA (3) TGGAGGAATG
| 16.9 | 0.0169 |
| ONL | AGGTGGGGTG GTCATAGCTG (2) TCCTTGCTTT TCTTAAAAAA (3) TGGAGGAATG
| 15.2 | 0.0152 |