Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.196607	Eif5a	eukaryotic translation initiation factor 5A	19	19 15.0 cM	276770
Gene Ontology	apoptosis | cytoplasm | nucleus
Human Homolog	EIF5A[eukaryotic translation initiation factor 5A]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 159 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AATCCTGGAG ACAGTGGGGA (2) AGCCTACAGA CAGAGGTCCA CCAAGGGTCC GCCTTGGTGA (2) GCCTTTGGTG (4) GGCTTTGGTG (2) TAAATCAACT (3) 48.9 0.0489 Cb medulloblastoma ACAGTGGGGA (2) AGCCTACAGA CAGAGGTCCA CCAAGGCTCC CCAAGGGTCC GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) GGCTTTGGTG (2) GGGGGGGGGG 97 0.097 P8 GC+1d culture ACAGTGGGGA (2) AGCCTAACAG CAGAGGTCCA CCAAGGGTCC GCCGGCCTTT GCCTGGTGAA (2) GCCTTGGTGA (2) GGCCTTGGGG (2) GGGGGGGGGG 77.4 0.0774 P8 GC+SHH+1d culture ACAGTGGGGA (2) AGCCTAACAG AGCCTACAGA CAGAGGTCCA CCAAGGGTCC GCCGGCCTTT GCCTGGTGAA (2) GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) GGCCTTGGGG (2) GGCTTTGGTG (2) GGGGGGGGGG TAAATCAACT (3) 93.7 0.0937 3T3 fibroblasts ACAGTGGGGA (2) CCAAGGGTCC GCCGGCCTTT GCCTGGTGAA (2) GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) GGCCTTGGGG (2) GGCTTTGGTG (2) GGGGGGGGGG 150.6 0.1506 E15 cortex ACAGTGGGGA (2) AGCCTACAGA CATCTGGGGA (2) GCCTTGGTGA (2) GGCCTTGGGG (2) GGGGGGGGGG 74 0.074 P1 cortex AGCCTAACAG CCAAGGGTCC GCAGACAGCA GCCGGCCTTT GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) TAAATCAACT (3) 54.4 0.0544 Hypothalamus ACAGTGGGGA (2) AGCCTACAGA CCAAGGCTCC GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) GGCTTTGGTG (2) GGGGGGGGGG 32.5 0.0325 E12.5 retina ACAGTGGGGA (2) AGCCTACAGA CCAAGGGTCC GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) GGCTTTGGTG (2) TAAATCAACT (3) 90.2 0.0902 E14.5 retina ACAGTGGGGA (2) GCCGGCCTTT GCCTTTGGTG (4) GGCCTTGGGG (2) GGCTTTGGTG (2) 43.7 0.0437 E16.5 retina ACAGTGGGGA (2) AGCCTACAGA CAGAGGTCCA CCAAGGGTCC GCCTTGGTGA (2) GGCCTTGGGG (2) GGCTTTGGTG (2) 61.5 0.0615 E18.5 retina AATCCTGGAG ACAGTGGGGA (2) GCCGGCCTTT GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) TAAATCAACT (3) 43.6 0.0436 P0.5 retina ACAGTGGGGA (2) AGCCTACAGA CCAAGGGTCC GCCGGCCTTT GCCTTGGTGA (2) GCCTTTGGTG (4) GGCCTTGGGG (2) GGCCTTTGGC (3) GGCTTTGGTG (2) TAAATCAACT (3) 58.9 0.0589 P2.5 retina ACAGTGGGGA (2) CAGAGGTCCA CCAAGGGTCC GCCTTGGTGA (2) GCCTTTGGTG (4) GGCCTTGGGG (2) GGCCTTTGGC (3) GGGGGGGGGG TAAATCAACT (3) 65.1 0.0651 P4.5 retina ACAGTGGGGA (2) AGCCTACAGA CAGAGGTCCA GCAGACAGCA GCCTTGGTGA (2) GGCCTTGGGG (2) GGCTTTGGTG (2) GGGGGGGGGG TAAATCAACT (3) 43.7 0.0437 P6.5 retina ACAGTGGGGA (2) CAGAGGTCCA GCCTTGGTGA (2) GCCTTTGGTG (4) GCTCCCTCAT (2) GGCCTTGGGG (2) GGCCTTTGGC (3) GGGGGGGGGG 36.7 0.0367 P10.5 crx- retina ACAGTGGGGA (2) CAGAGGTCCA CCAAGGGTCC GCCTTGGTGA (2) GGCTTTGGTG (2) 44.6 0.0446 P10.5 crx+ retina ACAGTGGGGA (2) AGCCTACAGA CAGAGGTCCA CCAAGGGTCC GCAGACAGCA GCCTGGTGAA (2) GCCTTGGTGA (2) GGCTTTGGTG (2) GGGGGGGGGG 55.6 0.0556 Adult retinal ACAGTGGGGA (2) AGCCTACAGA CCAAGGCTCC CCAAGGGTCC GCAGACAGCA GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) GGGGGGGGGG 39.1 0.0391 ONL AATCCTGGAG ACAGTGGGGA (2) AGCCTACAGA CCAAGGGTCC GCAGACAGCA GCCTTGGTGA (2) GGGGGGGGGG 24.8 0.0248