Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.202774	4833412C15Rik	RIKEN cDNA 4833412C15 gene	15		74613
Mm.202774	AU021833	expressed sequence AU021833	15		105971
Mm.202774	3010033E01Rik	RIKEN cDNA 3010033E01 gene			77135
Mm.202774	Rbm9	RNA binding motif protein 9	15		93686
Gene Ontology	biological_process unknown | nucleus | protein binding | RNA binding
Human Homolog	RBM9[RNA binding motif protein 9]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 98 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGGCCTGGCT (4) CGGATGCTTG (4) TATCAGCTCC TCCCTGAATT (4) TCCTCAAGAT (4) TTGCTGGCTT (5) 34.2 0.0342 Cb medulloblastoma AGGCCTGGCT (4) TATCAGCTCC TATGTACATA (2) TTGCTGCTTT TTGCTGGCTT (5) 41.6 0.0416 P8 GC+1d culture AGGCCTGGCT (4) CGGATGCTTG (4) GGGCCCTTTA (3) TATCAGCTCC TCTCTTAGGG (4) TTGCTGCTTT TTGCTGGCTT (5) 59.2 0.0592 P8 GC+SHH+1d culture AGGCCTGGCT (4) CGGATGCTTG (4) TATCAGCTCC TCCCTGAATT (4) TTGCTGCTTT TTGCTGGCTT (5) 42.1 0.0421 3T3 fibroblasts AGGCCTGGCT (4) GAGAGTAATA TATCAGCTCC TTGCTGGCTT (5) 38.5 0.0385 E15 cortex AGGCCTGGCT (4) CCCTCGCCCC (4) TTGCTGGCTT (5) 49.4 0.0494 P1 cortex AGGCCTGGCT (4) TATCAGCTCC TTGCTGGCTT (5) 50 0.05 Hypothalamus GGGCCCTTTA (3) TATGTACATA (2) TTGCTGGCTT (5) 10.8 0.0108 E12.5 retina AGGCCTGGCT (4) GGGCCCTTTA (3) TATCAGCTCC TATGTACATA (2) TCTCTTAGGG (4) TTCTAAAGTC (2) TTGCTGGCTT (5) 13.3 0.0133 E14.5 retina AGGCCTGGCT (4) CGGATGCTTG (4) GGGCCCTTTA (3) TATCAGCTCC TCCCTGAATT (4) TTCTAAAGTC (2) TTGCTGGCTT (5) 14.4 0.0144 E16.5 retina TATGTACATA (2) TCTCTTAGGG (4) TTCTAAAGTC (2) TTGCTGCTTT TTGCTGGCTT (5) 19.9 0.0199 E18.5 retina AGGCCTGGCT (4) GGGCCCTTTA (3) TTGCAAATGC TTGCTGCTTT TTGCTGGCTT (5) 18.1 0.0181 P0.5 retina AGGCCTGGCT (4) CGGATGCTTG (4) GAGAGTAATA TATCAGCTCC TTGCTGGCTT (5) 11.9 0.0119 P2.5 retina AGGCCTGGCT (4) CGGATGCTTG (4) GGGCCCTTTA (3) TATCAGCTCC TATGTACATA (2) TTGCTGGCTT (5) 26.4 0.0264 P4.5 retina CGGATGCTTG (4) TCCCTGAATT (4) TTGCAAATGC TTGCTGCTTT TTGCTGGCTT (5) 10 0.01 P6.5 retina AAGCGGGAGT (4) AGGCCTGGCT (4) GAGAGTAATA TATGTACATA (2) TTGCAAATGC TTGCTGGCTT (5) 18.4 0.0184 P10.5 crx- retina CGGATGCTTG (4) GAGAGTAATA TTCTAAAGTC (2) TTGCTGGCTT (5) 20.6 0.0206 P10.5 crx+ retina AGGCCTGGCT (4) TATGTACATA (2) TCCTCAAGAT (4) TTGCTGCTTT TTGCTGGCTT (5) 13.3 0.0133 Adult retinal GGGCCCTTTA (3) TTGCAAATGC TTGCTGCTTT TTGCTGGCTT (5) 14.9 0.0149 ONL TATGTACATA (2) TTGCTGGCTT (5) 5.7 0.0057