Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.211229 6720464I07RikRIKEN cDNA 6720464I07 gene 15    77730 
 Mm.211229 Triotriple functional domain (PTPRF interacting) 15    223435 
 Gene Ontology biological_process unknown | cellular_component unknown | molecular_function unknown
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 119 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAGACAAAGC
CGATTGAGAA
GATAGAATTT (3)
GGCAGAGACC (2)
GTGCGGCTGG
TAAAATGTCC
TTTACACAGT (3)
260.026
Cb medulloblastomaCAAAAAAATA (2)
CAGACAAAGC
GATAGAATTT (3)
GGCAGAGACC (2)
GTGCGGCTGG
TAAAATGTCC
TTTACACAGT (3)
25.30.0253
P8 GC+1d cultureCAAAAAAATA (2)
CAAAAAATAA (3)
CAGACAAAGC
CGTGAGTGCA (2)
GCTGGAGGAG
GGCTCAGCCA (2)
TAATAAATAT (3)
TTTACACAGT (3)
15.90.0159
P8 GC+SHH+1d cultureCAAAAAAATA (2)
CGTGAGTGCA (2)
CTGGAAGGGT (2)
GTGCGGCTGG
TAATAAATAT (3)
TTTACACAGT (3)
TTTCTGGTGT (3)
14.10.0141
3T3 fibroblastsCAGACAAAGC
CGTGAGTGCA (2)
GTGCGGCTGG
TAAAATGTCC
24.50.0245
E15 cortexCCTATGTTCA (2)
CGTGAGTGCA (2)
9.80.0098
P1 cortexCAGACAAAGC
GTGCGGCTGG
TTTACACAGT (3)
TTTCTGGTGT (3)
22.60.0226
HypothalamusCAAAAAAATA (2)
CAAAAAATAA (3)
CAGACAAAGC
CGTGAGTGCA (2)
GCTGGAGGAG
GTGCGGCTGG
TCTACTCCTA (2)
TTTCTGGTGT (3)
27.10.0271
E12.5 retinaCAGACAAAGC
GGCAGAGACC (2)
GGCTCAGCCA (2)
GTGCGGCTGG
TTTACACAGT (3)
TTTCTGGTGT (3)
20.80.0208
E14.5 retinaCAAAAAATAA (3)
CAGACAAAGC
CGTGAGTGCA (2)
GTGCGGCTGG
TAAAATGTCC
TAATAAATAT (3)
TTTACACAGT (3)
23.60.0236
E16.5 retinaCAAAAAATAA (3)
CAGACAAAGC
CCTATGTTCA (2)
CGTGAGTGCA (2)
TAAAATGTCC
TAATAAATAT (3)
TTTACACAGT (3)
TTTCTGGTGT (3)
32.50.0325
E18.5 retinaCAGACAAAGC
CGATTGAGAA
GTGCGGCTGG
TAAAATGTCC
18.20.0182
P0.5 retinaCAAAAAATAA (3)
CAGACAAAGC
CGTGAGTGCA (2)
GATAGAATTT (3)
TAAAATGTCC
TTTACACAGT (3)
13.90.0139
P2.5 retinaCAAAAAATAA (3)
CAGACAAAGC
CGATTGAGAA
CGTGAGTGCA (2)
CTGGAAGGGT (2)
GATAGAATTT (3)
GGCTCAGCCA (2)
TAAAATGTCC
TTTACACAGT (3)
28.40.0284
P4.5 retinaCAAAAAATAA (3)
CAGACAAAGC
GTGCGGCTGG
TTTACACAGT (3)
17.90.0179
P6.5 retinaCAGACAAAGC
GGCAGAGACC (2)
GTGCGGCTGG
TAAAATGTCC
TTTACACAGT (3)
TTTCTGGTGT (3)
21.80.0218
P10.5 crx- retinaCAAAAAAATA (2)
CAGACAAAGC
CGTGAGTGCA (2)
GCTGGAGGAG
TTTACACAGT (3)
TTTCTGGTGT (3)
22.30.0223
P10.5 crx+ retinaCAGACAAAGC
CGTGAGTGCA (2)
GATAGAATTT (3)
GGCTCAGCCA (2)
GTGCGGCTGG
TAATAAATAT (3)
TTTACACAGT (3)
210.021
Adult retinalCAGACAAAGC
GTGCGGCTGG
TTTACACAGT (3)
11.20.0112
ONLCAAAAAAATA (2)
CAGACAAAGC
CCTATGTTCA (2)
CTGGAAGGGT (2)
TTTACACAGT (3)
TTTCTGGTGT (3)
13.30.0133