Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.217547	Xpo1	exportin 1, CRM1 homolog (yeast)	11		103573
Mm.217547	AA939960	expressed sequence AA939960	11		103609
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 101 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGCACACACA ATCTTGCTGC (3) ATCTTGGTGC (3) CTAGGCTTTT (3) CTTAATGTAT (3) TATTTGCTTT (2) TGCATATCAT (2) 34.3 0.0343 Cb medulloblastoma ATCTTGGTGC (3) 4.6 0.0046 P8 GC+1d culture ATCTTGGTGC (3) CTAGGCTTTT (3) CTTAATGTAT (3) TATTTGCTTT (2) TGCATATCAT (2) 18.3 0.0183 P8 GC+SHH+1d culture ATCTTGCTGC (3) ATCTTGGTGC (3) CCCATTTTGA (2) CTAGGCTTTT (3) CTTAATGTAT (3) TAACAAATGA TATTTGCTTT (2) 28.2 0.0282 3T3 fibroblasts GTCATAGCTG (2) 10.5 0.0105 E15 cortex AACAGGATGA (4) GTCATAGCTG (2) TGCATATCAT (2) 14.7 0.0147 P1 cortex AACAGGATGA (4) CTAGGCTTTT (3) 18.1 0.0181 Hypothalamus TATTTGCTTT (2) 3.6 0.0036 E12.5 retina AGCACACACA ATCTTGCTGC (3) CTAGGCTTTT (3) CTTAATGTAT (3) TATTTGCTTT (2) TGCATATCAT (2) 22.7 0.0227 E14.5 retina ATCTTGCTGC (3) CCCATTTTGA (2) CTTAATGTAT (3) GAGAAGGAGC (3) TATTTGCTTT (2) TGCATATCAT (2) 29 0.029 E16.5 retina AGCACACACA CCCATTTTGA (2) CTAGGCTTTT (3) CTTAATGTAT (3) TAACAAATGA TATTTGCTTT (2) TGCATATCAT (2) 36.2 0.0362 E18.5 retina CTAGGCTTTT (3) CTTAATGTAT (3) GAGAAGGAGC (3) TAACAAATGA TATTTGCTTT (2) TGCATATCAT (2) 47.3 0.0473 P0.5 retina ATCTTGGTGC (3) CTAGGCTTTT (3) CTTAATGTAT (3) GAGAAGGAGC (3) GTCATAGCTG (2) TAACAAATGA TATTTGCTTT (2) TGCATATCAT (2) 17.9 0.0179 P2.5 retina CTAGGCTTTT (3) CTTAATGTAT (3) GTCATAGCTG (2) TAACAAATGA TATTTGCTTT (2) TGCATATCAT (2) 42.3 0.0423 P4.5 retina CTAGGCTTTT (3) CTTAATGTAT (3) GTCATAGCTG (2) TAACAAATGA TATTTGCTTT (2) TGCATATCAT (2) 43.6 0.0436 P6.5 retina CTAGGCTTTT (3) CTTAATGTAT (3) GTCATAGCTG (2) TAACAAATGA TATTTGCTTT (2) TGCATATCAT (2) 30 0.03 P10.5 crx- retina CCCATTTTGA (2) CTAGGCTTTT (3) CTTAATGTAT (3) TGCATATCAT (2) 11.2 0.0112 P10.5 crx+ retina AGCACACACA CCCATTTTGA (2) CTTAATGTAT (3) TATTTGCTTT (2) TGCATATCAT (2) 21.1 0.0211 Adult retinal ATCTTGGTGC (3) CTAGGCTTTT (3) CTTAATGTAT (3) GAGAAGGAGC (3) GTCATAGCTG (2) TATTTGCTTT (2) TGCATATCAT (2) 18.8 0.0188 ONL AGCACACACA ATCTTGGTGC (3) CTTAATGTAT (3) GTCATAGCTG (2) TAACAAATGA TATTTGCTTT (2) TGCATATCAT (2) 20.9 0.0209