Mouse Retina SAGE Library

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Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

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UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.218434	1810034M08Rik	RIKEN cDNA 1810034M08 gene	6		69786
Gene Ontology	biological_process unknown | cellular_component unknown | protein kinase binding
Human Homolog	CGI-121[CGI-121 protein]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

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SAGE Tags

Total 95 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCTTTAATCC (3) GAAGGTTCTA (2) GAAGTGGCAG (2) GTCTACAGAG (2) TTTGATGGTT 65.2 0.0652 Cb medulloblastoma CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GAAGGTTCTA (2) GTCTACAGAG (2) TTTGATGGTT 62.3 0.0623 P8 GC+1d culture CCCTTAATCC (2) CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GAAGGTTCTA (2) GTCTACAGAG (2) 39.9 0.0399 P8 GC+SHH+1d culture CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GAAGGTTCTA (2) GTCTACAGAG (2) TTTGATGGTT 41 0.041 3T3 fibroblasts CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GAAGGTTCTA (2) GTCTACAGAG (2) 84.1 0.0841 E15 cortex CCTTAAATCC CCTTTAATCC (3) GAAGGTTCTA (2) GTCTACAGAG (2) 74.1 0.0741 P1 cortex CCTTTAATCC (3) GAAGGTTCTA (2) GTCTACAGAG (2) 172.6 0.1726 Hypothalamus CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GAAGGTTCTA (2) GTCTACAGAG (2) 30.7 0.0307 E12.5 retina CCTTAAATCC CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GAAGGTTCTA (2) GAAGTGGCAG (2) 97.7 0.0977 E14.5 retina CCCTTAATCC (2) CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GAAGGTTCTA (2) GTCTACAGAG (2) 140.3 0.1403 E16.5 retina CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GAAGGTTCTA (2) GAAGTGGCAG (2) GTCTACAGAG (2) TTTGATGGTT 86.8 0.0868 E18.5 retina CCTTTAATCC (3) GAAGGTTCTA (2) GAAGTGGCAG (2) GTCTACAGAG (2) 41.8 0.0418 P0.5 retina CCCTTAATCC (2) CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GAAGGTTCTA (2) GTCTACAGAG (2) 96.1 0.0961 P2.5 retina CCCTTAATCC (2) CCTTAAATCC CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GAAGGTTCTA (2) 89.8 0.0898 P4.5 retina CCCTTAATCC (2) CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GAAGGTTCTA (2) GTCTACAGAG (2) 69.4 0.0694 P6.5 retina AAGATGGAAG CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GAAGGTTCTA (2) GTCTACAGAG (2) 91.7 0.0917 P10.5 crx- retina CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GAAGGTTCTA (2) GAAGTGGCAG (2) GTCTACAGAG (2) 76.3 0.0763 P10.5 crx+ retina CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GAAGGTTCTA (2) GAAGTGGCAG (2) GTCTACAGAG (2) 55.6 0.0556 Adult retinal CCTTAAATCC CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GTCTACAGAG (2) 137.1 0.1371 ONL CCCTTAATCC (2) CCTTAAATCC CCTTTAATCC (3) CTCCTGTCTT (2) GAAGGTTCTA (2) GTCTACAGAG (2) 113 0.113