Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.21904	Rab6ip1	Rab6 interacting protein 1	7		19347
Gene Ontology	nucleic acid binding | protein binding | Rab interactor activity
Human Homolog	RAB6IP1[RAB6 interacting protein 1]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 80 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGCTCACCAA (3) ATGATGATGA (2) GAGAAAAAAA (2) TAAGACAATA TTATTACTGT (3) TTTAACAGGT 16.3 0.0163 Cb medulloblastoma AGCTCACCAA (3) ATGATGATGA (2) GAGAAAAAAA (2) TTATTACTGT (3) TTTAACAGGT 20.8 0.0208 P8 GC+1d culture AGCTCACCAA (3) ATGATGATGA (2) GAGAAAAAAA (2) GTTTCCCTGT TTTAACAGGT 13.7 0.0137 P8 GC+SHH+1d culture AGCTCACCAA (3) ATGATGATGA (2) GAGAAAAAAA (2) TCTCCTTCCC (2) TTATTACTGT (3) TTTAACAGGT 27 0.027 3T3 fibroblasts AGCTCACCAA (3) 7 0.007 E15 cortex AGCTCACCAA (3) TCTCCTTCCC (2) TGTGTTTCAA 29.6 0.0296 P1 cortex AGCTCACCAA (3) GAGAAAAAAA (2) TTATTACTGT (3) 13.5 0.0135 Hypothalamus AGCTCACCAA (3) GAGAAAAAAA (2) GTTTCCCTGT TTTAACAGGT 16.2 0.0162 E12.5 retina AGCTCACCAA (3) ATGATGATGA (2) TTATTACTGT (3) TTTAACAGGT 28.2 0.0282 E14.5 retina AGCTCACCAA (3) ATGATGATGA (2) GAGAAAAAAA (2) TGTGTTTCAA TTTAACAGGT 27.2 0.0272 E16.5 retina AGCTCACCAA (3) ATGATGATGA (2) GAGAAAAAAA (2) TTTAACAGGT 21.7 0.0217 E18.5 retina AGCTCACCAA (3) ATGATGATGA (2) GAGAAAAAAA (2) TAAGACAATA TTTAACAGGT 23.6 0.0236 P0.5 retina AGCTCACCAA (3) ATGATGATGA (2) GAGAAAAAAA (2) TTATTACTGT (3) 29.5 0.0295 P2.5 retina AGCTCACCAA (3) ATGATGATGA (2) GAGAAAAAAA (2) TTTAACAGGT 40.5 0.0405 P4.5 retina AGCTCACCAA (3) GAGAAAAAAA (2) TTTAACAGGT 21.8 0.0218 P6.5 retina AGCTCACCAA (3) ATGATGATGA (2) GAGAAAAAAA (2) GTTTCCCTGT TAAGACAATA TTTAACAGGT 30.1 0.0301 P10.5 crx- retina GAGAAAAAAA (2) TCTCCTTCCC (2) TTTAACAGGT 14.9 0.0149 P10.5 crx+ retina AGCTCACCAA (3) GAGAAAAAAA (2) TTTAACAGGT 25 0.025 Adult retinal GTTTCCCTGT TTTAACAGGT 3.8 0.0038 ONL AGCTCACCAA (3) ATGATGATGA (2) GAGAAAAAAA (2) TTTAACAGGT 9.5 0.0095