Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.219040 Tcfcp2transcription factor CP2 15  15 56.8 cM  21422 
 Mm.219040 D230015P20RikRIKEN cDNA D230015P20 gene 15    319662 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 57 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGTTTGTTT (3)
GCGGGGAGAA (2)
TAAAGTTTTA (2)
16.30.0163
Cb medulloblastomaAAGTTTGTTT (3)
GAGGGATGTT
9.20.0092
P8 GC+1d cultureAAAAAGAGAA
AAGTTTGTTT (3)
3.40.0034
P8 GC+SHH+1d cultureAAGTTTGTTT (3)
GAGGGATGTT
11.70.0117
3T3 fibroblastsGAGGGATGTT
3.50.0035
E15 cortexGAGGGATGTT
GCGGGGAGAA (2)
9.80.0098
P1 cortexTAAAGTTTTA (2)
4.50.0045
HypothalamusAAAAAGAGAA
AAGTTTGTTT (3)
TAAAGTTTTA (2)
7.20.0072
E12.5 retinaAAAAAGAGAA
AAGTTTGTTT (3)
GAGCCAGCAG (2)
GAGGGATGTT
13.30.0133
E14.5 retinaAAGTTTGTTT (3)
GAGCCAGCAG (2)
GAGGGATGTT
TTCTTGCCTC (2)
54.60.0546
E16.5 retinaAAGTTTGTTT (3)
GAGGGATGTT
TAAAGTTTTA (2)
90.009
E18.5 retinaAAGTTTGTTT (3)
GAGGGATGTT
TAAAGTTTTA (2)
23.60.0236
P0.5 retinaAAGTTTGTTT (3)
GAGCCAGCAG (2)
GAGGGATGTT
7.90.0079
P2.5 retinaAAGTTTGTTT (3)
GAGGGATGTT
14.10.0141
P4.5 retinaAAGTTTGTTT (3)
GAGGGATGTT
TAAAGTTTTA (2)
TTCTTGCCTC (2)
17.80.0178
P6.5 retinaAAAAAGAGAA
GAGGGATGTT
TTCTTGCCTC (2)
5.10.0051
P10.5 crx- retinaAAAAAGAGAA
CACAAAGACA (2)
GAGGGATGTT
TAAAGTTTTA (2)
7.60.0076
P10.5 crx+ retinaAAGTTTGTTT (3)
CACAAAGACA (2)
GAGGGATGTT
GCGGGGAGAA (2)
9.50.0095
Adult retinalAAGTTTGTTT (3)
CACAAAGACA (2)
GAGCCAGCAG (2)
GAGGGATGTT
7.60.0076
ONLAAGTTTGTTT (3)
CACAAAGACA (2)
GAGGGATGTT
11.40.0114