Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.219040 Tcfcp2transcription factor CP2 15  15 56.8 cM  21422 
 Mm.219040 D230015P20RikRIKEN cDNA D230015P20 gene 15    319662 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 57 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGTTTGTTT (4)13.10.0131
P8 Cb GCGCGGGGAGAA (4)1.60.0016
P8 Cb GCTAAAGTTTTA (2)1.60.0016
Cb medulloblastomaAAGTTTGTTT (4)6.90.0069
Cb medulloblastomaGAGGGATGTT (14)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAAGTTTGTTT (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAAAAAGAGAA (5)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureAAGTTTGTTT (4)10.50.0105
P8 GC+SHH+1d cultureGAGGGATGTT (14)1.20.0012
3T3 fibroblastsGAGGGATGTT (14)3.50.0035
E15 cortexGAGGGATGTT (14)4.90.0049
E15 cortexGCGGGGAGAA (4)4.90.0049
P1 cortexTAAAGTTTTA (2)4.50.0045
HypothalamusAAGTTTGTTT (4)3.60.0036
HypothalamusAAAAAGAGAA (5)1.80.0018
HypothalamusTAAAGTTTTA (2)1.80.0018
E12.5 retinaAAAAAGAGAA (5)3.80.0038
E12.5 retinaAAGTTTGTTT (4)3.80.0038
E12.5 retinaGAGGGATGTT (14)3.80.0038
E12.5 retinaGAGCCAGCAG (6)1.90.0019
E14.5 retinaAAGTTTGTTT (4)27.30.0273
E14.5 retinaGAGGGATGTT (14)23.70.0237
E14.5 retinaGAGCCAGCAG (6)1.80.0018
E14.5 retinaTTCTTGCCTC (3)1.80.0018
E16.5 retinaGAGGGATGTT (14)5.40.0054
E16.5 retinaAAGTTTGTTT (4)1.80.0018
E16.5 retinaTAAAGTTTTA (2)1.80.0018
E18.5 retinaAAGTTTGTTT (4)16.40.0164
E18.5 retinaGAGGGATGTT (14)3.60.0036
E18.5 retinaTAAAGTTTTA (2)3.60.0036
P0.5 retinaGAGCCAGCAG (6)3.90.0039
P0.5 retinaAAGTTTGTTT (4)20.002
P0.5 retinaGAGGGATGTT (14)20.002
P2.5 retinaAAGTTTGTTT (4)12.30.0123
P2.5 retinaGAGGGATGTT (14)1.80.0018
P4.5 retinaAAGTTTGTTT (4)7.90.0079
P4.5 retinaGAGGGATGTT (14)5.90.0059
P4.5 retinaTAAAGTTTTA (2)20.002
P4.5 retinaTTCTTGCCTC (3)20.002
P6.5 retinaAAAAAGAGAA (5)1.70.0017
P6.5 retinaGAGGGATGTT (14)1.70.0017
P6.5 retinaTTCTTGCCTC (3)1.70.0017
P10.5 crx- retinaAAAAAGAGAA (5)1.90.0019
P10.5 crx- retinaCACAAAGACA (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGAGGGATGTT (14)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTAAAGTTTTA (2)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGAGGGATGTT (14)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaAAGTTTGTTT (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCACAAAGACA (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGCGGGGAGAA (4)1.90.0019
Adult retinalAAGTTTGTTT (4)1.90.0019
Adult retinalCACAAAGACA (4)1.90.0019
Adult retinalGAGCCAGCAG (6)1.90.0019
Adult retinalGAGGGATGTT (14)1.90.0019
ONLGAGGGATGTT (14)5.70.0057
ONLAAGTTTGTTT (4)3.80.0038
ONLCACAAAGACA (4)1.90.0019