Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.221275	Rtn1	reticulon 1	12	12 C2	104001
Mm.221275	4930441F12Rik	RIKEN cDNA 4930441F12 gene	12		78799
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

Total 5 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge

SAGE Tags

Total 124 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGTGGGGGTG (3) TAAATCAGCC (2) TCCTTGGGTT (2) TGTATGTGTG (3) TTGACTTTAT (3) 71.8 0.0718 Cb medulloblastoma AGGACTGCAA AGTGGGGGTG (3) CTGGCACCTT TCCTTGGGTT (2) TTGACTTTAT (3) 60.1 0.0601 P8 GC+1d culture AGGACTGCAA AGTGGGGGTG (3) ATAAGCGATC (2) ATAAGGGATC (2) ATGGTGAGAG (2) CACTTTTTTT (2) TAAATCAGCC (2) TAGACTTTAT (3) TCCGGCTTCT (2) TCCTTGGGTT (2) TGTATGTGTG (3) TTGACTTTAT (3) 207.6 0.2076 P8 GC+SHH+1d culture AGGACTGCAA AGTGGGGGTG (3) ATAAGCGATC (2) ATAAGGGATC (2) ATGGTGAGAG (2) CACTTTTTTT (2) CTGGCACCTT TAAATCAGCC (2) TAGACTTTAT (3) TCCGGCTTCT (2) TCCTTGGGTT (2) TTGACTTTAT (3) 133.6 0.1336 3T3 fibroblasts TTGACTGTAT 3.5 0.0035 E15 cortex AGTGGGGGTG (3) CACTTTTTTT (2) TCCTTGGGTT (2) TTGACTTTAT (3) 49.4 0.0494 P1 cortex AGTGGGGGTG (3) TCCGGCTTCT (2) TCCTTGGGTT (2) TGTATGTGTG (3) TTGACTGTAT TTGACTTTAT (3) 136.3 0.1363 Hypothalamus AGTGGGGGTG (3) ATGGTGAGAG (2) CACTTTTTTT (2) TAAATCAGCC (2) TCCGGCTTCT (2) TCCTTGGGTT (2) TGGCTCCTGA (2) TTGACTTTAT (3) 155.7 0.1557 E12.5 retina AGTGGGGGTG (3) CTGGCACCTT TAGACTTTAT (3) TTGACTTTAT (3) 18.8 0.0188 E14.5 retina AGTGGGGGTG (3) ATAAGCGATC (2) ATGGTGAGAG (2) CACTTTTTTT (2) TAAATCAGCC (2) TCCGGCTTCT (2) TGTATGTGTG (3) TTGACTTTAT (3) TTGACTTTTT 74.5 0.0745 E16.5 retina AGTGGGGGTG (3) ATAAGCGATC (2) ATGGTGAGAG (2) CACTTTTTTT (2) TAAATCAGCC (2) TCCGGCTTCT (2) TCCTTGGGTT (2) TGGCTCCTGA (2) TGTATGTGTG (3) TTGACTTTAT (3) 121.3 0.1213 E18.5 retina AGTGGGGGTG (3) ATGGTGAGAG (2) CACTTTTTTT (2) TAAATCAGCC (2) TCCGGCTTCT (2) TCCTTGGGTT (2) TGTATGTGTG (3) TTGACTTTAT (3) 74.6 0.0746 P0.5 retina AGTGGGGGTG (3) ATAAGCGATC (2) CACTTTTTTT (2) TAAATCAGCC (2) TCCTTGGGTT (2) TTGACTTTAT (3) 60.9 0.0609 P2.5 retina AGTGGGGGTG (3) ATAAGGGATC (2) TAAATCAGCC (2) TGGCTCCTGA (2) TTGACTTTAT (3) 51.1 0.0511 P4.5 retina AGTGGGGGTG (3) ATAAGCGATC (2) CACTTTTTTT (2) TAAATCAGCC (2) TCCTTGGGTT (2) TGGCTCCTGA (2) TTGACTTTAT (3) 51.6 0.0516 P6.5 retina AGTGGGGGTG (3) TAAATCAGCC (2) TCCTTGGGTT (2) TTGACTTTAT (3) TTGACTTTTT 50.1 0.0501 P10.5 crx- retina AGTGGGGGTG (3) TCCGGCTTCT (2) TCCTTGGGTT (2) TTGACTTTAT (3) 63.3 0.0633 P10.5 crx+ retina AGTGGGGGTG (3) CACTTTTTTT (2) TTGACTTTAT (3) 36.5 0.0365 Adult retinal AGTGGGGGTG (3) TCCTTGGGTT (2) TGTATGTGTG (3) TTGACTGTAT TTGACTTTAT (3) TTGACTTTTT 33.6 0.0336 ONL AGTGGGGGTG (3) TGTATGTGTG (3) TTGACTTTAT (3) TTGACTTTTT 17.2 0.0172