Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.223509 Spata1spermatogenesis associated 1 3    70951 
 Human Homolog SPATA1[spermatogenesis associated 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 39 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCTTTAATCC (3)
52.20.0522
Cb medulloblastomaCCTTTAATCC (3)
TAGAAGAGCT (2)
TTTTTTATGT
48.50.0485
P8 GC+1d cultureCCTTTAATCC (3)
TAGAAGAGCT (2)
33.10.0331
P8 GC+SHH+1d cultureCCTTTAATCC (3)
TAGAAGAGCT (2)
270.027
3T3 fibroblastsCCTTTAATCC (3)
70.10.0701
E15 cortexCCTTTAATCC (3)
54.40.0544
P1 cortexCCTTTAATCC (3)
TAGAAGAGCT (2)
1590.159
HypothalamusCCTTTAATCC (3)
TAGAAGAGCT (2)
21.70.0217
E12.5 retinaATCTGGATGG
CCTTTAATCC (3)
80.70.0807
E14.5 retinaCCTTTAATCC (3)
120.30.1203
E16.5 retinaCCTTTAATCC (3)
68.80.0688
E18.5 retinaATCTGGATGG
CCTTTAATCC (3)
25.40.0254
P0.5 retinaATCTGGATGG
CCTTTAATCC (3)
TTTTTTATGT
76.60.0766
P2.5 retinaCCTTTAATCC (3)
70.40.0704
P4.5 retinaATCTGGATGG
CCTTTAATCC (3)
TAGAAGAGCT (2)
TTTTTTATGT
59.40.0594
P6.5 retinaCCTTTAATCC (3)
TAGAAGAGCT (2)
78.30.0783
P10.5 crx- retinaCCTTTAATCC (3)
TAGAAGAGCT (2)
65.10.0651
P10.5 crx+ retinaATCTGGATGG
CCTTTAATCC (3)
TAGAAGAGCT (2)
480.048
Adult retinalCCTTTAATCC (3)
TAGAAGAGCT (2)
131.50.1315
ONLCCTTTAATCC (3)
TAGAAGAGCT (2)
86.20.0862