Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.227598 Prkcbp1protein kinase C binding protein 1 2    228880 
 Mm.227598 AA407782expressed sequence AA407782 2    98763 
 Mm.227598 AL024039expressed sequence AL024039 2    99150 
 Mm.227598 BC046401cDNA sequence BC046401 2    394191 
 Mm.227598 1810021M19RikRIKEN cDNA 1810021M19 gene 2    69119 
 Mm.227598 2410087M07RikRIKEN cDNA 2410087M07 gene 2    73687 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 56 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCCAAAGAGT (7)
CTGTCCGTTA (6)
TCAAAAAAAA (2)
22.80.0228
Cb medulloblastomaCCCAAAGAGT (7)
CTGTCCGTTA (6)
TCAAAAAAAA (2)
TGAAGTCCCA (7)
106.30.1063
P8 GC+1d cultureCTGTCCGTTA (6)
TCAAAAAAAA (2)
TGAAGTCCCA (7)
21.70.0217
P8 GC+SHH+1d cultureCCCAAAGAGT (7)
CTGTCCGTTA (6)
TCAAAAAAAA (2)
TGAAGTCCCA (7)
58.60.0586
3T3 fibroblastsCCACCGCCTC (2)
CTGTCCGTTA (6)
TCAAAAAAAA (2)
140.014
E15 cortexCCCAAAGAGT (7)
CTGTCCGTTA (6)
TCAAAAAAAA (2)
29.60.0296
P1 cortexCCCAAAGAGT (7)
TCAAAAAAAA (2)
27.20.0272
HypothalamusTCAAAAAAAA (2)
39.80.0398
E12.5 retinaCCCAAAGAGT (7)
TCAAAAAAAA (2)
20.70.0207
E14.5 retinaCCCAAAGAGT (7)
CTGTCCTGGG (6)
TCAAAAAAAA (2)
45.50.0455
E16.5 retinaCCCAAAGAGT (7)
CTGTCCGTTA (6)
TCAAAAAAAA (2)
TGACACACAG (7)
27.10.0271
E18.5 retinaCCCAAAGAGT (7)
TCAAAAAAAA (2)
50.90.0509
P0.5 retinaTCAAAAAAAA (2)
31.40.0314
P2.5 retinaTCAAAAAAAA (2)
35.20.0352
P4.5 retinaCCACCGCCTC (2)
CCCAAAGAGT (7)
CTGTCCGTTA (6)
TCAAAAAAAA (2)
TGACACACAG (7)
47.60.0476
P6.5 retinaCCACCGCCTC (2)
CTGTCCGTTA (6)
CTGTCCTGGG (6)
TCAAAAAAAA (2)
36.80.0368
P10.5 crx- retinaCCCAAAGAGT (7)
CTGTCCGTTA (6)
TCAAAAAAAA (2)
24.20.0242
P10.5 crx+ retinaCTGTCCTGGG (6)
TCAAAAAAAA (2)
TGACACACAG (7)
230.023
Adult retinalCTGTCCGTTA (6)
TCAAAAAAAA (2)
27.80.0278
ONLCCCAAAGAGT (7)
TCAAAAAAAA (2)
TGACACACAG (7)
210.021