Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.240396	Ppp2r5c	protein phosphatase 2, regulatory subunit B (B56), gamma isoform	12	12 F2	26931
Mm.240396	C76872	expressed sequence C76872	12		97787
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

Total 15 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge

SAGE Tags

Total 80 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CTTTGGGGAA (2) GGTGAGCTGC (2) GGTTAAAATA (2) TGAATTTTAA (2) 11.4 0.0114 Cb medulloblastoma CAGATCTGGG (2) GGTTAAAATA (2) TCAACATCTA (2) TGAATTTTAA (2) 16.1 0.0161 P8 GC+1d culture AGAGGGATGG (2) CGCGCACACA (3) CTAATTGTTC (2) GGTTAAAATA (2) TCAACATCTA (2) TGAATTTTAA (2) 13.6 0.0136 P8 GC+SHH+1d culture ACTAGGCACA (2) AGAGGGATGG (2) CTAATTGTTC (2) CTTGTTTATG GGTTAAAATA (2) TCAACATCTA (2) TGAATTTTAA (2) 15.2 0.0152 3T3 fibroblasts CGCGCACACA (3) GGTTAAAATA (2) TGCAGGGAGG (2) 14 0.014 E15 cortex CAGATCTGGG (2) CTTTGGGGAA (2) GGTGAGCTGC (2) TCAACATCTA (2) TGAATTTTAA (2) TGCAGGGAGG (2) 29.4 0.0294 P1 cortex AGAGGGATGG (2) TCAACATCTA (2) 9 0.009 Hypothalamus AAGTCTTTCT (3) CAGATCTGGG (2) CGCGCACACA (3) TGAATTTTAA (2) TGCAGGGAGG (2) 14.4 0.0144 E12.5 retina AAGTCTTTCT (3) CTAATTGTTC (2) GGTTAAAATA (2) TCAACATCTA (2) 17 0.017 E14.5 retina CGCGCACACA (3) GGTTAAAATA (2) 3.6 0.0036 E16.5 retina GGTTAAAATA (2) TCAACATCTA (2) 5.4 0.0054 E18.5 retina AAGTCTTTCT (3) CGCGCACACA (3) CTTGTTTATG TCAACATCTA (2) TGAATTTTAA (2) 18.2 0.0182 P0.5 retina AGAGGGATGG (2) CTTTGGGGAA (2) GGTTAAAATA (2) 9.9 0.0099 P2.5 retina AGAGGGATGG (2) CGCGCACACA (3) GGTTAAAATA (2) TCAACATCTA (2) TGAATTTTAA (2) 16 0.016 P4.5 retina AGAGGGATGG (2) TCAACATCTA (2) TGCAGGGAGG (2) 8 0.008 P6.5 retina GGTTAAAATA (2) TCAACATCTA (2) TGAATTTTAA (2) 8.3 0.0083 P10.5 crx- retina ACTAGGCACA (2) AGAGGGATGG (2) CTAATTGTTC (2) GGTTAAAATA (2) TGAATTTTAA (2) 31.6 0.0316 P10.5 crx+ retina ACTAGGCACA (2) AGAGGGATGG (2) CTAATTGTTC (2) CTTTGGGGAA (2) GGTTAAAATA (2) TGAATTTTAA (2) 19.1 0.0191 Adult retinal TGCAGGGAGG (2) 3.7 0.0037 ONL AAGTCTTTCT (3) AGAGGGATGG (2) GGTGAGCTGC (2) TGAATTTTAA (2) 7.6 0.0076