Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.245522 D5Wsu152eDNA segment, Chr 5, Wayne State University 152, expressed 5  5 51.0 cM  28022 
 Mm.245522 D5Ertd236eDNA segment, Chr 5, ERATO Doi 236, expressed 5  5 51.0 cM  52247 
 Mm.245522 AU017193expressed sequence AU017193 5    100798 
 Mm.245522 A130069E23RikRIKEN cDNA A130069E23 gene 5    320883 
 Mm.245522 AL118186expressed sequence AL118186 5    404570 
 Mm.245522 E330009E22RikRIKEN cDNA E330009E22 gene 5    320567 
 Mm.245522 Ankrd17ankyrin repeat domain 17 5    81702 
 Gene Ontology cellular_component unknown | endoderm development | molecular_function unknown
 Human Homolog ANKRD17[ankyrin repeat domain 17]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 170 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGCACTGTG (9)
AATAAACTCT (8)
AATTTAAAAC (3)
AATTTAAGTC (7)
ATATGAAAAT
CTTCTGTTCC (3)
GTGGCGCACG
TGAGATATGT (7)
TTGCCTTCCC
310.031
Cb medulloblastomaAAGCACTGTG (9)
AATTTAAAAC (3)
CCAGCCTTCA (4)
GTAAAAGAAA (7)
GTGGCGCACG
TGAGATATGT (7)
TTGCCTTCCC
39.20.0392
P8 GC+1d cultureAAGCACTGTG (9)
AATAAACTCT (8)
AATTTAAAAC (3)
ATATGAAAAT
CAGTTTTCCC (8)
CCAGCCTTCA (4)
CTTCTGTTCC (3)
GTGGCGCACG
TGAGATATGT (7)
TTGCCTTCCC
TTTGGTGTTT (7)
420.042
P8 GC+SHH+1d cultureAACAGTGTGC
AAGCACTGTG (9)
AATAAACTCT (8)
AATTTAAGTC (7)
ATATGAAAAT
CCAGCCTTCA (4)
CTTCTGTTCC (3)
GCAGCAGTCA
GTGGCGCACG
TGAGATATGT (7)
TTGCCTTCCC
44.40.0444
3T3 fibroblastsAAGCACTGTG (9)
CACACACATC
GTGGCGCACG
TTGCCTTCCC
98.10.0981
E15 cortexAAGCACTGTG (9)
AATAAACTCT (8)
CTTCTGTTCC (3)
GTGGCGCACG
128.50.1285
P1 cortexAAGCACTGTG (9)
CAGTTTTCCC (8)
CTTCTGTTCC (3)
GTGGCGCACG
TGAGATATGT (7)
TTGCCTTCCC
40.70.0407
HypothalamusATATGAAAAT
CCAGCCTTCA (4)
CTTCTGTTCC (3)
GTGGCGCACG
TGAGATATGT (7)
TTGCCTTCCC
23.40.0234
E12.5 retinaAACAGTGTGC
AAGCACTGTG (9)
ATATGAAAAT
CCAGCCTTCA (4)
CTTCTGTTCC (3)
GTAAAAGAAA (7)
GTGGCGCACG
TGAGATATGT (7)
TTGCCTTCCC
41.50.0415
E14.5 retinaATATGAAAAT
CCAGCCTTCA (4)
CTTCTGTTCC (3)
GTGGCGCACG
TGAGATATGT (7)
TTGCCTTCCC
52.90.0529
E16.5 retinaATATGAAAAT
CCAGCCTTCA (4)
CTTCTGTTCC (3)
GTGGCGCACG
TGAGATATGT (7)
TTGCCTTCCC
45.20.0452
E18.5 retinaAAGCACTGTG (9)
AATAAACTCT (8)
CCAGCCTTCA (4)
GGACTTTCCT
GTGGCGCACG
GTTCTAGAAG (7)
TGAGATATGT (7)
TTGCCTTCCC
32.60.0326
P0.5 retinaAATAAACTCT (8)
CAGTTTTCCC (8)
CCAGCCTTCA (4)
CTTCTGTTCC (3)
GTAAAAGAAA (7)
GTGGCGCACG
TGAGATATGT (7)
TTCATCAGCA (8)
TTGCCTTCCC
72.70.0727
P2.5 retinaAATAAACTCT (8)
AATTTAAGTC (7)
ATATGAAAAT
CCAGCCTTCA (4)
CTTCTGTTCC (3)
GTGGCGCACG
TGAGATATGT (7)
TTGCCTTCCC
52.80.0528
P4.5 retinaAAGCACTGTG (9)
ATATGAAAAT
CCAGCCTTCA (4)
CTTCTGTTCC (3)
GTAAAAGAAA (7)
GTGGCGCACG
GTTCTAGAAG (7)
TGAGATATGT (7)
TTGCCTTCCC
47.60.0476
P6.5 retinaAACCAGCTTG (7)
AAGCACTGTG (9)
AATTTAAAAC (3)
ATATGAAAAT
CCAGCCTTCA (4)
CTTCTGTTCC (3)
GCAGCAGTCA
GGACTTTCCT
GTGGCGCACG
TGAGATATGT (7)
TTCATCAGCA (8)
TTGCCTTCCC
TTTGGTGTTT (7)
83.40.0834
P10.5 crx- retinaAAACTGAAAG (2)
AAGCACTGTG (9)
AATTTAAAAC (3)
ATATGAAAAT
CCAGCCTTCA (4)
GCAGCAGTCA
GTGGCGCACG
GTTCTAGAAG (7)
TGAGATATGT (7)
TTGCCTTCCC
TTTGGTGTTT (7)
54.10.0541
P10.5 crx+ retinaAACAGTGTGC
AACCAGCTTG (7)
AACCCAGCTT
AAGCACTGTG (9)
AATAAACTCT (8)
AATTTAAAAC (3)
CACACACATC
CCAGCCTTCA (4)
CTTCTGTTCC (3)
GCAGCAGTCA
GTGGCGCACG
GTTCTAGAAG (7)
TTGCCTTCCC
65.10.0651
Adult retinalAAACTGAAAG (2)
AACCCAGCTT
AATTTAAAAC (3)
ATATGAAAAT
CCAGCCTTCA (4)
GAGCAGACCC (7)
GTGGCGCACG
TGAGATATGT (7)
TTCATCAGCA (8)
TTGCCTTCCC
TTTGGTGTTT (7)
540.054
ONLAAACTGAAAG (2)
AACCAGCTTG (7)
AACCCAGCTT
AAGCACTGTG (9)
ATATGAAAAT
CACACACATC
GGACTTTCCT
GTGGCGCACG
TGAGATATGT (7)
45.90.0459