| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | AATCAGGATG ACGCTATGGA (3) CCTGTGATCT (3) GCTGTTTTGT (3) TGTGTGAGGT
| 22.8 | 0.0228 |
| P8 GC+1d culture | ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3) TGTGTGAGGT
| 44.5 | 0.0445 |
| P8 GC+SHH+1d culture | AACCTTGTCT (3) ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3) TGTGTGAGGT
| 39.8 | 0.0398 |
| 3T3 fibroblasts | GCTGTTTTGT (3)
| 17.5 | 0.0175 |
| E15 cortex | GCTGTTTTGT (3) TGTGTGAGGT
| 39.6 | 0.0396 |
| P1 cortex | GCTGTTTTGT (3) TGTGTGAGGT
| 18.1 | 0.0181 |
| Hypothalamus | GCTGTTTTGT (3) TGTGTGAGGT
| 3.6 | 0.0036 |
| E12.5 retina | AACCTTGTCT (3) ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3) TGTGTGAGGT
| 24.4 | 0.0244 |
| E14.5 retina | AACCTTGTCT (3) ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3) TGTGTGAGGT
| 9 | 0.009 |
| E16.5 retina | AACCTTGTCT (3) CCTGTGATCT (3) GCTGTTTTGT (3) TGTGTGAGGT
| 29 | 0.029 |
| E18.5 retina | AACCTTGTCT (3) GCTGTTTTGT (3) TGTGTGAGGT
| 10.9 | 0.0109 |
| P0.5 retina | AACCTTGTCT (3) ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3) TGTGTGAGGT
| 21.5 | 0.0215 |
| P2.5 retina | AACCTTGTCT (3) ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3) TGTGTGAGGT
| 14.2 | 0.0142 |
| P4.5 retina | GCTGTTTTGT (3) TGTGTGAGGT
| 17.8 | 0.0178 |
| P6.5 retina | ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3) TGTGTGAGGT
| 10 | 0.01 |
| P10.5 crx- retina | AATCAGGATG ACGCTATGGA (3) CCTGTGATCT (3) GCTGTTTTGT (3) GTTGTTTGGA TGTGTGAGGT
| 16.9 | 0.0169 |
| P10.5 crx+ retina | AACCTTGTCT (3) ACGCTATGGA (3) GTTGTTTGGA
| 9.6 | 0.0096 |
| Adult retinal | TGTGTGAGGT
| 1.9 | 0.0019 |
| ONL | AATCAGGATG CCTGTGATCT (3) GCTGTTTTGT (3)
| 9.5 | 0.0095 |