Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.246990 A830080L01RikRIKEN cDNA A830080L01 gene 19    320200 
 Mm.246990 A830039H05RikRIKEN cDNA A830039H05 gene 19    320596 
 Mm.246990 Rtn3reticulon 3 19    20168 
 Gene Ontology endoplasmic reticulum | integral to membrane | molecular_function unknown
 Human Homolog RTN3[reticulon 3]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 183 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAGCCTTC (5)
AGAGGGTTTT (3)
ATCCACAGTG
CCGCTCCCCC
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
GGGGCTGGAG
GTGGCGCACG
TAAAGCTCCA (3)
TCACTAAGTT (5)
TGGCTGATGA (4)
TGTTGGTTGA (3)
700.07
Cb medulloblastomaAAAAGCCTTC (5)
AGAGGGTTTT (3)
GAAATCCAGT (3)
GATCCCAGAC (3)
GTGGCGCACG
TACCATAACA (3)
TCACTAAGTT (5)
TGCCATAAAA (2)
TGTGGTGTGT (3)
TGTTGGTTGA (3)
55.30.0553
P8 GC+1d cultureAGAGGGTTTT (3)
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
GGGGCTGGAG
GTCTATGGGG (3)
GTGGCGCACG
TACCATAACA (3)
TGGCTGATGA (4)
TGTTGGTTGA (3)
54.60.0546
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAGCCTTC (5)
AGAGGGTTTT (3)
GGAATCCTTG (3)
GTCTATGGGG (3)
GTGGCGCACG
TACCATAACA (3)
TGCCATAAAA (2)
TGGCTGATTA (3)
TGTTGGTTGA (3)
55.10.0551
3T3 fibroblastsAGAGGGTTTT (3)
CAGCTGCTTG (3)
GTGGCGCACG
TCACAAGTGG (2)
TGGCTGATGA (4)
TGTTGGTTGA (3)
94.60.0946
E15 cortexAGAGGGTTTT (3)
GGAATCCTTG (3)
GTGGCGCACG
143.40.1434
P1 cortexAGAGGGTTTT (3)
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
GTGGCGCACG
TACCATAAAA (4)
TACCATAACA (3)
TGTTGGTTGA (3)
68.20.0682
HypothalamusAAGAGGCCAC
AGAGGGTTTT (3)
CCGCTCCCCC
CTCTGCCCTC
GAAATCCAGT (3)
GGAATCCTTG (3)
GTGATGGGAG (3)
GTGGCGCACG
TACCATAACA (3)
TGCCATAAAA (2)
TGGCTGATGA (4)
45.10.0451
E12.5 retinaAGAGGGTTTT (3)
GGAATCCTTG (3)
GTCTATGGGG (3)
GTGGCGCACG
TACCATAACA (3)
TACCATACAA (3)
TCACAAGTGG (2)
TGGCCTGATG
TGTTGGTTGA (3)
39.50.0395
E14.5 retinaAAGAGGCCAC
AGAGGGTTTT (3)
ATCCACAGTG
GGAATCCTTG (3)
GGGGCTGGAG
GTGGCGCACG
TACCATAACA (3)
TACCATACAA (3)
TGTTGGTTGA (3)
67.50.0675
E16.5 retinaAAGAGGCCAC
AGAGGGTTTT (3)
CTCTGCCCTC
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
GTGGCGCACG
TAAAGCTCCA (3)
TACCATAAAA (4)
TACCATAACA (3)
TCACTAAGTT (5)
TGTTGGTTGA (3)
79.60.0796
E18.5 retinaAGAGGGTTTT (3)
GGAATCCTTG (3)
GGGGCTGGAG
GTGGCGCACG
TACCATAACA (3)
TACCATACAA (3)
TGTTGGTTGA (3)
30.90.0309
P0.5 retinaAGAGGGTTTT (3)
CAGCTGCTTG (3)
CTGGTCTCTC (2)
GAAATCCAGT (3)
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
GTGGCGCACG
TAAAGCTCCA (3)
TACCATAACA (3)
TACCATACAA (3)
TGGCTGATTA (3)
TGTTGGTTGA (3)
78.70.0787
P2.5 retinaAAGAGGCCAC
AGAGGGTTTT (3)
GGAATCCTTG (3)
GTGGCGCACG
TACCATAACA (3)
TCACAAGTGG (2)
TGGCCTGATG
TGTTGGTTGA (3)
54.70.0547
P4.5 retinaAGAGGGTTTT (3)
ATCCACAGTG
CAGCTGCTTG (3)
CTGGTCTCTC (2)
GGAATCCTTG (3)
GTCTATGGGG (3)
GTGGCGCACG
TACCATAACA (3)
TCACAAGTGG (2)
TGGCCTGATG
TGTTGGTTGA (3)
65.50.0655
P6.5 retinaAGAGGGTTTT (3)
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
GTCTATGGGG (3)
GTGGCGCACG
TCACAAGTGG (2)
TCACTAAGTT (5)
TGCCATAAAA (2)
TGTTGGTTGA (3)
66.80.0668
P10.5 crx- retinaAAGAGGCCAC
AGAGGGTTTT (3)
CTCTGCCCTC
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
GTGGCGCACG
TCACTAAGTT (5)
TGGCTGATTA (3)
TGTTGGTTGA (3)
70.80.0708
P10.5 crx+ retinaAAGAGGCCAC
AGAGGGTTTT (3)
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
GGGGCTGGAG
GTGATGGGAG (3)
GTGGCGCACG
TCACAAGTGG (2)
TCACTAAGTT (5)
TGTTGGTTGA (3)
65.20.0652
Adult retinalAGAGGGTTTT (3)
ATCCACAGTG
CTGGTCTCTC (2)
GGAATCCTTG (3)
GGGGCTGGAG
GTCTATGGGG (3)
GTGATGGGAG (3)
GTGGCGCACG
TAAAGCTCCA (3)
TCACTAAGTT (5)
TGGCTGATTA (3)
TGTGGTGTGT (3)
TGTTGGTTGA (3)
68.90.0689
ONLAGAGGGTTTT (3)
CTGGTCTCTC (2)
GGAATCCTTG (3)
GGGGCTGGAG
GTGGCGCACG
TACCATAACA (3)
TCACTAAGTT (5)
TGTTGGTTGA (3)
61.20.0612