Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.247203 Pcdhgb1protocadherin gamma subfamily B, 1 18    93699 
 Mm.247203 Pcdhgb2protocadherin gamma subfamily B, 2 18    93700 
 Mm.247203 Pcdhgb5protocadherin gamma subfamily B, 5 18    93702 
 Mm.247203 Pcdhgc3protocadherin gamma subfamily C, 3 18    93706 
 Mm.247203 Pcdhga2protocadherin gamma subfamily A, 2 18    93710 
 Mm.247203 Pcdhga6protocadherin gamma subfamily A, 6 18    93714 
 Mm.247203 Pcdhga7protocadherin gamma subfamily A, 7 18    93715 
 Mm.247203 Pcdhga8protocadherin gamma subfamily A, 8 18    93716 
 Mm.247203 Pcdhga11protocadherin gamma subfamily A, 11 18    93723 
 Mm.247203 Pcdhga12protocadherin gamma subfamily A, 12 18    93724 
 Gene Ontology calcium ion binding | calcium-dependent cell-cell adhesion | plasma membrane
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 113 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACCAAGGCAA (2)
CACACACACA (2)
CATTTCTACA
GTTTGGTACC (11)
TTGGAGATCT
19.50.0195
Cb medulloblastomaACCAAGGCAA (2)
CACACACACA (2)
CACAGCTCTG (20)
CAGCTTCTGG
CTGGCTCTCT
GTTTGGTACC (11)
43.90.0439
P8 GC+1d cultureACCAAGGCAA (2)
CACACACACA (2)
CAGCTTCTGG
GTTTGGTACC (11)
TCTGGAGACA (10)
TTGATGTCCA
32.90.0329
P8 GC+SHH+1d cultureAAGGAAAAAA
CACACACACA (2)
GTTTGGTACC (11)
TCTGGAGACA (10)
TGACATTAGT
TTGGAGATCT
270.027
3T3 fibroblastsCACACACACA (2)
GTTTGGTACC (11)
TCTGGAGACA (10)
31.50.0315
E15 cortexACCAAGGCAA (2)
ATTTAGACTC
CACACACACA (2)
GTTTGGTACC (11)
TCTGGAGACA (10)
TTTTAAAACT (11)
TTTTGGTGGT
39.30.0393
P1 cortexAAGGAAAAAA
CACACACACA (2)
CACAGCTCTG (20)
TCTGGAGACA (10)
72.70.0727
HypothalamusAGATTTACAT
ATTTAGACTC
CACACACACA (2)
TCGTTGTGGG (11)
TCTGGAGACA (10)
TGACATTAGT
TTTTAAAACT (11)
106.80.1068
E12.5 retinaAAGGAAAAAA
ATGGGGCTTT (12)
CACACACACA (2)
TTTTGGTGGT
13.20.0132
E14.5 retinaAAACCGGAAA (10)
ACCAAGGCAA (2)
CACACACACA (2)
34.60.0346
E16.5 retinaCACACACACA (2)
GTTTGGTACC (11)
TCTGGAGACA (10)
TTTTAAAACT (11)
18.10.0181
E18.5 retinaACCAAGGCAA (2)
ATGGGGCTTT (12)
CACACACACA (2)
CAGCTTCTGG
GTTTGGTACC (11)
TCGTTGTGGG (11)
TCTGGAGACA (10)
TTTTAAAACT (11)
18.10.0181
P0.5 retinaACCAAGGCAA (2)
AGATTTACAT
CACACACACA (2)
GTTTGGTACC (11)
TCTGGAGACA (10)
TTTTAAAACT (11)
35.40.0354
P2.5 retinaAAACCGGAAA (10)
AAGGAAAAAA
ACCAAGGCAA (2)
CACACACACA (2)
CATTTCTACA
TCGTTGTGGG (11)
TTGATGTCCA
TTTTAAAACT (11)
37.10.0371
P4.5 retinaCACACACACA (2)
TCTGGAGACA (10)
TGACATTAGT
17.80.0178
P6.5 retinaAAACCGGAAA (10)
ACCAAGGCAA (2)
CACACACACA (2)
GTTTGGTACC (11)
TCTGGAGACA (10)
TTAAAATACC (10)
TTGATGTCCA
21.80.0218
P10.5 crx- retinaAGATTTACAT
ATGGGGCTTT (12)
ATTTAGACTC
CACACACACA (2)
CATTTCTACA
CTGGCTCTCT
GTTTGGTACC (11)
TCTGGAGACA (10)
TGACATTAGT
26.30.0263
P10.5 crx+ retinaACCAAGGCAA (2)
ATGGGGCTTT (12)
CACACACACA (2)
CATTTCTACA
CTGGCTCTCT
17.20.0172
Adult retinalAAGGAAAAAA
ACCAAGGCAA (2)
ATGGGGCTTT (12)
CACACACACA (2)
CACAGCTCTG (20)
CTGGCTCTCT
GTTTGGTACC (11)
TCTGGAGACA (10)
31.80.0318
ONLAAGGAAAAAA
ACCAAGGCAA (2)
CACACACACA (2)
TTAAAATACC (10)
40.20.0402