Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.250641	2900003A17Rik	RIKEN cDNA 2900003A17 gene	12		72877
Mm.250641	C330002I19Rik	RIKEN cDNA C330002I19 gene	12		77480
Gene Ontology	DNA binding | integral to membrane | regulation of transcription, DNA-dependent | transcription factor activity
Human Homolog	KIDINS220[likely homolog of rat kinase D-interacting substance of 220 kDa]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 190 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAAAAAAA (2) AAGAAAAAAA (3) AGAGGAGAGG (2) CAAAAAAAAA (2) CAGCCACCCA (3) CCAAAAAAAA (3) CGCCACCACA (3) CTGTTTTTAC (2) GATAGATAAT GTTTTAAAAA (3) TGATGGGTGC 314.6 0.3146 Cb medulloblastoma AAAAAAAAAA (2) AAAATTTTCA (3) AAGAAAAAAA (3) AGAGGAGAGG (2) CAAAAAAAAA (2) CCAAAAAAAA (3) CGCCACCACA (3) GATAGATAAT GGCACAGCAA (2) GTTTTAAAAA (3) TGATGGGTGC 1070.6 1.0706 P8 GC+1d culture AAAAAAAAAA (2) AAGAAAAAAA (3) CAAAAAAAAA (2) CCAAAAAAAA (3) CGCCACCACA (3) GATAGATAAT GTTTTAAAAA (3) TGATGGGTGC 315.1 0.3151 P8 GC+SHH+1d culture AAAAAAAAAA (2) AAGAAAAAAA (3) CAAAAAAAAA (2) CCAAAAAAAA (3) CCAAAAAAAC (2) CGCCACCACA (3) CTGTTTTTAC (2) GATAGATAAT GGAGCCCTTT (2) GTTTTAAAAA (3) TGATGGGTGC 422.7 0.4227 3T3 fibroblasts AAAAAAAAAA (2) CAGCCACCCA (3) CGCCACCACA (3) GATAGATAAT TGATGGGTGC 49 0.049 E15 cortex AAAAAAAAAA (2) AAGAAAAAAA (3) AGAGGAGAGG (2) CAAAAAAAAA (2) CAGCCACCCA (3) CCAAAAAAAA (3) CGCCACCACA (3) GATAGATAAT GGGAATCTGC (2) GTTTTAAAAA (3) TGATGGGTGC 316.3 0.3163 P1 cortex AAAAAAAAAA (2) AAGAAAAAAA (3) CAAAAAAAAA (2) CCAAAAAAAA (3) CGCCACCACA (3) CTGTTTTTAC (2) GATAGATAAT 336.2 0.3362 Hypothalamus AAAAAAAAAA (2) AAAATTTTCA (3) AAGAAAAAAA (3) AGAGGAGAGG (2) CAAAAAAAAA (2) CAGCTCTCAG CCAAAAAAAA (3) GATAGATAAT GGGAATCTGC (2) TCCTGTAGCA (2) 231.7 0.2317 E12.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAGAAAAAAA (3) CAAAAAAAAA (2) CCAAAAAAAA (3) CCAAAAAAAC (2) GATAGATAAT GTTTTAAAAA (3) TGATGGGTGC 208.5 0.2085 E14.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAGAAAAAAA (3) ATCTTTAACA (2) CAAAAAAAAA (2) CAGCCTCCTC (2) CAGCTCTCAG CCAAAAAAAA (3) CGCCACCACA (3) GATAGATAAT GTTTTAAAAA (3) TGATGGGTGC 158.3 0.1583 E16.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAAATGCTCA (2) AAAATTTTCA (3) AAGAAAAAAA (3) CAAAAAAAAA (2) CAGCCTCCTC (2) CAGCTCTCAG CCAAAAAAAA (3) CGCCACCACA (3) CTGTTTTTAC (2) GATAGATAAT GGAGCCCTTT (2) GTTTTAAAAA (3) 119.5 0.1195 E18.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAAATTTTCA (3) AAGAAAAAAA (3) ATCTTTAACA (2) CAAAAAAAAA (2) CCAAAAAAAA (3) CGCCACCACA (3) GATAGATAAT GGCACAGCAA (2) GTTTTAAAAA (3) TGATGGGTGC 534.8 0.5348 P0.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAGAAAAAAA (3) CAAAAAAAAA (2) CCAAAAAAAA (3) CGCCACCACA (3) GATAGATAAT GGAGCCCTTT (2) TGATGGGTGC 304.3 0.3043 P2.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAGAAAAAAA (3) CAAAAAAAAA (2) CCAAAAAAAA (3) CGCCACCACA (3) CTGTTTTTAC (2) GATAGATAAT GTTTTAAAAA (3) TGATGGGTGC 468.2 0.4682 P4.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAGAAAAAAA (3) CAAAAAAAAA (2) CAGCTCTCAG CCAAAAAAAA (3) CGCCACCACA (3) GATAGATAAT GTTTTAAAAA (3) TGATGGGTGC 406.1 0.4061 P6.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAGAAAAAAA (3) CAAAAAAAAA (2) CCAAAAAAAA (3) CGCCACCACA (3) GATAGATAAT GTTTTAAAAA (3) TGATGGGTGC 371.7 0.3717 P10.5 crx- retina AAAAAAAAAA (2) AAAATGCTCA (2) AAAATTTTCA (3) AAGAAAAAAA (3) ATCTTTAACA (2) CAAAAAAAAA (2) CAGCTCTCAG CCAAAAAAAA (3) CTGTTTTTAC (2) GATAGATAAT TGATGGGTAC (3) TGATGGGTGC 113.6 0.1136 P10.5 crx+ retina AAAAAAAAAA (2) AAAATGCTCA (2) AAAATTTTCA (3) AAGAAAAAAA (3) CAAAAAAAAA (2) CCAAAAAAAA (3) CCAAAAAAAC (2) GATAGATAAT 186.3 0.1863 Adult retinal AAAAAAAAAA (2) AAAATTTTCA (3) AAGAAAAAAA (3) CAAAAAAAAA (2) CAGCCTCCTC (2) CCAAAAAAAA (3) CGCCACCACA (3) CTGTTTTTAC (2) GATAGATAAT TGATGGGTGC 141 0.141 ONL AAAAAAAAAA (2) AAAATTTTCA (3) AAGAAAAAAA (3) CAAAAAAAAA (2) CCAAAAAAAA (3) CGCCACCACA (3) GATAGATAAT GGGAATCTGC (2) GTTTTAAAAA (3) 168.4 0.1684