Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.258140 Dnajc7DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 7 11  11 60.0 cM  56354 
 Mm.258140 D630018G21RikRIKEN cDNA D630018G21 gene 11    319789 
 Mm.258140 C79646expressed sequence C79646 11    97719 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 77 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACATTTACAA (2)
CCTTTCCAGG (4)
GACACAGAGC (4)
GACCGTGCCC (4)
GTTAAACCAA (3)
GTTAAAGCAG (3)
TCCCTGTGTA (3)
TTAAAAAAGA (2)
21.10.0211
Cb medulloblastomaACATTTACAA (2)
ACCCAGCAGC
GACACAGAGC (4)
GACCGTGCCC (4)
TTAAAAAAGA (2)
20.70.0207
P8 GC+1d cultureAAACCTGGGG (3)
ACATTTACAA (2)
ACCCAGCAGC
AGCCCCTGCC (3)
CATTTAATCC
GTTAAAGCAG (3)
TCCCTGTGTA (3)
TTAAAAAAGA (2)
21.50.0215
P8 GC+SHH+1d cultureACATTTACAA (2)
ACCCAGCAGC
CCTTTCCAGG (4)
TCCCTGTGTA (3)
TTAAAAAAGA (2)
8.20.0082
P1 cortexGTTAAACCAA (3)
4.50.0045
HypothalamusACATTTACAA (2)
TCCCTGTGTA (3)
3.60.0036
E12.5 retinaACATTTACAA (2)
CATTTAATCC
TCCCTGTGTA (3)
TTAAAAAAGA (2)
16.90.0169
E14.5 retinaACATTTACAA (2)
GTTAAAGCAG (3)
TCCCTGTGTA (3)
TTAAAAAAGA (2)
19.90.0199
E16.5 retinaACATTTACAA (2)
CATTTAATCC
CCTTTCCAGG (4)
GACACAGAGC (4)
GTTAAACCAA (3)
GTTAAAGCAG (3)
12.60.0126
E18.5 retinaACATTTACAA (2)
AGCCCCTGCC (3)
TTAAAAAAGA (2)
9.10.0091
P0.5 retinaACATTTACAA (2)
GACACAGAGC (4)
TCCCTGTGTA (3)
TTAAAAAAGA (2)
9.90.0099
P2.5 retinaACATTTACAA (2)
CCTTTCCAGG (4)
GTTAAAGCAG (3)
5.40.0054
P4.5 retinaAAACCTGGGG (3)
ACATTTACAA (2)
GTTAAACCAA (3)
TCCCTGTGTA (3)
TTAAAAAAGA (2)
23.80.0238
P6.5 retinaAAACCTGGGG (3)
ACATTTACAA (2)
CCTTTCCAGG (4)
TCCCTGTGTA (3)
TTAAAAAAGA (2)
250.025
P10.5 crx- retinaACATTTACAA (2)
AGCCCCTGCC (3)
TCCCTGTGTA (3)
TTAAAAAAGA (2)
18.60.0186
P10.5 crx+ retinaACATTTACAA (2)
GTTAAACCAA (3)
TCCCTGTGTA (3)
TTAAAAAAGA (2)
15.30.0153
Adult retinalACATTTACAA (2)
TCCCTGTGTA (3)
TTAAAAAAGA (2)
7.50.0075
ONLACATTTACAA (2)
TCCCTGTGTA (3)
TTAAAAAAGA (2)
9.50.0095