Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.258771 4930553P13RikRIKEN cDNA 4930553P13 gene 17    75264 
 Mm.258771 9630010G10RikRIKEN cDNA 9630010G10 gene 17    399612 
 Mm.258771 Ptprsprotein tyrosine phosphatase, receptor type, S 17  17 D (17 33.8 cM)  19280 
 Gene Ontology cell adhesion | extracellular space | hydrolase activity | integral to membrane | phosphoprotein phosphatase activity | plasma membrane | prenylated protein tyrosine phosphatase activity | protein amino acid dephosphorylation | protein binding | protein-tyrosine-phosphatase activity | receptor activity | transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase signaling pathway
 Human Homolog PTPRS[protein tyrosine phosphatase, receptor type, S]
 Clusters 
   Neighbors    

Total 14 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 188 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGTAGACGAG (3)
CAGGCCACAC (4)
GAGGACCTGG (5)
GGAGATTTTA (6)
GGCCCCGCCC (3)
GTGCAGACAG (4)
TCCCTGTAGT (4)
TGAATGGTGC (3)
TGGGAAAGAT (3)
TGTAATAAGA (3)
TGTGGTGGAG (3)
200.80.2008
Cb medulloblastomaCACTGCCCAC (2)
CAGGCCACAC (4)
GAGGACCTGG (5)
GGAGATTTTA (6)
GGCCCCGCCC (3)
GGGAGAAGAA (3)
TCCCTGTAGT (4)
TGAATGGTGC (3)
TGGGAAAGAT (3)
TGTGGTGGAG (3)
300.50.3005
P8 GC+1d cultureAGTAGACGAG (3)
CAGGCCACAC (4)
GAAGGGAATG
GAGGACCTGG (5)
GGAGATTTTA (6)
GGCCCCGCCC (3)
TCCCTGTAGT (4)
TGAATGGTGC (3)
TGGGAAAGAT (3)
TGTGGTGGAG (3)
143.80.1438
P8 GC+SHH+1d cultureCAGGCCACAC (4)
CTGCCCCAGC
GAGGACCTGG (5)
GGAGATTTTA (6)
GGCCCCGCCC (3)
GGCTCTGCCA (2)
GGGAGAAGAG (4)
GGGATGGGGG (3)
GTGCAGACAG (4)
TCCCTGTAGT (4)
TGAATGGTGC (3)
TGGGAAAGAT (3)
TGTAATAAGA (3)
TGTGGTGGAG (3)
1980.198
3T3 fibroblastsCAGGCCACAC (4)
CTCTGTGCTG (4)
GAGGACCTGG (5)
GGCCCCGCCC (3)
GGCTCTGCCA (2)
TCCCTGTAGT (4)
TGGGAAAGAT (3)
TGTGGTGGAG (3)
182.20.1822
E15 cortexCAGGCCACAC (4)
GAGGACCTGG (5)
GGAGATTTTA (6)
GGCCCCGCCC (3)
GGCTCTGCCA (2)
TGGGAAAGAT (3)
TGTGGTGGAG (3)
1680.168
P1 cortexCAGGCCACAC (4)
GAGGACCTGG (5)
GGAGATTTTA (6)
TCCCTGTAGT (4)
TGGGAAAGAT (3)
TGTAATAAGA (3)
90.80.0908
HypothalamusCAGGCCACAC (4)
CTCTGTGCTG (4)
GAGGACCTGG (5)
GGAGATTTTA (6)
GGCCCCGCCC (3)
TCCCTGTAGT (4)
TGAATGGTGC (3)
TGGGAAAGAT (3)
TGTGGTGGAG (3)
180.90.1809
E12.5 retinaCAGGCCACAC (4)
GAGGACCTGG (5)
GGCCCCGCCC (3)
GGCTCTGCCA (2)
GGGAGAAGAG (4)
TCCCTGTAGT (4)
TGAATGGTGC (3)
TGGGAAAGAT (3)
TGTAATAAGA (3)
TGTGGTGGAG (3)
1540.154
E14.5 retinaAGTAGACGAG (3)
CAGGCCACAC (4)
GAGGACCTGG (5)
GGAGATTTTA (6)
GTGCAGACAG (4)
TCCCTGTAGT (4)
TGGGAAAGAT (3)
TGTGGTGGAG (3)
163.80.1638
E16.5 retinaAGTAGACGAG (3)
CAGGCCACAC (4)
GAAGGGAATG
GAGGACCTGG (5)
GGCCCCGCCC (3)
GTGCAGACAG (4)
TCCCTGTAGT (4)
TGAATGGTGC (3)
TGGGAAAGAT (3)
177.40.1774
E18.5 retinaAGTAGACGAG (3)
CAGGCCACAC (4)
GAGGACCTGG (5)
GGCCCCGCCC (3)
GGCTCTGCCA (2)
GGGAGAAGAG (4)
TCCCTGTAGT (4)
TGAATGGTGC (3)
TGGGAAAGAT (3)
TGTGGTGGAG (3)
156.30.1563
P0.5 retinaCAGGCCACAC (4)
CTCTGTGCTG (4)
CTGCCCCAGC
GAGGACCTGG (5)
GGCCCCGCCC (3)
GTGCAGACAG (4)
TCCCTGTAGT (4)
TGAATGGTGC (3)
TGGGAAAGAT (3)
TGTGGTGGAG (3)
TTGTGGTTAT (3)
155.30.1553
P2.5 retinaCACTGCCCAC (2)
CAGGCCACAC (4)
CTCTGTGCTG (4)
GAGGACCTGG (5)
GGCCCCGCCC (3)
GGGATGGGGG (3)
GTGCAGACAG (4)
TCCCTGTAGT (4)
TGAATGGTGC (3)
TGGGAAAGAT (3)
TGTAATAAGA (3)
TGTGGTGGAG (3)
162.10.1621
P4.5 retinaCAGGCCACAC (4)
CTCTGTGCTG (4)
CTGCCCCAGC
GAGGACCTGG (5)
GGCCCCGCCC (3)
GGGAGAAGAG (4)
GGGATGGGGG (3)
TCCCTGTAGT (4)
TGAATGGTGC (3)
TGGGAAAGAT (3)
TGTGGTGGAG (3)
TTGTGGTTAT (3)
172.60.1726
P6.5 retinaAGGACCTGGG
CAGGCCACAC (4)
CTCTGTGCTG (4)
GAAGGGAATG
GAGGACCTGG (5)
TCCCTGTAGT (4)
TGAATGGTGC (3)
TGGGAAAGAT (3)
TGTAATAAGA (3)
TGTGGTGGAG (3)
TTGTGGTTAT (3)
218.40.2184
P10.5 crx- retinaAGGACCTGGG
CAGGCCACAC (4)
CTCTGTGCTG (4)
GAGGACCTGG (5)
GGCCCCGCCC (3)
GGGAGAAGAG (4)
TCCCTGTAGT (4)
TGAATGGTGC (3)
TGGGAAAGAT (3)
TGTGGTGGAG (3)
239.80.2398
P10.5 crx+ retinaCAGGCCACAC (4)
GAGGACCTGG (5)
GGCCCCGCCC (3)
TCCCTGTAGT (4)
TGAATGGTGC (3)
TGGGAAAGAT (3)
TGTGGTGGAG (3)
2480.248
Adult retinalCAGGCCACAC (4)
GAGGACCTGG (5)
GGCTCTGCCA (2)
TCCCTGTAGT (4)
TGGGAAAGAT (3)
TGTGGTGGAG (3)
1630.163
ONLAGGACCTGGG
CACTGCCCAC (2)
CAGGCCACAC (4)
GAGGACCTGG (5)
GGGAGAAGAA (3)
TCCCTGTAGT (4)
TGTGGTGGAG (3)
112.90.1129