| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2) TTCAGATCCC (3)
| 22.8 | 0.0228 |
| Cb medulloblastoma | AAAAAAAACA TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2) TATGATGAGA
| 36.9 | 0.0369 |
| P8 GC+1d culture | GTTTGTGACA TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2) TATGATGAGA
| 28.5 | 0.0285 |
| P8 GC+SHH+1d culture | TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2)
| 23.4 | 0.0234 |
| P1 cortex | TATGATGAAA (2)
| 4.5 | 0.0045 |
| Hypothalamus | GTTTGTGACA TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2) TATGATGAGA
| 50.7 | 0.0507 |
| E12.5 retina | TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2) TATGATGAGA
| 26.4 | 0.0264 |
| E14.5 retina | CCACCACATC TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2) TATGATGAGA
| 38.2 | 0.0382 |
| E16.5 retina | AAAAAAAACA ACATTTTTGT (3) CCACCACATC TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2) TATGATGAGA
| 21.7 | 0.0217 |
| E18.5 retina | AAAAAAAACA TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2) TATGATGAGA
| 43.6 | 0.0436 |
| P0.5 retina | TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2) TATGATGAGA TTCAGATCCC (3)
| 19.7 | 0.0197 |
| P2.5 retina | TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2)
| 31.6 | 0.0316 |
| P4.5 retina | AAAAAAAACA ACATTTTTGT (3) TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2)
| 41.6 | 0.0416 |
| P6.5 retina | TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2) TATGATGAGA
| 41.7 | 0.0417 |
| P10.5 crx- retina | CCACCACATC GTTTGTGACA TATGATGAAA (2)
| 9.4 | 0.0094 |
| P10.5 crx+ retina | AAAAAAAACA TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2)
| 23 | 0.023 |
| Adult retinal | ACATTTTTGT (3) CCACCACATC TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2) TATGATGAGA TTCAGATCCC (3)
| 24.2 | 0.0242 |
| ONL | AAAAAAAACA TATGAAAAAA (2) TATGATGAAA (2) TATGATGAGA
| 21.1 | 0.0211 |