Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.26381 Spg3aspastic paraplegia 3A homolog (human) 12    73991 
 Gene Ontology DNA binding | GTP binding | GTPase activity | immune response | integral to membrane | nucleus
 Human Homolog SPG3A[spastic paraplegia 3A (autosomal dominant)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 102 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGAGTGCTTAT (3)
GCAAGACGTT (3)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TTAGAAGTGA (3)
22.80.0228
Cb medulloblastomaGGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TACAAAACAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
145.60.1456
P8 GC+1d cultureCTGACTGGGT (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TACAAAACAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
24.90.0249
P8 GC+SHH+1d cultureCTGACTGGGT (2)
GAGTGCTTAT (3)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TATTTATTAT (2)
TGGGAGAGGG
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
25.90.0259
3T3 fibroblastsTTAGAAGTGA (3)
3.50.0035
E15 cortexGGAAAAAAAA (2)
TTAGAAGTGA (3)
14.80.0148
P1 cortexGGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
GTTATTTGTC
TATTTATTAT (2)
TTAGAAGTGA (3)
22.50.0225
HypothalamusGCAAGACGTT (3)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TACAAAACAA (2)
TATTTATTAT (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
68.80.0688
E12.5 retinaGCAAGACGTT (3)
GGAAAAAAAA (2)
TACAAAACAA (2)
TTAGAAGTGA (3)
13.20.0132
E14.5 retinaCTGACTGGGT (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
25.40.0254
E16.5 retinaGAGTGCTTAT (3)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TACAAAACAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
21.70.0217
E18.5 retinaGGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
GTTATTTGTC
TACAAAACAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
47.30.0473
P0.5 retinaGGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TGGGAGAGGG
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
31.40.0314
P2.5 retinaGGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TACAAAACAA (2)
TATTTATTAT (2)
TTAGAAGTGA (3)
31.70.0317
P4.5 retinaGCAAGACGTT (3)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TGGGAGAGGG
TTAGAAGTGA (3)
35.70.0357
P6.5 retinaGAGTGCTTAT (3)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TATTTATTAT (2)
TGGGAGAGGG
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
43.40.0434
P10.5 crx- retinaGGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TACAAAACAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
25.90.0259
P10.5 crx+ retinaGCAAGACGTT (3)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TACAAAACAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
51.90.0519
Adult retinalCTGACTGGGT (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TACAAAACAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
520.052
ONLGGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TACAAAACAA (2)
49.70.0497