Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.26730	Hp	haptoglobin	8	8 55.0 cM	15439
Gene Ontology	acute-phase response | chymotrypsin activity | extracellular | extracellular space | hemoglobin binding | proteolysis and peptidolysis | trypsin activity
Human Homolog	HP[haptoglobin]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 122 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AATAAAAAAA (3) ACAGCTGCCC CCTTTCTGCT (2) CTGCCTTGTT (3) CTGCTGGTGG (2) CTGCTGTGGC (2) GCCAGGGCCA (2) GGAGGGAAGG (4) 34.3 0.0343 Cb medulloblastoma AATAAAAAAA (3) CCTTTCTGCT (2) CTGCCTTGTT (3) CTGCTGGTGG (2) GCCAGGGCCA (2) 32.3 0.0323 P8 GC+1d culture AATAAAAAAA (3) CCTTTCTGCT (2) CTGCCTTGTT (3) CTGCTGGTGG (2) GAAGAGGGGG (2) GCCAGGGCCA (2) GCCTGCCCCG (4) GGAGGGAGGA (2) 41.1 0.0411 P8 GC+SHH+1d culture AATAAAAAAA (3) ACAGCTGCCC CCTTTCTGCT (2) CTGCCTTGTT (3) CTGCTGGTGG (2) GAAGAGGGGG (2) GCCAGGGCCA (2) GGAGGGAGGA (2) 25.8 0.0258 3T3 fibroblasts AATAAAAAAA (3) CTGCTGGTGG (2) GCCAGGGCCA (2) GCCTATCTGG (2) 70.1 0.0701 E15 cortex AATAAAAAAA (3) CTGCTGGTGG (2) CTTGCCTGGG GCCAGGGCCA (2) GCCTGCCCCG (4) GCCTTTTGCC 49.3 0.0493 P1 cortex CTGCTGGTGG (2) CTGCTGTGGC (2) GCCAGGGCCA (2) 13.5 0.0135 Hypothalamus AATAAAAAAA (3) CCTTTCTGCT (2) CTGCTGGTGG (2) GCCAGGGCCA (2) GGAGGGAGGA (2) 23.4 0.0234 E12.5 retina AATAAAAAAA (3) CCTTTCTGCT (2) CTGCTGTGGC (2) 11.4 0.0114 E14.5 retina AATAAAAAAA (3) CCTTTCTGCT (2) CTGCTGGTGG (2) GCCAGGGCCA (2) GGAGGGAGGA (2) 18.2 0.0182 E16.5 retina ACAGCTGCCC CCTTTCTGCT (2) CTGCCTTGTT (3) GCCAGGGCCA (2) GCCTGCCCCG (4) 18 0.018 E18.5 retina AATAAAAAAA (3) CCTTTCTGCT (2) CTGCCTTGTT (3) CTGCTGGTGG (2) GCCAGGGCCA (2) GCCTGCCCCG (4) 16.2 0.0162 P0.5 retina ACAGCTGCCC CCTTTCTGCT (2) CTGCCTTGTT (3) CTGCTGGTGG (2) CTTGCCTGGG GCCAGGGCCA (2) GCCTGCCCCG (4) GCCTTTTGCC GGAGGGAAGG (4) GGAGGGAGGA (2) 37.6 0.0376 P2.5 retina CCTTTCTGCT (2) CTGCTGGTGG (2) GCCAGGGCCA (2) GCCTGCCCCG (4) GGAGGGAAGG (4) GGAGGGAGGA (2) 21.2 0.0212 P4.5 retina AATAAAAAAA (3) CCTTTCTGCT (2) CTGCCTTGTT (3) CTGCTGGTGG (2) GCCAGGGCCA (2) GCCTGCCCCG (4) 18 0.018 P6.5 retina AATAAAAAAA (3) CCTTTCTGCT (2) CTGCTGGTGG (2) GCCAGGGCCA (2) GCCTGCCCCG (4) GCCTTTTGCC GGAGGGAGGA (2) 26.7 0.0267 P10.5 crx- retina CCTTTCTGCT (2) CTGCTGGTGG (2) CTGCTGTGGC (2) GCCAGGGCCA (2) GCCTATCTGG (2) GCCTTTTGCC 31.7 0.0317 P10.5 crx+ retina ACAGCTGCCC CCTTTCTGCT (2) CTGCCTTGTT (3) CTGCTGGTGG (2) GAAGAGGGGG (2) GCCAGGGCCA (2) 24.9 0.0249 Adult retinal AATAAAAAAA (3) CCTTTCTGCT (2) CTGCTGGTGG (2) GCCAGGGCCA (2) GCCTATCTGG (2) GCCTGCCCCG (4) GCCTTTTGCC GGAGGGAAGG (4) GGAGGGAGGA (2) 37.4 0.0374 ONL CCTTTCTGCT (2) CTGCTGGTGG (2) GCCAGGGCCA (2) GCCTGCCCCG (4) GCCTTTTGCC GGAGGGAAGG (4) 32.5 0.0325