Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.267377 Scd1stearoyl-Coenzyme A desaturase 1 19  19 43.0 cM  20249 
 Gene Ontology endoplasmic reticulum | fatty acid biosynthesis | integral to membrane | iron ion binding | membrane | oxidoreductase activity | stearoyl-CoA 9-desaturase activity
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 118 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAACCATTG
CCTGCTTCCT (2)
CTGCCCTGGG (2)
GATCCCAAAT (4)
GCGTTCCAGA (2)
TTTGACAATG (4)
16.20.0162
Cb medulloblastomaAAAACCATTG
CTGCCCTGGG (2)
GATCCCAAAT (4)
GCTGCCCTGG (2)
GTGTCCAGCT (2)
TTTGACAATG (4)
27.60.0276
P8 GC+1d cultureAGAAAATGCT (2)
CCCCCACAAA
CCTGCTTCCT (2)
CTGCCCTGGG (2)
GATCCCAAAT (4)
GCTGCCCTGG (2)
GTGTCCAGCT (2)
17.10.0171
P8 GC+SHH+1d cultureCCCCCACAAA
CTGCCCTGGG (2)
GATCCCAAAT (4)
GCTGCCCTGG (2)
GTGTCCAGCT (2)
TCTGACTGAA
TTACCCTTCC
24.60.0246
3T3 fibroblastsAAAACCATTG
GCTGCCCTGG (2)
GTGTCCAGCT (2)
TTACCCTTCC
140.014
E15 cortexCCTGCTTCCT (2)
CTGCCCTGGG (2)
GCTGCCCTGG (2)
24.70.0247
P1 cortexCCTGCTTCCT (2)
GCGTTCCAGA (2)
90.009
HypothalamusAAAACCATTG
AGAAAATGCT (2)
CCTGCTTCCT (2)
CTGCCCTGGG (2)
GCGTTCCAGA (2)
GCTGCCCTGG (2)
GTGTCCAGCT (2)
TAGAATCAGG
TCTGACCTGA (2)
16.20.0162
E12.5 retinaAAAACCATTG
CTGCCCTGGG (2)
GATCCCAAAT (4)
GCGTTCCAGA (2)
TAGAATCAGG
TCTGACCTGA (2)
TTTGACAATG (4)
20.80.0208
E14.5 retinaCCTGCTTCCT (2)
CTGCCCTGGG (2)
GATCCCAAAT (4)
GCGTTCCAGA (2)
GCTGCCCTGG (2)
GTGTCCAGCT (2)
TCTGACCTGA (2)
TCTGACTGAA
180.018
E16.5 retinaAGAAAATGCT (2)
CTGCCCTGGG (2)
GATCCCAAAT (4)
GCGTTCCAGA (2)
GCTGCCCTGG (2)
GTGTCCAGCT (2)
21.70.0217
E18.5 retinaGATCCCAAAT (4)
5.50.0055
P0.5 retinaAGAAAATGCT (2)
CATCTAGAGG
CCTGCTTCCT (2)
GATCCCAAAT (4)
GCGTTCCAGA (2)
GCTGGGGGTG
TCTGACTGAA
TTACCCTTCC
41.40.0414
P2.5 retinaCATCTAGAGG
CTGCCCTGGG (2)
GATCCCAAAT (4)
GCGTTCCAGA (2)
GCTGCCCTGG (2)
TCTGACCTGA (2)
TCTGACTGAA
TTACCCTTCC
26.50.0265
P4.5 retinaCATCTAGAGG
GATCCCAAAT (4)
GCGTTCCAGA (2)
GTGTCCAGCT (2)
100.01
P6.5 retinaAAAACCATTG
CCTGCTTCCT (2)
CTGCCCTGGG (2)
GATCCCAAAT (4)
GCGTTCCAGA (2)
GCTGGGGGTG
GTGTCCAGCT (2)
TCTGACTGAA
23.50.0235
P10.5 crx- retinaAAAACCATTG
AGAAAATGCT (2)
CTGCCCTGGG (2)
GATCCCAAAT (4)
GTGTCCAGCT (2)
TCTGACTGAA
22.30.0223
P10.5 crx+ retinaCATCTAGAGG
CTGCCCTGGG (2)
GATCCCAAAT (4)
GTGTCCAGCT (2)
15.40.0154
Adult retinalCATCTAGAGG
CCTGCTTCCT (2)
CTGCCCTGGG (2)
GATCCCAAAT (4)
GCGTTCCAGA (2)
GCTGCCCTGG (2)
GTGTCCAGCT (2)
TAGAATCAGG
22.50.0225
ONLAGAAAATGCT (2)
CTGCCCTGGG (2)
GATCCCAAAT (4)
GCTGGGGGTG
GTGTCCAGCT (2)
TCTGACCTGA (2)
15.20.0152