Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.268737	Csnb	casein beta	5	5 44.91 cM	12991
Gene Ontology	extracellular | extracellular space | transport | transporter activity
Human Homolog	CSN2[casein beta]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 309 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CTACAAGAAA CTCACAAAAA CTGCACCAAT CTTACCAAAA CTTATCCTCA GAAGAAAGAA (2) GAAGCAAAGA (2) GACTATATAT GGAAGAAAGA (2) GTACAAAAAT GTCAAAAAGA (2) GTCCCAAAAT TATTATTTGG (3) TCCCCAGCCT (2) TTATTTCTTC (2) TTCCAATCTT TTTCCTTATT (6) TTTGAGAGGC 66.8 0.0668 Cb medulloblastoma CTACAAAAAA CTACCAAAAA (2) CTGCACCAAT CTTATCCTCA GAAGCAAAGA (2) GACTATATAT GAGAAAAGGA (3) GCTTCTCATT (2) GGAAAATGCT GGAAGAAAGA (2) GGGAGAAGAA (3) GTACAAAAAT GTCAAAAAGA (2) TATTATTTGG (3) TCAATAAAAT TTCCTCAGCA 122.3 0.1223 P8 GC+1d culture CATCCACAAA (2) CTACAAAAAA CTACCAAAAA (2) CTGCACCAAT CTTATCCTCA GAAGAAAGAA (2) GAAGCAAAGA (2) GACTATATAT GAGAAAAGGA (3) GCATTCATTT (2) GCTTCTCATT (2) GGAAAGGTGA GGAAGAAAGA (2) GGAAGACAAG GTACAAAAAT GTCCCAAAAT TATTATTTGG (3) TCAGTAAAGT (3) TTCCTCAGCA TTTCCTTATT (6) TTTGAGAGGC 95.5 0.0955 P8 GC+SHH+1d culture CATCCACAAA (2) CCAAGAGCAA CCTACAAGAA (2) CCTTCAAATT (3) CTACAAAAAA CTACCAAAAA (2) CTCACAAAAA CTGCACCAAT CTTACCAAAA CTTATCCTCA GAAAAAGGGG GAAGAAAGAA (2) GAAGCAAAGA (2) GACTATATAT GAGAAAAGGA (3) GGAAAATGCT GGAAAGGTGA GTACAAAAAT GTCAAAAAGA (2) GTCATCAACA TATTATTTGG (3) TCAATAAAAT TCAGTAAAGT (3) TTATTTCTTC (2) TTTCCTTATT (6) TTTGAGAGGC 89.4 0.0894 3T3 fibroblasts CTTATCCTCA GAAGCAAAGA (2) GCTTCTCATT (2) GTACAAAAAT TTTGAGAGGC 35 0.035 E15 cortex GAAGCAAAGA (2) GAGAAAAGGA (3) GTACAAAAAT GTCCCAAAAT 34.5 0.0345 P1 cortex CTACAAGAAA CTGCACCAAT GAAGCAAAGA (2) GGAAAGGTGA GGAAGAAAGA (2) GTACAAAACA (2) TATTATTTGG (3) TTTCCTTATT (6) 40.6 0.0406 Hypothalamus CCTTCAAATT (3) CTACAAGAAA CTTACCAAAA CTTATCCTCA GAAGCAAAGA (2) GACTATATAT GAGAAAAGGA (3) GCTACAAAAA GCTTCTCATT (2) GGAAAATGCT GGAAGACAAG GTACAAAAAT TATTATTTGG (3) TCAGTAAAGT (3) TGACCGGGAC TTCCAATCTT TTCCCAACTT TTTGAGAGGC 117.4 0.1174 E12.5 retina CTACAAAAAA CTACCAAAAA (2) CTTATCCTCA GAAGCAAAGA (2) GACTATATAT GAGAAAAGGA (3) GGAAAGGTGA GGAAGAAAGA (2) GTACAAAAAT GTCCCAAAAT TATTATTTGG (3) TCAGTAAAGT (3) TTTCCTTATT (6) TTTGAGAGGC 84.6 0.0846 E14.5 retina CCTACAAGAA (2) CTACAAGAAA CTACCAAAAA (2) CTTATCCTCA GAAGACAAAG (2) GAAGCAAAGA (2) GACTATATAT GCTTCTCATT (2) GTACAAAAAT GTCCCAAAAT TATTATTTGG (3) TCAGTAAAGT (3) TCCCCAGCCT (2) TTATTTCTTC (2) TTTCCTTATT (6) TTTGAGAGGC TTTTTTTTCA (2) 87.1 0.0871 E16.5 retina AGCTCTTCCT (2) CCAAGAGCAA CTACCAAAAA (2) CTTATCCTCA GAAGACAAAG (2) GAAGCAAAGA (2) GACTATATAT GCTACAAAAA GCTTCTCATT (2) GGAAGACAAG GTACAAAAAT GTCCCAAAAT TTATTTCTTC (2) TTCCTCAGCA TTTCCTTATT (6) TTTGAGAGGC TTTTTTTTCA (2) 119.2 0.1192 E18.5 retina CCTTCAAATT (3) CTACAAAAAA CTACCAAAAA (2) CTCACAAAAA GAAGAAAGAA (2) GAAGCAAAGA (2) GACTATATAT GACTCTTTTT (2) GCTACAAAAA GGAAAATGCT GGAAGAAAGA (2) GTACAAAAAT GTCCCAAAAT TATTATTTGG (3) TCAGTAAAGT (3) TTATTTCTTC (2) TTCCAATCTT TTTGAGAGGC TTTTTTTTCA (2) 121.5 0.1215 P0.5 retina CATCCACAAA (2) CTACAAAAAA CTACCAAAAA (2) CTTATCCTCA GAAGAAAGAA (2) GAAGCAAAGA (2) GACTATATAT GTACAAAAAT TATTATTTGG (3) TCCCCAGCCT (2) TTATTTCTTC (2) TTTCCTTATT (6) TTTGAGAGGC 68.9 0.0689 P2.5 retina CTACAAAAAA CTACCAAAAA (2) CTCACAAAAA GAAGCAAAGA (2) GACTATATAT GAGAAAAGGA (3) GCTACAAAAA GGAAGAAAGA (2) GTACAAAAAT GTCCCAAAAT TATTATTTGG (3) TTATTTCTTC (2) TTTGAGAGGC 128.7 0.1287 P4.5 retina CATCCACAAA (2) CCTACAAGAA (2) CTACCAAAAA (2) CTTATCCTCA GAAAAAGGGG GAAGCAAAGA (2) GACTATATAT GGAAGAAAGA (2) GTACAAAAAT GTCCCAAAAT TATTATTTGG (3) TCAGTAAAGT (3) TTCCAATCTT TTCCCAACTT TTTCCTTATT (6) 138.8 0.1388 P6.5 retina AGCTCTTCCT (2) CTACAAAAAA CTACCAAAAA (2) CTCACAAAAA CTTATCCTCA GAAGAAAGAA (2) GAAGCAAAGA (2) GACTATATAT GACTCTTTTT (2) GGAAGAAAGA (2) GTACAAAAAT GTCCCAAAAT TATTATTTGG (3) TCAATAAAAT TCAGTAAAGT (3) TCCCCAGCCT (2) TTATTTCTTC (2) TTCCCAACTT TTTCCTTATT (6) TTTGAGAGGC 128.6 0.1286 P10.5 crx- retina CCAAGAGCAA CTACCAAAAA (2) GAAGAAAGAA (2) GAAGCAAAGA (2) GACAGAAACA (2) GACTATATAT GACTCTATAT GAGAAAAGGA (3) GCATTCATTT (2) GGAAAATGCT GGAAAGGTGA GTACAAAAAT GTCCCAAAAT TTCCAATCTT TTCCTCAGCA TTTGAGAGGC TTTTTTTTCA (2) 167.6 0.1676 P10.5 crx+ retina CCAAGAGCAA CTACAAAAAA CTACAAGAAA CTACCAAAAA (2) CTTATCCTCA GAAGCAAAGA (2) GACAGAAACA (2) GACTATATAT GACTCCATTT (2) GGAAAATGCT GTACAAAACA (2) GTCATCAACA GTCCCAAAAT TATTATTTGG (3) TCAATAAAAT TCAGTAAAGT (3) TTTCCTTATT (6) TTTGAGAGGC 116.9 0.1169 Adult retinal CCAAGAGCAA CCTACAAGAA (2) CTACCAAAAA (2) CTGCACCAAT CTTATCCTCA GAAGAAAGAA (2) GAAGCAAAGA (2) GACTATATAT GAGAAAAGGA (3) GGAAGAAAGA (2) GGAAGACAAG GTACAAAAAT GTACAAAACA (2) TCAAAAATGT TCAGTAAAGT (3) TTATTTCTTC (2) TTTGAGAGGC 67.3 0.0673 ONL CTACCAAAAA (2) CTTATCCTCA GAAGAAAGAA (2) GAAGCAAAGA (2) GACAGAAACA (2) GACTATATAT GACTCTTTTT (2) GCATTCATTT (2) GGGAGAAGAA (3) GTCATCAACA TCAGTAAAGT (3) TTCCAATCTT TTTCCTTATT (6) 62.9 0.0629