| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | AATTAAAAAA AATTAAAAAC (8) AATTAAAGAC (2)
| 14.7 | 0.0147 |
| Cb medulloblastoma | AATTAAAAAA AATTAAAGAC (2)
| 9.2 | 0.0092 |
| P8 GC+1d culture | AATTAAAAAA AATTAAAAAC (8) AATTAAAGAC (2)
| 17.1 | 0.0171 |
| P8 GC+SHH+1d culture | AATTAAAAAA AATTAAAAAC (8) AATTAAAGAC (2)
| 11.7 | 0.0117 |
| 3T3 fibroblasts | GTCATAGCTG (2)
| 10.5 | 0.0105 |
| E15 cortex | GTCATAGCTG (2)
| 4.9 | 0.0049 |
| P1 cortex | ACAAGTGCTT
| 4.5 | 0.0045 |
| Hypothalamus | AATTAAAAAC (8) AATTAAAGAC (2) GTGTCTTACA
| 9 | 0.009 |
| E12.5 retina | AATTAAAAAC (8) AATTAAAGAC (2) ACAAGTGCTT
| 5.7 | 0.0057 |
| E14.5 retina | AATTAAAAAC (8) AATTAAAGAC (2) GTGTCTTACA
| 10.9 | 0.0109 |
| E16.5 retina | AATTAAAAAA AATTAAAAAC (8) AATTAAAGAC (2)
| 10.8 | 0.0108 |
| E18.5 retina | AATTAAAGAC (2) GTGTCTTACA
| 5.4 | 0.0054 |
| P0.5 retina | AATTAAAGAC (2) GTCATAGCTG (2)
| 5.9 | 0.0059 |
| P2.5 retina | AATTAAAAAC (8) GTCATAGCTG (2)
| 3.6 | 0.0036 |
| P4.5 retina | AATTAAAAAC (8) AATTAAAGAC (2) GTCATAGCTG (2)
| 6 | 0.006 |
| P6.5 retina | AATTAAAGAC (2) GTCATAGCTG (2)
| 5 | 0.005 |
| P10.5 crx- retina | AATTAAAAAC (8) AATTAAAGAC (2)
| 11.2 | 0.0112 |
| P10.5 crx+ retina | ACAAGTGCTT
| 1.9 | 0.0019 |
| Adult retinal | GTCATAGCTG (2) GTGTCTTACA
| 3.8 | 0.0038 |
| ONL | AATTAAAAAA AATTAAAAAC (8) GTCATAGCTG (2) GTGTCTTACA
| 15.2 | 0.0152 |