Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.269025 2810417H13RikRIKEN cDNA 2810417H13 gene 9    68026 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 116 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGGAGAAAGT
GCTATACAGA
TAGCCCAGGC (2)
TTGTTAAAAT (3)
TTTCTTGTTT (2)
TTTGCTTTAA (3)
TTTGCTTTTA
TTTTTGGCAG
68.50.0685
Cb medulloblastomaTAGCCCAGGC (2)
TTGTTAAAAT (3)
TTTGCTTTAA (3)
13.80.0138
P8 GC+1d cultureTAGCCCAGGC (2)
TTGTTAAAAT (3)
TTTCTTGTTT (2)
TTTGCTTTAA (3)
TTTGCTTTTA
TTTTTGGCAG
31.90.0319
P8 GC+SHH+1d cultureCTTACACTTA
GCTATACAGA
GTGCGGACCA
TAAATTTGGG
TAGCCCAGGC (2)
TTGTTAAAAT (3)
TTTGCTTTAA (3)
TTTTTGGCAG
71.40.0714
3T3 fibroblastsCTTACACTTA
TAGCCCAGGC (2)
TTTGCTTTAA (3)
TTTTTGGCAG
24.50.0245
E15 cortexGCTATACAGA
TAGCCCAGGC (2)
TTTTTGGCAG
39.50.0395
P1 cortexGCTATACAGA
TTTCTTGTTT (2)
TTTGCTTTAA (3)
27.20.0272
HypothalamusGCTATACAGA
GTCAAACAGA
TAGCCCAGGC (2)
TTTGCTTTAA (3)
32.50.0325
E12.5 retinaAGGAGAAAGT
GCTATACAGA
TAAATTTGGG
TAGCCCAGGC (2)
TTGTTAAAAT (3)
TTTGCTTTAA (3)
TTTTTGGCAG
470.047
E14.5 retinaAGGAGAAAGT
CTTACACTTA
GCTATACAGA
TAAATTTGGG
TAGCCCAGGC (2)
TTGTTAAAAT (3)
TTTCTTGTTT (2)
TTTGCTTTAA (3)
81.90.0819
E16.5 retinaTAGCCCAGGC (2)
TTCACACAAG (2)
TTGTTAAAAT (3)
TTTCTTGTTT (2)
TTTGCTTTAA (3)
61.50.0615
E18.5 retinaAGGAGAAAGT
GTGCGGACCA
TAAATTTGGG
TAGCCCAGGC (2)
TTCACACAAG (2)
TTGTTAAAAT (3)
TTTCTTGTTT (2)
TTTGCTTTAA (3)
TTTTTGGCAG
76.30.0763
P0.5 retinaAGGAGAAAGT
GCTATACAGA
TAGCCCAGGC (2)
TTGTTAAAAT (3)
TTTCTTGTTT (2)
TTTGCTTTAA (3)
TTTTTGGCAG
39.40.0394
P2.5 retinaCTTAAACTTA
GTCAAACAGA
TAGCCCAGGC (2)
TTGTTAAAAT (3)
TTTCTTGTTT (2)
TTTGCTTTAA (3)
TTTGCTTTTA
TTTTTGGCAG
70.40.0704
P4.5 retinaATAGAGGTCC
TAAATTTGGG
TAGCCCAGGC (2)
TTGTTAAAAT (3)
TTTGCTTTAA (3)
TTTGCTTTTA
57.60.0576
P6.5 retinaGCTATACAGA
TAGCCCAGGC (2)
TTTCTTGTTT (2)
TTTGCTTTAA (3)
TTTTTGGCAG
650.065
P10.5 crx- retinaCTTAAACTTA
GCTATACAGA
TAAATTTGGG
TAGCCCAGGC (2)
TTGTTAAAAT (3)
TTTCTTGTTT (2)
TTTGCTTTAA (3)
430.043
P10.5 crx+ retinaATAGAGGTCC
GCTATACAGA
GTCAAACAGA
TAGCCCAGGC (2)
TTTGCTTTAA (3)
42.10.0421
Adult retinalGCTATACAGA
TAGCCCAGGC (2)
TTGTTAAAAT (3)
TTTGCTTTAA (3)
TTTGCTTTTA
16.80.0168
ONLGCTATACAGA
TAGCCCAGGC (2)
TTGTTAAAAT (3)
TTTCTTGTTT (2)
TTTGCTTTAA (3)
32.50.0325