Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.271222 Eif5eukaryotic translation initiation factor 5 12  12 F1 (12 57.0 cM)  217869 
 Mm.271222 2810011H21RikRIKEN cDNA 2810011H21 gene 12    72643 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 6 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 145 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAACCATAGGG (2)
CTGTGGAAGA (4)
CTTGACACAC (2)
GAGGTTAACC (2)
GCCTCTTGGG (3)
GGGTTTGGAA
TTGGTAATTT
TTTCTTTCGG (2)
42.50.0425
Cb medulloblastomaAGGGAATAAG
CTTGACACAC (2)
GAGGTTAACC (2)
GGGTTTGGAA
TTTCTTTCGG (2)
32.30.0323
P8 GC+1d cultureCTGTGGAAGA (4)
CTTGACACTC (2)
GAGGTTAACC (2)
GCCTCTTGGG (3)
GGGTTTGGAA
TTTCTTTCGG (2)
34.20.0342
P8 GC+SHH+1d cultureAGGGAATAAG
CTGTGGAAGA (4)
CTTGACACAC (2)
CTTGACACTC (2)
GAGGTTAACC (2)
GCCTCTTGGG (3)
GGGTTTGGAA
TTTCTTTCGG (2)
37.50.0375
3T3 fibroblastsCAAAAGGTCT (3)
CTGTGGAAGA (4)
CTTGACACAC (2)
GCCTCTTGGG (3)
TTTCTTTCGG (2)
24.50.0245
E15 cortexCAAAAGGTCT (3)
CTGTGGAAGA (4)
GGGTCCTCTT (2)
GGGTTTGGAA
29.50.0295
P1 cortexCTGTGGAAGA (4)
CTTGACACAC (2)
GGGTTTGGAA
13.50.0135
HypothalamusAGTAAAACCC (2)
CTTGACACAC (2)
GAGGTTAACC (2)
GCCTCTTGGG (3)
GGGTTTGGAA
TTGGTAATTT
TTTCTTTCGG (2)
28.90.0289
E12.5 retinaCAAAAGGTCT (3)
CTGTGGAAGA (4)
CTTGACACTC (2)
GAGGTTAACC (2)
GCCTCTTGGG (3)
GGGTCCTCTT (2)
GGGTTTGGAA
TTTCTTTCGG (2)
56.40.0564
E14.5 retinaCAAAAGGTCT (3)
CTTGACACAC (2)
GAGGTTAACC (2)
GGGTTTGGAA
TTGGATGGAT (2)
TTGGTAATTT
TTTCTTTCGG (2)
25.40.0254
E16.5 retinaAGTAAAACCC (2)
CTGTGGAAGA (4)
CTTGACACAC (2)
GAGGTTAACC (2)
GGGTCCTCTT (2)
GGGTTTGGAA
TGTTCACTGT (2)
TTGGATGGAT (2)
TTGGTAATTT
TTTCTTTCGG (2)
41.50.0415
E18.5 retinaAGTAAAACCC (2)
CTGTGGAAGA (4)
CTTGACACAC (2)
GAGGTTAACC (2)
GCCTCTTGGG (3)
GGGTCCTCTT (2)
GGGTTTGGAA
TTGGTAATTT
TTTCTTTCGG (2)
43.50.0435
P0.5 retinaAAGTATTTTG (2)
CTTGACACAC (2)
CTTGACACTC (2)
GAGGTTAACC (2)
GCCTCTTGGG (3)
GGGTCCTCTT (2)
GGGTTTGGAA
31.50.0315
P2.5 retinaAGTAAAACCC (2)
CAAAAGGTCT (3)
CTGTGGAAGA (4)
CTTGACACAC (2)
GAGGTTAACC (2)
GCCTCTTGGG (3)
GGGTCCTCTT (2)
GGGTTTGGAA
TTGGTAATTT
TTTCTTTCGG (2)
65.30.0653
P4.5 retinaAAGTATTTTG (2)
CTTGACACAC (2)
GAGGTTAACC (2)
GCCTCTTGGG (3)
GGGTCCTCTT (2)
GGGTTTGGAA
TGGTTAATTT (2)
TTGGATGGAT (2)
TTGGTAATTT
TTTCTTTCGG (2)
53.70.0537
P6.5 retinaAGTAAAACCC (2)
CAAAAGGTCT (3)
CTGTGGAAGA (4)
CTTGACACAC (2)
CTTGACACTC (2)
GAGGTTAACC (2)
GCCTCTTGGG (3)
GGGTCCTCTT (2)
GGGTTTGGAA
51.80.0518
P10.5 crx- retinaAACCATAGGG (2)
CTGTGGAAGA (4)
GAGGTTAACC (2)
GCCTCTTGGG (3)
GGGTCCTCTT (2)
GGGTTTGGAA
TTTCTTTCGG (2)
300.03
P10.5 crx+ retinaCTTGACACAC (2)
GAGGTTAACC (2)
GCCTCTTGGG (3)
GGGTCCTCTT (2)
GGGTTTGGAA
TGGTTAATTT (2)
TTTCTTTCGG (2)
32.50.0325
Adult retinalAAGTATTTTG (2)
CTGTGGAAGA (4)
CTTGACACAC (2)
CTTGACACTC (2)
GAGGTTAACC (2)
GCCTCTTGGG (3)
GGGTCCTCTT (2)
TGTTCACTGT (2)
TTTCTTTCGG (2)
20.80.0208
ONLCTGTGGAAGA (4)
GAGGTTAACC (2)
GCCTCTTGGG (3)
GGGTCCTCTT (2)
GGGTTTGGAA
TTGGTAATTT
22.80.0228