Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.271642 AI845704expressed sequence AI845704 1    98447 
 Mm.271642 Ipo9importin 9 1  1 E4  226432 
 Gene Ontology cytoplasm | histone binding | nuclear pore | nucleus | protein stabilization | protein transport | protein transporter activity | protein-nucleus import | protein-nucleus import, docking | RAN protein binding | ribosomal protein-nucleus import | ribosome biogenesis and assembly | transport
 Human Homolog IPO9[importin 9]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 160 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAAAAAA (2)
CAGATGAGGC (4)
GGTCACTTTT (2)
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
TATTTTTATA (3)
TATTTTTCTA (4)
TATTTTTTTA (4)
TGGTTGCTGG
TTGGAACCTA (2)
321.30.3213
Cb medulloblastomaAAAAAAAAAA (2)
CAGATGAGGC (4)
GAGGCCAATG (3)
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
TATTTTTCTA (4)
TGGTTGCTGG
9480.948
P8 GC+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
CATACACAAA (2)
GAGGCCAATG (3)
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
TATTTTTATA (3)
TATTTTTCTA (4)
TATTTTTTTA (4)
TGGTTGCTGG
302.40.3024
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
TATTTTTATA (3)
TATTTTTCTA (4)
TATTTTTTTA (4)
TGGTTGCTGG
TTGGAACCTA (2)
TTTGACATCT
421.50.4215
3T3 fibroblastsAAAAAAAAAA (2)
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
TGGTTGCTGG
276.80.2768
E15 cortexAAAAAAAAAA (2)
GAGGAACTGG (2)
GGGCGGGGGG (2)
GGTCACTTTT (2)
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
TGGTTGCTGG
5590.559
P1 cortexAAAAAAAAAA (2)
CATACACAAA (2)
GGTTTGTTCA (2)
GTACAAAACA (2)
GTGGCTCATA (2)
TATTTTTCTA (4)
TGGTTGCTGG
390.80.3908
HypothalamusAAAAAAAAAA (2)
CAGATGATGC
CATACACAAA (2)
GAGGAACTGG (2)
GAGGCCAATG (3)
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
TATTTTTATA (3)
TGGTTGCTGG
TTTGACATCT
523.40.5234
E12.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
CATACACAAA (2)
GGGCGGGGGG (2)
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
TATTTTTCTA (4)
TGGTTGCTGG
407.30.4073
E14.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
CAGATGATGC
GAGGCCAATG (3)
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
GTTCACTTTT (3)
TATTTTTATA (3)
TATTTTTCTA (4)
TATTTTTTTA (4)
TGGTTGCTGG
1124.11.1241
E16.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
CAGATGATGC
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
TATTTTTATA (3)
TATTTTTCTA (4)
TGGTTGCTGG
TTTGACATCT
871.10.8711
E18.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
CAGATGAGGC (4)
CAGATGATGC
CATACACAAA (2)
GGTCACTTTT (2)
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
GTTCACTTTT (3)
TATTTTTATA (3)
TATTTTTCTA (4)
TGGTTGCTGG
705.70.7057
P0.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
CAGATGATGC
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
GTTCACTTTT (3)
TATTTTTCTA (4)
TATTTTTTTA (4)
TGGTTGCTGG
TTTGACATCT
373.10.3731
P2.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
CAGATGATGC
CATACACAAA (2)
GGGCGGGGGG (2)
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
TATTTTTATA (3)
TATTTTTCTA (4)
TATTTTTTTA (4)
TGGTTGCTGG
577.20.5772
P4.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
GAGGCCAATG (3)
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
TATTTTTATA (3)
TATTTTTCTA (4)
TATTTTTTTA (4)
TGGTTGCTGG
509.20.5092
P6.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
CATACACAAA (2)
GGTCACTTTT (2)
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
TATTTTTATA (3)
TATTTTTCTA (4)
TGGTTGCTGG
480.30.4803
P10.5 crx- retinaAAAAAAAAAA (2)
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
TATTTTTCTA (4)
TGGTTGCTGG
3660.366
P10.5 crx+ retinaAAAAAAAAAA (2)
CATACACAAA (2)
GGTTTGTTCA (2)
GTACAAAACA (2)
GTGGCTCATA (2)
TGGTTGCTGG
TTGGAACCTA (2)
253.60.2536
Adult retinalAAAAAAAAAA (2)
GGTCACTTTT (2)
GGTTTGTTCA (2)
GTACAAAACA (2)
GTGGCTCATA (2)
TATTTTTATA (3)
TATTTTTCTA (4)
TGGTTGCTGG
311.30.3113
ONLAAAAAAAAAA (2)
CATACACAAA (2)
GGTTTGTTCA (2)
GTGGCTCATA (2)
TATTTTTCTA (4)
TGGTTGCTGG
559.20.5592