Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.273496	Zfr	zinc finger RNA binding protein	15		22763
Mm.273496	C920030H05Rik	RIKEN cDNA C920030H05 gene	15		319369
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 83 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC TAAAAAAAAA (3) TGTGTGTGCT (5) TTAAAAAAAA (2) 62 0.062 Cb medulloblastoma CTTATGTCTT (2) TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) 161.9 0.1619 P8 GC+1d culture CTTATGTCTT (2) GAAGAACCAA (2) TAAAAAAAAA (3) TAATGACTTA (2) TTAAAAAAAA (2) TTGGATGGCC (2) 100.3 0.1003 P8 GC+SHH+1d culture CTTATGTCTT (2) GAAGAACCAA (2) TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) 130.1 0.1301 3T3 fibroblasts CTTATGTCTT (2) TAAAAAAAAA (3) 10.5 0.0105 E15 cortex TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) 14.8 0.0148 P1 cortex CTTATGTCTT (2) TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) 68.1 0.0681 Hypothalamus CTTATGTCTT (2) TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTGGATGGCC (2) 63.3 0.0633 E12.5 retina CTTATGTCTT (2) GAAGAACCAA (2) TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) 41.4 0.0414 E14.5 retina CTTATGTCTT (2) TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) 60.1 0.0601 E16.5 retina ACATTTTTGT (3) CTTATGTCTT (2) TAAAAAAAAA (3) TGTGTGTGCT (5) TTAAAAAAAA (2) 48.8 0.0488 E18.5 retina CTTATGTCTT (2) GAAGAACCAA (2) TAAAAAAAAA (3) TAATGACTTA (2) TTAAAAAAAA (2) 165.4 0.1654 P0.5 retina CTTATGTCTT (2) TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) 57 0.057 P2.5 retina CTTATGTCTT (2) GAAGAACCAA (2) TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTGGATGGCC (2) 121.6 0.1216 P4.5 retina ACATTTTTGT (3) TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTGGATGGCC (2) 176.4 0.1764 P6.5 retina CTTATGTCTT (2) GAAGAACCAA (2) TAAAAAAAAA (3) TGTGTGTGCT (5) TTAAAAAAAA (2) TTGGATGGCC (2) 90.1 0.0901 P10.5 crx- retina CTTATGTCTT (2) GAAGAACCAA (2) TAAAAAAAAA (3) TAATGACTTA (2) TTAAAAAAAA (2) 33.5 0.0335 P10.5 crx+ retina CTTATGTCTT (2) GAAGAACCAA (2) TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTGGATGGCC (2) 46.2 0.0462 Adult retinal ACATTTTTGT (3) CTTATGTCTT (2) TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTGGATGGCC (2) 33.4 0.0334 ONL CTTATGTCTT (2) GAAGAACCAA (2) TAAAAAAAAA (3) TGTGTGTGCT (5) TTAAAAAAAA (2) TTGGATGGCC (2) 47.8 0.0478