Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.274770 Xistinactive X specific transcripts X  X 42.0 cM  213742 
 Gene Ontology chromosome | dosage compensation, by inactivation of X chromosome
 Clusters 
   Neighbors    

Total 10 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 100 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGGAAATGAA (2)
GAAAAAGGAA (4)
GAAAACACCT (3)
GGGGCTCACA (4)
TCACAATGAG
TGGTTGTTGG (2)
24.50.0245
Cb medulloblastomaCACAACAAAA (3)
11.60.0116
P8 GC+1d cultureAGGAAATGAA (2)
CACAACAAAA (3)
GGGGCTCACA (4)
TGGTTGTTGG (2)
TTTCAGCACT (4)
9.10.0091
P8 GC+SHH+1d cultureAGGAAATGAA (2)
TGGTTGTTGG (2)
2.40.0024
3T3 fibroblastsCTATGTGTTG
GAAAACACCT (3)
GGTACTGGGA
TGTGAGAGGA
17.50.0175
E15 cortexCCCAGCCTGA
GGGGCTCACA (4)
TGGTTGTTGG (2)
69.20.0692
P1 cortexAGGAAATGAA (2)
CTATGTGTTG
GAAAAAGGAA (4)
GGGGCTCACA (4)
TGGTTGTTGG (2)
54.50.0545
HypothalamusAGGAAATGAA (2)
CACAACAAAA (3)
GGGGCTCACA (4)
TGGTTGTTGG (2)
65.10.0651
E12.5 retinaGAAAACACCT (3)
GGGGCTCACA (4)
GGTACTGGGA
TCACAATGAG
TGGTTGTTGG (2)
TGTGAGAGGA
TTTCAGCACT (4)
58.30.0583
E14.5 retinaAGGAAATGAA (2)
GAAAACACCT (3)
GGGGCTCACA (4)
GGTACTGGGA
TCACAATGAG
TGGTTGTTGG (2)
127.50.1275
E16.5 retinaAGGAAATGAA (2)
GGGGCTCACA (4)
TGGTTGTTGG (2)
TTTCAGCACT (4)
56.10.0561
E18.5 retinaGGGGCTCACA (4)
TCACAATGAG
TGGTTGTTGG (2)
TGTGAGAGGA
87.40.0874
P0.5 retinaAGGAAATGAA (2)
CTAATGCTCA
CTATGTGTTG
GGGGCTCACA (4)
TCACAATGAG
TGTGAGAGGA
66.80.0668
P2.5 retinaAGGAAATGAA (2)
CTATGTGTTG
GAAAACACCT (3)
GGGGCTCACA (4)
TCACAATGAG
TGGTTGTTGG (2)
TGTGAGAGGA
146.10.1461
P4.5 retinaAGGAAATGAA (2)
CTATGTGTTG
GAAAACACCT (3)
GGGGCTCACA (4)
GGTACTGGGA
TCACAATGAG
TGGTTGTTGG (2)
93.10.0931
P6.5 retinaAAATAAGAAA
CACAACAAAA (3)
CTAATGCTCA
CTATGTGTTG
GAAAACACCT (3)
GGGGCTCACA (4)
TCACAATGAG
TGGTTGTTGG (2)
126.80.1268
P10.5 crx- retinaCCCAGCCTGA
CTAATGCTCA
GGGGCTCACA (4)
TCACAATGAG
TGGTTGTTGG (2)
46.50.0465
P10.5 crx+ retinaCTAATGCTCA
CTATGTGTTG
GAAAACACCT (3)
GGGGCTCACA (4)
TCACAATGAG
TGGTTGTTGG (2)
38.30.0383
Adult retinalAAATAAGAAA
AGGAAATGAA (2)
CACAACAAAA (3)
GGGGCTCACA (4)
TGGTTGTTGG (2)
46.40.0464
ONLAAATAAGAAA
AGGAAATGAA (2)
GGGGCTCACA (4)
GGTACTGGGA
TGGTTGTTGG (2)
59.30.0593