| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | CCTTTAATCC (3) GAAGTGGAAG (4)
| 53.8 | 0.0538 |
| Cb medulloblastoma | CCTTTAATCC (3)
| 41.6 | 0.0416 |
| P8 GC+1d culture | CCTTTAATCC (3)
| 32 | 0.032 |
| P8 GC+SHH+1d culture | CCTTTAATCC (3) GAAGTGGAAG (4)
| 27 | 0.027 |
| 3T3 fibroblasts | CCTTTAATCC (3) GAAGTGGAAG (4)
| 91.1 | 0.0911 |
| E15 cortex | CCTTTAATCC (3)
| 54.4 | 0.0544 |
| P1 cortex | CCTTTAATCC (3) CTGGCAAAAT (3)
| 163.6 | 0.1636 |
| Hypothalamus | CCTTTAATCC (3) GAAGTGGAAG (4)
| 21.7 | 0.0217 |
| E12.5 retina | CCTTTAATCC (3) GAAGTGGAAG (4)
| 78.9 | 0.0789 |
| E14.5 retina | CCTTTAATCC (3) GCTGCTTTTT (5)
| 122.1 | 0.1221 |
| E16.5 retina | CCTTTAATCC (3) GAAGTGGGAA (3)
| 70.6 | 0.0706 |
| E18.5 retina | CCTTTAATCC (3) CTGGCAAAAT (3) GAAGTGGAAG (4)
| 29 | 0.029 |
| P0.5 retina | CCTTTAATCC (3) GAAGTGGAAG (4) GCTGCTTTTT (5)
| 80.5 | 0.0805 |
| P2.5 retina | CCTTTAATCC (3) CTGGCAAAAT (3) GAAGTGGAAG (4)
| 74 | 0.074 |
| P4.5 retina | CCTTTAATCC (3)
| 43.6 | 0.0436 |
| P6.5 retina | CCTTTAATCC (3) CTGGCAAAAT (3) GAAGTGGAAG (4)
| 83.4 | 0.0834 |
| P10.5 crx- retina | AGGAGTTGCT (4) CCTTTAATCC (3) GAAGTGGAAG (4)
| 80 | 0.08 |
| P10.5 crx+ retina | CCTTTAATCC (3) CTGGCAAAAT (3) GAAGTGGAAG (4) GAAGTGGGAA (3) GCTGCTTTTT (5)
| 59.5 | 0.0595 |
| Adult retinal | AGGAGTTGCT (4) CCTTTAATCC (3) CTGGCAAAAT (3) GAAGTGGAAG (4) GCTGCTTTTT (5)
| 174.1 | 0.1741 |
| ONL | AGGAGTTGCT (4) CCTTTAATCC (3) CTGGCAAAAT (3) GAAGTGGAAG (4)
| 136 | 0.136 |