Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.27660 Rbm12RNA binding motif protein 12 2    75710 
 Mm.27660 Cpne1copine I 2    266692 
 Gene Ontology biological_process unknown | cellular_component unknown | phosphatidylserine binding
 Human Homolog CPNE1[copine I]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 86 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATCTCCTTGG
CCAGTGATGG (3)
GAGGTGGAAG (2)
TGTAAGTTAT (3)
TTTTTATATT (3)
22.90.0229
Cb medulloblastomaATCTCCTTGG
GTGGCCTTTG (3)
TCAAGAACAA (3)
18.50.0185
P8 GC+1d cultureATCTCCTTGG
CCAGTGATGG (3)
GAGGTGGAAG (2)
TGAAATGTGA (3)
TGTAAGTTAT (3)
TTCATTTGGG (5)
TTTTTATATT (3)
27.30.0273
P8 GC+SHH+1d cultureATCTCCTTGG
CACACACAAC
CCAGTGATGG (3)
GAGGTGGAAG (2)
GTGGCCTTTG (3)
TCAAGAACAA (3)
TTTTTATATT (3)
25.80.0258
3T3 fibroblastsGAGGTGGAAG (2)
3.50.0035
E15 cortexGAGGTGGAAG (2)
9.90.0099
P1 cortexTTCATTTGGG (5)
TTTTTATATT (3)
90.009
HypothalamusCCAGTGATGG (3)
GAGGTGGAAG (2)
GTGGCCTTTG (3)
TGAAATGTGA (3)
90.009
E12.5 retinaATCTCCTTGG
GAGGTGGAAG (2)
TGAAATGTGA (3)
TTCATTTGGG (5)
TTTTTATATT (3)
170.017
E14.5 retinaATCTCCTTGG
CCAGTGATGG (3)
TCAAGAACAA (3)
TTTTTATATT (3)
18.20.0182
E16.5 retinaATCTCCTTGG
GAGGTGGAAG (2)
TCAAGAACAA (3)
TTCATTTGGG (5)
TTTTTATATT (3)
32.60.0326
E18.5 retinaATCTCCTTGG
CACACACAAC
CCAGTGATGG (3)
GAGGTGGAAG (2)
TCAAGAACAA (3)
TTTTTATATT (3)
29.20.0292
P0.5 retinaATCTCCTTGG
CCAGTGATGG (3)
GAGGTGGAAG (2)
TCAAGAACAA (3)
TGTAAGTTAT (3)
29.50.0295
P2.5 retinaATCTCCTTGG
GAGGTGGAAG (2)
TGTAAGTTAT (3)
TTTTTATATT (3)
24.70.0247
P4.5 retinaATCTCCTTGG
CCAGTGATGG (3)
GAGGTGGAAG (2)
TTCATTTGGG (5)
TTTTTATATT (3)
25.70.0257
P6.5 retinaATCTCCTTGG
CCAGTGATGG (3)
GAGGTGGAAG (2)
GTGGCCTTTG (3)
TGAAATGTGA (3)
TTCATTTGGG (5)
TTTTTATATT (3)
250.025
P10.5 crx- retinaATCTCCTTGG
TCAAGAACAA (3)
TTCATTTGGG (5)
16.70.0167
P10.5 crx+ retinaATCTCCTTGG
CACACACAAC
15.40.0154
Adult retinalATCTCCTTGG
GAGGTGGAAG (2)
GTGGCCTTTG (3)
TTTTTATATT (3)
24.10.0241
ONLATCTCCTTGG
CACACACAAC
TCAAGAACAA (3)
TGTAAGTTAT (3)
TTCATTTGGG (5)
TTTTTATATT (3)
30.50.0305