Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.28052 Ubp1upstream binding protein 1 9    22221 
 Gene Ontology angiogenesis
 Human Homolog UBP1[upstream binding protein 1 (LBP-1a)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 93 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATTTATGGAA (2)
GAGGTGAAAA (2)
GCACCAGCAG (2)
TGGGTTCCTT
8.10.0081
Cb medulloblastomaATTTATGGAA (2)
GCACCAGCAG (2)
TGGGTTCCTT
9.20.0092
P8 GC+1d cultureAGATCCAGAA (2)
ATTTATGGAA (2)
GCACCAGCAG (2)
TGGGTTCCTT
TGGTCACACA (2)
90.009
P8 GC+SHH+1d cultureAGCAGAAAAA (2)
ATTTATGGAA (2)
GAGGTGGAAA (3)
GCACCAGCAG (2)
10.60.0106
3T3 fibroblastsGCACCAGCAG (2)
GTCATAGCTG (2)
210.021
E15 cortexAGATCCAAAA (2)
GCACCAGCAG (2)
GTCATAGCTG (2)
TGGGTTCCTT
19.60.0196
P1 cortexGAGGTGAAAA (2)
TGGGTTCCTT
13.60.0136
HypothalamusATTTATGGAA (2)
GAGGTGAAAA (2)
GAGGTGGAAA (3)
GCACCAGCAG (2)
19.90.0199
E12.5 retinaAGATCCAAAA (2)
ATTTATGGAA (2)
GAGGTGGAAA (3)
GCACCAGCAG (2)
20.70.0207
E14.5 retinaATTTATGGAA (2)
CTTAAAAGTG (3)
GAGGTGGAAA (3)
GCACCAGCAG (2)
GGCCAGGTAT (2)
18.20.0182
E16.5 retinaAGATCCAAAA (2)
AGATCGAAAA
ATTTATGGAA (2)
GAGGTGGAAA (3)
GCACCAGCAG (2)
TGGGTTCCTT
TGGTCACACA (2)
30.70.0307
E18.5 retinaAGATCCAAAA (2)
AGCAGAAAAA (2)
ATTTATGGAA (2)
CTTAAAAGTG (3)
GAGGTGGAAA (3)
GCACCAGCAG (2)
GGCCAGGTAT (2)
290.029
P0.5 retinaAGATCCAAAA (2)
AGATCGAAAA
ATTTATGGAA (2)
GAGGTGAAAA (2)
GAGGTGGAAA (3)
GCACCAGCAG (2)
GTCATAGCTG (2)
19.70.0197
P2.5 retinaAGATCCAAAA (2)
AGCAGAAAAA (2)
ATTTATGGAA (2)
GAGGTGAAAA (2)
GAGGTGGAAA (3)
GCACCAGCAG (2)
GTCATAGCTG (2)
49.40.0494
P4.5 retinaATTTATGGAA (2)
CTTAAAAGTG (3)
GAGGTGGAAA (3)
GCACCAGCAG (2)
GTCATAGCTG (2)
35.60.0356
P6.5 retinaAGATCCAAAA (2)
AGATCCAGAA (2)
AGATCGAAAA
ATTTATGGAA (2)
GAGGTGAAAA (2)
GAGGTGGAAA (3)
GCACCAGCAG (2)
GTCATAGCTG (2)
33.40.0334
P10.5 crx- retinaAGATCGAAAA
ATTTATGGAA (2)
GAGGTGGAAA (3)
GCACCAGCAG (2)
31.60.0316
P10.5 crx+ retinaATTTATGGAA (2)
CTTAAAAGTG (3)
GCACCAGCAG (2)
GGCCAGGTAT (2)
26.90.0269
Adult retinalATTTATGGAA (2)
GCACCAGCAG (2)
GTCATAGCTG (2)
11.20.0112
ONLAGATCCAGAA (2)
ATTTATGGAA (2)
GCACCAGCAG (2)
GTCATAGCTG (2)
210.021