| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | CACTGGCCTT GCCTTGGTTT TTTGCTGAGT (3)
| 13.1 | 0.0131 |
| Cb medulloblastoma | CACTGGCCTT CCTGTGCTCC (3) CTGCGGGAGG GCCTTGGTTT
| 13.8 | 0.0138 |
| P8 GC+1d culture | CACTGGCCTT CCTGTGCTCC (3) GCCTTGGTTT
| 11.4 | 0.0114 |
| P8 GC+SHH+1d culture | CACTGGCCTT CCTTGTTCCT GCCTTGGTTT TTTGCTGAGT (3)
| 12.9 | 0.0129 |
| 3T3 fibroblasts | CACTGGCCTT GCCTTGGTTT
| 28 | 0.028 |
| E15 cortex | CCTGTGCTCC (3) GCCTTGGTTT TTTGCTGAGT (3)
| 14.7 | 0.0147 |
| P1 cortex | CACTGGCCTT
| 9.1 | 0.0091 |
| Hypothalamus | CACTGGCCTT CTGCGGGAGG GCCTTGGTTT
| 9 | 0.009 |
| E12.5 retina | CACTGGCCTT GCCTTGGTTT
| 13.1 | 0.0131 |
| E14.5 retina | GCCTTGGTTT
| 3.6 | 0.0036 |
| E16.5 retina | ATTACGCCAA CACTGGCCTT CCTGTGCTCC (3) GCCTTGGTTT
| 9 | 0.009 |
| E18.5 retina | CACTGGCCTT CTGCGGGAGG GCCTTGGTTT
| 10.9 | 0.0109 |
| P0.5 retina | ATTACGCCAA CACTGGCCTT GCCTTGGTTT
| 7.9 | 0.0079 |
| P2.5 retina | CACTGGCCTT
| 1.8 | 0.0018 |
| P4.5 retina | CCTTGTTCCT GCCTTGGTTT
| 7.9 | 0.0079 |
| P6.5 retina | CACTGGCCTT GCCTTGGTTT
| 11.7 | 0.0117 |
| P10.5 crx- retina | CACTGGCCTT GCCTTGGTTT
| 16.8 | 0.0168 |
| P10.5 crx+ retina | CACTGGCCTT GCCTTGGTTT
| 26.9 | 0.0269 |
| Adult retinal | ATTACGCCAA CACTGGCCTT CCTTGTTCCT GCCTTGGTTT
| 24.1 | 0.0241 |
| ONL | CACTGGCCTT GCCTTGGTTT
| 17.3 | 0.0173 |