Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.293321	Ubxd2	UBX domain containing 2	1		67812
Mm.293321	AA517465	expressed sequence AA517465	1		98209
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 136 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAATAGCTGG (2) CCTTTAATCC (3) CCTTTGATCC (4) CGTGCACACA GAACCTAAGC (2) GATGTTCAAA (2) GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC GTTGAAAAAA (2) 70 0.07 Cb medulloblastoma CCTTTAATCC (3) CCTTTGATCC (4) GATGTTCAAA (2) GCTGTTCAAA (2) GTAAAGATGA GTGGCTCACC GTTGAAAAAA (2) TTTCCCAGAA (2) 73.9 0.0739 P8 GC+1d culture AAATAGCTGG (2) CCTTTAATCC (3) CCTTTGATCC (4) CGTGCACACA GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC GTTGAAAAAA (2) TTCATTTAGA 49 0.049 P8 GC+SHH+1d culture AAATAGCTGG (2) CCTTTAATCC (3) CCTTTGATCC (4) CGTGCACACA GCTGTTCAAA (2) GTAAAGATGA GTGGCTCACC GTTGAAAAAA (2) 45.7 0.0457 3T3 fibroblasts AAATAGCTGG (2) CCTTTAATCC (3) GATGTTCAAA (2) GTGGCCTTGG GTGGCTCACC TTTCCCAGAA (2) 101.6 0.1016 E15 cortex CCTTTAATCC (3) GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC TTTCCCAGAA (2) 89 0.089 P1 cortex AAATAGCTGG (2) CCTTTAATCC (3) CCTTTGATCC (4) GCTGTTCAAA (2) GTAAAGATGA GTGGCTCACC TTTGACTTTT (3) 190.6 0.1906 Hypothalamus CCTTTAATCC (3) CGTGCACACA GCAAGGAACA (4) GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC 38 0.038 E12.5 retina AAATAGCTGG (2) CCTTTAATCC (3) CCTTTGATCC (4) GATGTTCAAA (2) GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC TTCATTTAGA 99.6 0.0996 E14.5 retina AAATAGCTGG (2) CCTTTAATCC (3) CCTTTGATCC (4) GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC TTTGACTTTT (3) 131.1 0.1311 E16.5 retina CCTTTAATCC (3) CCTTTGATCC (4) CGTGCACACA GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC GTTGAAAAAA (2) 88.6 0.0886 E18.5 retina AAATAGCTGG (2) CCTTTAATCC (3) CCTTTGATCC (4) GATGTTCAAA (2) GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC 69 0.069 P0.5 retina AAATAGCTGG (2) CCTTTAATCC (3) CCTTTGATCC (4) GCAAGGAACA (4) GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC GTTGAAAAAA (2) TTCATTTAGA TTTCCCAGAA (2) TTTGACTTTT (3) 100.3 0.1003 P2.5 retina AAATAGCTGG (2) CCTTTAATCC (3) CCTTTGATCC (4) GAACCTAAGC (2) GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC GTTGAAAAAA (2) 96.9 0.0969 P4.5 retina AAATAGCTGG (2) CCTTTAATCC (3) CCTTTGATCC (4) CGTGCACACA GATGTTCAAA (2) GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC GTTGAAAAAA (2) TTCATTTAGA 73.3 0.0733 P6.5 retina AAATAGCTGG (2) CCTTTAATCC (3) CCTTTGATCC (4) GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC 98.3 0.0983 P10.5 crx- retina AAATAGCTGG (2) CCTTTAATCC (3) CGTGCACACA GCAAGGAACA (4) GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC 85.5 0.0855 P10.5 crx+ retina CCTTTAATCC (3) CCTTTGATCC (4) CGTGCACACA GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC TTTGACTTTT (3) 61.4 0.0614 Adult retinal CCTTTAATCC (3) CGTGCACACA GCAAGGAACA (4) GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC GTTGAAAAAA (2) 150.2 0.1502 ONL AAATAGCTGG (2) CCTTTAATCC (3) CCTTTGATCC (4) GCAAGGAACA (4) GCTGTTCAAA (2) GTGGCTCACC TTTCCCAGAA (2) 118.7 0.1187