Mouse Retina SAGE Library

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Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

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UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.29432	2510001I10Rik	RIKEN cDNA 2510001I10 gene	5		74781
Human Homolog	DKFZP434J154[WIPI49-like protein 2]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

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SAGE Tags

Total 75 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) GCTGTAAATT TCCTGTGGGT TGCCCACCAA 62 0.062 Cb medulloblastoma CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) TCCTGTGGGT TGCCCACCAA 64.7 0.0647 P8 GC+1d culture CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) GCTGTAAATT TCCTGTGGGT TGCCACCAAG (3) 45.6 0.0456 P8 GC+SHH+1d culture CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) TCCTGTGGGT TGCCCACCAA 43.4 0.0434 3T3 fibroblasts CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) 77.1 0.0771 E15 cortex CCCCCACACA CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) 79.1 0.0791 P1 cortex CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) 163.6 0.1636 Hypothalamus CCCCCACACA CCTTTAATCC (3) TCCTGTGGGT 23.5 0.0235 E12.5 retina CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) TCCTGTGGGT TGCCCACCAA 88.3 0.0883 E14.5 retina CCTTTAATCC (3) TCCTGTGGGT 125.8 0.1258 E16.5 retina CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) TCCTGTGGGT TGCCCACCAA 79.6 0.0796 E18.5 retina CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) TCCTGTGGGT 32.7 0.0327 P0.5 retina CCCCCACACA CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) TCCTGTGGGT TGCCACCAAG (3) 86.5 0.0865 P2.5 retina CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) TCCTGTGGGT TGCCACCAAG (3) TGCCCACCAA 86.3 0.0863 P4.5 retina CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) TCCTGTGGGT 59.4 0.0594 P6.5 retina CATACAGAGC CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) TACAACCTGG TCCTGTGGGT 85 0.085 P10.5 crx- retina CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) 66.9 0.0669 P10.5 crx+ retina CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) TCCTGTGGGT 42.2 0.0422 Adult retinal CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) TACAACCTGG TCCTGTGGGT TGCCACCAAG (3) 139 0.139 ONL CATACAGAGC CCCCCACACA CCTTTAATCC (3) CTCCCTGCCC (3) GCTGTAAATT TCCTGTGGGT 99.5 0.0995