Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.295878 Csnacasein alpha 5  5 44.9 cM  12990 
 Gene Ontology extracellular | extracellular space | transport | transporter activity
 Human Homolog CSN1S1[casein alpha s1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 207 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAACATCTTC
AAATCTATGA (2)
AGAGGTGTGG
AGTGGAGGGA (2)
CATCCAGCCA
CTCAACAAGC
GAGTTTCTAA (2)
GGAAAAAAAA (2)
GTCTCCAAGG
GTTCAGCAAA (4)
TAACCTTCCC
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
123.90.1239
Cb medulloblastomaAAACATCTTC
AGACAAAGAC
AGAGGTGTGG
AGTGGAGGGA (2)
CTCAACAAGC
GAGTTTCTAA (2)
GCTTCAGCAG
GGAAAAAAAA (2)
GGCTCAGCAG
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
189.50.1895
P8 GC+1d cultureAGTGGAGGGA (2)
CAGCACGACA
GAGTTTCTAA (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGGCCCAAGC (3)
GTCAGCAAGC (2)
GTGTAGTGGG
GTTCAGCAAA (4)
TAACCTTCCC
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTTACCCT
130.90.1309
P8 GC+SHH+1d cultureAGACAAAGAC
AGCCCTGTTA (3)
AGGGTGGGTC
AGTGGAGGGA (2)
CAGCACGACA
CATCCAGCCA
GAGTTTCTAA (2)
GGAAAAAAAA (2)
GTCTCCAAGG
GTGGTGTGGG
GTTCAGCAAA (4)
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
TTCTCTATTC
TTTTTACCCT
145.30.1453
3T3 fibroblastsAAACATCTTC
AGTGGAGGGA (2)
CAGCACGACA
CTCAACAAGC
GCTCAGCAGC (2)
GTTCAGCAAA (4)
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
101.50.1015
E15 cortexCAGCACGACA
GAGTTTCTAA (2)
GGAAAAAAAA (2)
GTCAGCAAGC (2)
GTTCAGCAAA (4)
TGTAACAGGA (3)
64.20.0642
P1 cortexAGTGGAGGGA (2)
GGAAAAAAAA (2)
GTCAGCAAGC (2)
GTTCAGCAAA (4)
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
TTCTCTATTC
TTGGGTAATC
95.30.0953
HypothalamusAAACATCTTC
AGTGGAGGGA (2)
CTCAACAAGC
GAGTTTCTAA (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGCTCAGCAG
GTTCAGCAAA (4)
GTTCCAGGTA
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTCAGAAA (2)
226.30.2263
E12.5 retinaAAATCTATGA (2)
AACACCTATA
AGCCCTGTTA (3)
AGTGGAGGGA (2)
GGAAAAAAAA (2)
GTGTAGTGGG
GTTCAGCAAA (4)
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTCAGAAA (2)
135.30.1353
E14.5 retinaAAACATCTTC
AGTGGAGGGA (2)
CTCAACAAGC
GGAAAAAAAA (2)
GTCAGCAAGC (2)
GTGTAGTGGG
GTTCAGCAAA (4)
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
156.60.1566
E16.5 retinaAAATCTATGA (2)
AGCCCTGTTA (3)
AGTGGAGGGA (2)
CTCAACAAGC
GAGTTTCTAA (2)
GCTCAGCAAT
GGAAAAAAAA (2)
GGCTCAGCAG
GTCTCTCTAT
GTGGTGTGGG
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
130.20.1302
E18.5 retinaAGTGGAGGGA (2)
GAGTTTCTAA (2)
GCTTCAGCAG
GGAAAAAAAA (2)
GTTCAGCAAA (4)
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
TTCTCTATTC
198.30.1983
P0.5 retinaAACACCTATA
AGTGGAGGGA (2)
CTCAACAAGC
GAGTTTCTAA (2)
GCTCAGCAGC (2)
GCTCAGCCAG (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGCTCAGCAG
GGGCCCAAGC (3)
GTCTCCAAGG
GTTCAGCAAA (4)
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
141.60.1416
P2.5 retinaAGGGTGGGTC
GAGTTTCTAA (2)
GGAAAAAAAA (2)
GTGGTGTGGG
GTTCAGCAAA (4)
TAACCTTCCC
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
158.40.1584
P4.5 retinaCTCAACAAGC
GAGTTTCTAA (2)
GCTTCAGCAG
GGAAAAAAAA (2)
GTTCAGCAAA (4)
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
194.30.1943
P6.5 retinaAACACCTATA
AGCCCTGTTA (3)
AGGGTGGGTC
AGTGGAGGGA (2)
GAGTTTCTAA (2)
GCTCAGCAAT
GCTTCAGCAG
GGAAAAAAAA (2)
GTGGTGTGGG
GTTCAGCAAA (4)
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
171.80.1718
P10.5 crx- retinaAAACATCTTC
AGTGGAGGGA (2)
CTCAACAAGC
GAGTTTCTAA (2)
GCTTCAGCAG
GGAAAAAAAA (2)
GTGGTGTGGG
GTTCAGCAAA (4)
GTTCCAGGTA
TCTCTCTATT
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTTACCCT
247.10.2471
P10.5 crx+ retinaAAACATCTTC
AGGGTGGGTC
AGTGGAGGGA (2)
GAGTTTCTAA (2)
GGAAAAAAAA (2)
GTGGTGTGGG
GTTCAGCAAA (4)
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
TTCTCTATTC
236.30.2363
Adult retinalAAACATCTTC
AGCCCTGTTA (3)
AGTGGAGGGA (2)
GAGTTTCTAA (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGCTCAGCAG
GTCTCTCTAT
GTTCAGCAAA (4)
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
TTGGGTAATC
161.40.1614
ONLAGAGGTGTGG
AGTGGAGGGA (2)
CATCCAGCCA
CTCAACAAGC
GCTCAGCAGC (2)
GGAAAAAAAA (2)
GTTCAGCAAA (4)
TGTAACAGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
TTTTCAGAAA (2)
107.10.1071