Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.296150 D11Bwg0414eDNA segment, Chr 11, Brigham & Women's Genetics 0414 expressed 11  11 3.0 cM  76437 
 Mm.296150 Purbpurine rich element binding protein B 11    19291 
 Gene Ontology DNA binding
 Human Homolog PURB[purine-rich element binding protein B]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 112 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGTGCAGAA (4)
AAGTGCAGTA (2)
CACATAAGTA (2)
CCTGCCCTTT (3)
GAAATAAAGT (3)
GAACCTGGAC (2)
GAGAGTCAGT (2)
GTTTCTCAGG (2)
TGGGAGAACA
24.50.0245
Cb medulloblastomaAAGTGCAGAA (4)
AAGTGCAGTA (2)
CAGCTGTGTT (2)
CCTGCCCTTT (3)
GAAATAAAGT (3)
GAACCTGGAC (2)
GTTTCTCAGG (2)
55.40.0554
P8 GC+1d cultureAAGTGCAGAA (4)
AAGTGCAGTA (2)
AGACCCTACC (2)
CAGCTGTGTT (2)
CCTGCCCTTT (3)
GAAATAAAGT (3)
GTTTCTCAGG (2)
TCACTATCCA (2)
TGGGAGAACA
36.40.0364
P8 GC+SHH+1d cultureAAGTGCAGAA (4)
AAGTGCAGTA (2)
CAGCTGTGTT (2)
CCTGCCCTTT (3)
GAAATAAAGT (3)
GAACCTGGAC (2)
TGGGAGAACA
26.80.0268
3T3 fibroblastsAGTGGGAGCT (2)
CCTGCCCTTT (3)
GTTTCTCAGG (2)
140.014
E15 cortexAAGTGCAGAA (4)
TGGGAGAACA
9.80.0098
P1 cortexAAGTGCAGAA (4)
GCTTCTCAGG (2)
GTTTCTCAGG (2)
TGGGAGAACA
22.60.0226
HypothalamusAAGTGCAGAA (4)
AGTGGGAGCT (2)
CCTGCCCTTT (3)
GAAATAAAGT (3)
GCTTCTCAGG (2)
TGGGAGAACA
32.60.0326
E12.5 retinaAAGTGCAGAA (4)
CACATAAGTA (2)
GAAATAAAGT (3)
GAGAGTCAGT (2)
GCTTCTCAGG (2)
TGGGAGAACA
TTGTACTTCA (2)
90.20.0902
E14.5 retinaAAGTGCAGAA (4)
AGTGGGAGCT (2)
CAGCTGTGTT (2)
GAAATAAAGT (3)
TGGGAGAACA
85.60.0856
E16.5 retinaGAAATAAAGT (3)
TGGGAGAACA
135.90.1359
E18.5 retinaAAGTGCAGAA (4)
AAGTGCAGTA (2)
CAGCTGTGTT (2)
GAAATAAAGT (3)
TGGGAGAACA
181.80.1818
P0.5 retinaAAGTGCAGTA (2)
AGACCCTACC (2)
AGTGGGAGCT (2)
CCTGCCCTTT (3)
GAAATAAAGT (3)
GAGAGTCAGT (2)
TCACTATCCA (2)
TGGGAGAACA
137.60.1376
P2.5 retinaCCTGCCCTTT (3)
GAAATAAAGT (3)
TGGGAGAACA
181.30.1813
P4.5 retinaAAGTGCAGTA (2)
GAAATAAAGT (3)
TGGGAGAACA
150.60.1506
P6.5 retinaAAGTGCAGAA (4)
AAGTGCAGTA (2)
CAGCTGTGTT (2)
CCTGCCCTTT (3)
GAAATAAAGT (3)
TCACTATCCA (2)
TGGGAGAACA
650.065
P10.5 crx- retinaAAGTGCAGTA (2)
CACATAAGTA (2)
CAGCTGTGTT (2)
GAAATAAAGT (3)
TGGGAGAACA
53.90.0539
P10.5 crx+ retinaAAGTGCAGTA (2)
CAGCTGTGTT (2)
GAAATAAAGT (3)
GAGAGTCAGT (2)
TGGGAGAACA
42.30.0423
Adult retinalAAGTGCAGAA (4)
AAGTGCAGTA (2)
CAGCTGTGTT (2)
CCTGCCCTTT (3)
GAAATAAAGT (3)
GTTTCTCAGG (2)
TGGGAGAACA
31.70.0317
ONLAAGTGCAGAA (4)
AAGTGCAGTA (2)
CCTGCCCTTT (3)
GAAATAAAGT (3)
GAACCTGGAC (2)
GCTTCTCAGG (2)
TCACTATCCA (2)
TTGTACTTCA (2)
32.50.0325