Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.29644	2610007K22Rik	RIKEN cDNA 2610007K22 gene	15		67040
Gene Ontology	ATP binding | helicase activity | hydrolase activity
Human Homolog	DDX17[DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 17]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 202 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ACATTGAAAA CATTAAGCTG CCCAGGGCTG (2) CTCCCCGCGC GAGACAAGAG GAGGGCTGAA (3) GAGTTAACCC (3) GCAGGAGTGA (3) GCCACTGTGT (2) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTACTG GGGAAATTTC (5) GGGCCTGGCC (2) GTATAATGCT GTGGGTTCAA (2) 75.1 0.0751 Cb medulloblastoma ACATTGAAAA CCCAGGGCTG (2) CTCCCCGCGC CTGGCATTCT CTTGGCATTC GCAGGAGTGA (3) GGAAGGTGGG (3) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTACTG GGCTGTCCTG (2) GTGGGTTCAA (2) 57.6 0.0576 P8 GC+1d culture ACATTGAAAA CATCAAGGGT CATTAAGCTG CCCCCTCCCC (2) CTATGGCATT (2) CTCCCTGGAC GGCTGCTCTG (2) GGCTGTACTG GGCTGTCCTG (2) GGGAAATTTC (5) GTATAATGCT GTGGGTTCAA (2) 55.8 0.0558 P8 GC+SHH+1d culture ACATTGAAAA CATTAAGCTG CCCAGGGCTG (2) CTCCCTGGAC CTTGGCATTC GCAGGAGTGA (3) GCCACTGTGT (2) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTACTG GGCTGTCCTG (2) GGGAAATTTC (5) GGGCCTGGCC (2) GTATAATGCT GTGGGTTCAA (2) 55.1 0.0551 3T3 fibroblasts CCCAGGGCTG (2) CTCCCCGCGC GCAGGAGTGA (3) GCCACTGTGT (2) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTCCTG (2) GTGGGTTTAA 84 0.084 E15 cortex ACATTGAAAA CCCAGGGCTG (2) GGAAGGTGGG (3) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTCCTG (2) 108.8 0.1088 P1 cortex CCCCTAACAA CTCCCTGGAC GGCTGTACTG GGCTGTCCTG (2) 40.8 0.0408 Hypothalamus ACATTGAAAA CATTAAGCTG CTATGGCATT (2) GGAAATAAAG GGAAGGTGGG (3) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTACTG GGCTGTCCTG (2) GTATAATGCT GTGGGTTCAA (2) TACTGAGTGA 32.4 0.0324 E12.5 retina ACATTGAAAA CATTAAGCTG CCCAGGGCTG (2) CCCCCTCCCC (2) CTTGTGGCAT GCAGGAGTGA (3) GGAAGGTGGG (3) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTACTG GGCTGTCCTG (2) GTATAATGCT GTGGGTTCAA (2) TGTGTGGCTG 94 0.094 E14.5 retina ACATTGAAAA CCCAGGGCTG (2) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTACTG GGCTGTCCTG (2) GTGGGTTTAA 98.2 0.0982 E16.5 retina ACATTGAAAA CCCAGGGCTG (2) GCAGGAGTGA (3) GGAAGGTGGG (3) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTACTG GGCTGTCCTG (2) 79.7 0.0797 E18.5 retina ACATTGAAAA CCCAGGGCTG (2) CCCCTAACAA GGCTGCTCTG (2) GGCTGTACTG GGCTGTCCTG (2) TACTGAGTGA 52.7 0.0527 P0.5 retina ACATTGAAAA CATCAAGGGT CCCAGGGCTG (2) CCCCCTCCCC (2) CTATGGCATT (2) CTGGCATTCT GGAAGGTGGG (3) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTCCTG (2) GTGGGTTCAA (2) TACTGAGTGA TGTGTGGCTG 92.4 0.0924 P2.5 retina ACATTGAAAA CATTAAGCTG CCCAGGGCTG (2) CCCCCTCCCC (2) CCCCTAACAA GAGTTAACCC (3) GCAGGAGTGA (3) GGAAGGTGGG (3) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTACTG GGCTGTCCTG (2) GGGCCTGGCC (2) GGGCTGTCCT (2) GTATAATGCT GTGGGTTCAA (2) TACTGAGTGA TGTGTGGCTG 81.3 0.0813 P4.5 retina ACATTGAAAA CCCCCTCCCC (2) CTCCCTGGAC CTTGTGGCAT GAGACAAGAG GCAGGAGTGA (3) GGAAGGTGGG (3) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTACTG GGCTGTCCTG (2) GTGGGTTCAA (2) 73.5 0.0735 P6.5 retina ACATTGAAAA CTCCCTGGAC GGAAATAAAG GGAAGGTGGG (3) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTACTG GGCTGTCCTG (2) GTATAATGCT GTGGGTTCAA (2) TACTGAGTGA 85 0.085 P10.5 crx- retina ACATTGAAAA GCAGGAGTGA (3) GGAAGGTGGG (3) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTACTG GGCTGTCCTG (2) 44.5 0.0445 P10.5 crx+ retina ACATTGAAAA CCCAGGGCTG (2) CTCCCTGGAC GAGGGCTGAA (3) GAGTTAACCC (3) GCAGGAGTGA (3) GCCACTGTGT (2) GGAAGGTGGG (3) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTCCTG (2) GTGGGTTCAA (2) GTGGGTTTAA 61.3 0.0613 Adult retinal CATCAAGGGT CCCAGGGCTG (2) CCCCCTCCCC (2) CTCCCTGGAC CTTGGCATTC CTTGTGGCAT GGCTGCTCTG (2) GGCTGTACTG GGCTGTCCTG (2) GGGAAATTTC (5) GGGCTGTCCT (2) GTATAATGCT 91 0.091 ONL CATTAAGCTG CCCAGGGCTG (2) CCCCTAACAA CTCCCTGGAC GCAGGAGTGA (3) GGAAGGTGGG (3) GGCTGCTCTG (2) GGCTGTCCTG (2) TACTGAGTGA TGTGTGGCTG 45.9 0.0459