Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.297883 Clcn4-2chloride channel 4-2 7  7 4.0 cM  12727 
 Gene Ontology chloride transport | integral to membrane | ion channel activity | ion transport | membrane | voltage-gated chloride channel activity | voltage-gated ion channel activity
 Human Homolog CLCN4[chloride channel 4]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 182 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAAAAAA (2)
ACTTTTTTTT (2)
CTACTGTTAG
GGGCTGCTGG (2)
GGGGTGTGAA (2)
TACTATTTTC (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCCAAAAAAA (2)
TTCTTGACTT (2)
TTTAATTAGC (2)
TTTCTCAAAA
262.60.2626
Cb medulloblastomaAAAAAAAAAA (2)
ACTTTTTTTT (2)
CTACTGTTAG
GCTGAACTCT (2)
TACTATTTTC (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCCAAAAAAA (2)
TCCCAAAAAA
TCCCTGCAAA (2)
TGCAATACTT (3)
TTCTTGACTT (2)
TTTCTCAAAA
936.30.9363
P8 GC+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
ACTTTTTTTT (2)
CTACTGTTAG
GCCAGTCCAG
GGGGTGTGAA (2)
TACTATTTTC (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCCAAAAAAA (2)
TCCCTGCAAA (2)
TGCAATACTT (3)
TTCTTGACTT (2)
TTTAATTAGC (2)
TTTCTCAAAA
266.90.2669
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
GCCAGTCCAG
GGGGTGTGAA (2)
TACTATTTTC (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCCAAAAAAA (2)
TCCCTGAAAA (2)
TCCCTGCAAA (2)
TTCTTGACTT (2)
TTTAATTAGC (2)
TTTCTCAAAA
372.40.3724
3T3 fibroblastsAAAAAAAAAA (2)
GGGGTGTGAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
38.50.0385
E15 cortexAAAAAAAAAA (2)
GGGGTGTGAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
TTCTTGACTT (2)
237.40.2374
P1 cortexAAAAAAAAAA (2)
GCCAGTCCAG
TCAAAAAAAA (2)
TCCCTAAAAA (3)
TTCTTGACTT (2)
TTTAATTAGC (2)
TTTCTCAAAA
290.60.2906
HypothalamusAAAAAAAAAA (2)
ATGAGGAGTG
GCCAGTCCAG
GGGCTGCTGG (2)
GGGGTGTGAA (2)
TACTATTTTC (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCCAAAAAAA (2)
TCCCTGCAAA (2)
TTCTTGACTT (2)
TTTCTCAAAA
193.70.1937
E12.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
GGGGTGTGAA (2)
TACTATTTTC (2)
TCAAAAAAAA (2)
TTCTTGACTT (2)
TTTCTCAAAA
197.20.1972
E14.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
ACTGTGGAGG (2)
TACTATTTTC (2)
TATGTAGAAA (4)
TCAAAAAAAA (2)
TCCCAAAAAA
TTCTTGACTT (2)
TTTCTCAAAA
171.10.1711
E16.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
GCCAGTCCAG
GCTGAACTCT (2)
GGGCTGCTGG (2)
GGGGTGTGAA (2)
TACTATTTTC (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCCCTGAAAA (2)
TCCCTGCAAA (2)
TTCTTGACTT (2)
TTTAATTAGC (2)
TTTCTCAAAA
106.70.1067
E18.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
ACTGTGGAGG (2)
ATGAGGAGTG
CTACTGTTAG
GGGGTGTGAA (2)
TACTATTTTC (2)
TATGTAGAAA (4)
TCAAAAAAAA (2)
TCCAAAAAAA (2)
TCCCAAAAAA
TCCCTGCAAA (2)
TGCAATACTT (3)
TTCTTGACTT (2)
TTTCTCAAAA
478.30.4783
P0.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
ACTGTGGAGG (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCCCAAAAAA
TCCCTAAAAA (3)
TTCTTGACTT (2)
TTTCTCAAAA
168.90.1689
P2.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
CTACTGTTAG
GGGGTGTGAA (2)
TACTATTTTC (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCCAAAAAAA (2)
TTCTTGACTT (2)
TTTCTCAAAA
394.30.3943
P4.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
GGGGTGTGAA (2)
TACTATTTTC (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCCAAAAAAA (2)
TCCCTGCAAA (2)
TTCTTGACTT (2)
TTTAATTAGC (2)
TTTCTCAAAA
358.70.3587
P6.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
GGGCTGCTGG (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCCAAAAAAA (2)
TCCCTAAAAA (3)
TCCCTGAAAA (2)
TCCCTGCAAA (2)
TTCTTGACTT (2)
TTTAATTAGC (2)
TTTCTCAAAA
341.80.3418
P10.5 crx- retinaAAAAAAAAAA (2)
GGGGTGTGAA (2)
TACTATTTTC (2)
TATGTAGAAA (4)
TCAAAAAAAA (2)
TTCTTGACTT (2)
TTTCTCAAAA
87.50.0875
P10.5 crx+ retinaAAAAAAAAAA (2)
GCTGAACTCT (2)
GGGGTGTGAA (2)
TACTATTTTC (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCCCAAAAAA
TCCCTGAAAA (2)
TCCCTGCAAA (2)
TTCTTGACTT (2)
TTTCTCAAAA
138.20.1382
Adult retinalAAAAAAAAAA (2)
ATGAGGAGTG
GCCAGTCCAG
TCAAAAAAAA (2)
TCCAAAAAAA (2)
TCCCTGCAAA (2)
TGCAATACTT (3)
TTCTTGACTT (2)
TTTAATTAGC (2)
105.70.1057
ONLAAAAAAAAAA (2)
ACTTTTTTTT (2)
ATGAGGAGTG
TACTATTTTC (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCCCTAAAAA (3)
TCCCTGCAAA (2)
TTCTTGACTT (2)
TTTAATTAGC (2)
TTTCTCAAAA
141.50.1415