Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.298256 Ramp2receptor (calcitonin) activity modifying protein 2 11  11 61.5 cM  54409 
 Mm.298256 9430072K23RikRIKEN cDNA 9430072K23 gene 19    77292 
 Mm.298256 2210401K01RikRIKEN cDNA 2210401K01 gene 19    72289 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 188 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAGGGATCA (3)
AAGGCTTATT (4)
ACCTGAAGTC (3)
GCGGAATTGC (3)
GGCCTTTTGG (2)
GTGAAGATAG (3)
GTGCCAAGGT (3)
GTGGTGGTTT (3)
TAACTGACAA (4)
TGAAGAAAAA
TTAAAAAAAA (2)
TTAGGGATAG (3)
42.50.0425
Cb medulloblastomaAAAGCCCATC (3)
AAGGCTTATT (4)
ACATTATTTT (3)
ACCTGAAGTC (3)
ACTACCCAGG
GGCCTTGGGC
GTGAAGATAG (3)
GTGCCAAGGT (3)
TAACTGACAA (4)
TGAAGAAAAA
TTAAAAAAAA (2)
182.60.1826
P8 GC+1d cultureATATTTTTGT
CAATACTGCA (3)
CCCATTATTC
CTGTCTTCTG (2)
GGCCTTGGGC
GTTACCTTGA (4)
TAACTGACAA (4)
TGAAGAAAAA
TGCCATCACC
TTAAAAAAAA (2)
70.60.0706
P8 GC+SHH+1d cultureATATTTTTGT
CAGTGATGAG (3)
CCCATTATTC
CTGTCTTCTG (2)
GGCCTTGGGC
GTTACCTTGA (4)
TAACTGACAA (4)
TGCCATCACC
TGGGTTTAAA (4)
TTAAAAAAAA (2)
69.20.0692
3T3 fibroblastsAAGGCTTATT (4)
CAGGAACATT (4)
GAGCTGCTCA (5)
GCGTGGTGGA (4)
GTGCCAAGGT (3)
GTGGTGGTTT (3)
TAACTGACAA (4)
350.035
E15 cortexAAGGCTTATT (4)
AGCCAGAGAT (3)
AGTTGGAAAC (3)
GAGCTGCTCA (5)
TAACTGACAA (4)
TTAAAAAAAA (2)
49.30.0493
P1 cortexGGCCTTGGGC
GGGTGGGGAG (2)
TTAAAAAAAA (2)
22.60.0226
HypothalamusACCTGAAGTC (3)
ACTACCCAGG
AGGCCATTAC (3)
CAAAATGCTG
CTGTCTTCTG (2)
GAGCTGCTCA (5)
GCGGAATTGC (3)
TAACTGACAA (4)
TGCCATCACC
TTAAAAAAAA (2)
137.50.1375
E12.5 retinaAGGCCATTAC (3)
CAGTGATGAG (3)
CTGTCTTCTG (2)
TGCCATCACC
TGGGTTTAAA (4)
TTAAAAAAAA (2)
20.80.0208
E14.5 retinaAAAGCCCATC (3)
AAAGGGATCA (3)
ATATTTTTGT
GGGTGGGGAG (2)
TGCCATCACC
TTAAAAAAAA (2)
29.10.0291
E16.5 retinaACATTATTTT (3)
AGCCAGAGAT (3)
ATATTTTTGT
CCCATTATTC
CTGTCTTCTG (2)
GCGTGGTGGA (4)
GGCCTTGGGC
GTTACCTTGA (4)
TAACTGACAA (4)
TGCCATCACC
TTAAAAAAAA (2)
43.30.0433
E18.5 retinaAAAGGGATCA (3)
AAGGCTTATT (4)
ACTACCCAGG
AGTTGGAAAC (3)
CTGTCTTCTG (2)
GTGAAGATAG (3)
GTGCCAAGGT (3)
GTTACCTTGA (4)
TAACTGACAA (4)
TGAAGAAAAA
TGCCATCACC
TTAAAAAAAA (2)
81.70.0817
P0.5 retinaAAAGGGATCA (3)
AGCCAGAGAT (3)
AGGCCATTAC (3)
AGTTGGAAAC (3)
ATATTTTTGT
CCCATTATTC
CTGTCTTCTG (2)
GCGGAATTGC (3)
GCGTGGTGGA (4)
GGCCTTTGGC (3)
TAACTGACAA (4)
TGCCATCACC
TTAAAAAAAA (2)
51.20.0512
P2.5 retinaAAAGGGATCA (3)
AAGGCTTATT (4)
ACCTGAAGTC (3)
CAAAATGCTG
CAATACTGCA (3)
GGCCTTTGGC (3)
GGGTGGGGAG (2)
TAACTGACAA (4)
TGCCATCACC
TTAAAAAAAA (2)
72.40.0724
P4.5 retinaAAAGGGATCA (3)
AAGGCTTATT (4)
ACCTGAAGTC (3)
GCGGAATTGC (3)
GTGAAGATAG (3)
GTGGTGGTTT (3)
TAACTGACAA (4)
TGCCATCACC
TTAAAAAAAA (2)
105.10.1051
P6.5 retinaAAAGCCCATC (3)
AAAGGGATCA (3)
AAGGCTTATT (4)
ACCTGAAGTC (3)
AGCCAGAGAT (3)
AGTTGGAAAC (3)
CAATACTGCA (3)
GGCCTTTGGC (3)
TAACTGACAA (4)
TGCCATCACC
TTAAAAAAAA (2)
TTAGGGATAG (3)
50.20.0502
P10.5 crx- retinaAAAGGGATCA (3)
AAGGCTTATT (4)
ACTACCCAGG
CAGGAACATT (4)
CCCATTATTC
CTGTCTTCTG (2)
GAGCTGCTCA (5)
GGCCTTGGGC
GTGCCAAGGT (3)
GTGGTGGTTT (3)
TGGGTTTAAA (4)
TTAAAAAAAA (2)
48.50.0485
P10.5 crx+ retinaAAAGCCCATC (3)
AAAGGGATCA (3)
AAGGCTTATT (4)
ACATTATTTT (3)
ACCTGAAGTC (3)
CAGTGATGAG (3)
GGCCTTTTGG (2)
TAACTGACAA (4)
TGCCATCACC
TTAAAAAAAA (2)
TTAGGGATAG (3)
440.044
Adult retinalAAAGCCCATC (3)
AAAGGGATCA (3)
ACATTATTTT (3)
AGTTGGAAAC (3)
CTGTCTTCTG (2)
GCGGAATTGC (3)
TAACTGACAA (4)
TGCCATCACC
TTAAAAAAAA (2)
35.40.0354
ONLAAAGGGATCA (3)
ACATTATTTT (3)
ACCTGAAGTC (3)
AGGCCATTAC (3)
GCGGAATTGC (3)
TAACTGACAA (4)
TGCCATCACC
TTAAAAAAAA (2)
30.60.0306